exoRBase由云生物平臺協(xié)助復(fù)旦大學(xué)上海**研究所黃勝林研究員團(tuán)隊構(gòu)建,該數(shù)據(jù)庫于2018年1月發(fā)表在NucleicAcidsResearch雜志,文章題為:exoRBase:adatabaseofcircRNA,lncRNAandmRNAinhumanbloodexosomes。exoRBase是人類血液外泌體的RNA-seq數(shù)據(jù)分析的circRNA、LncRNA和mRNA的存儲庫,還包括已發(fā)表文獻(xiàn)的實驗驗證。exoRBase對標(biāo)準(zhǔn)化RNA-seq數(shù)據(jù)的RNA表達(dá)譜進(jìn)行了整合和可視化,數(shù)據(jù)涵蓋了正常個體和不同疾病患者。數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址:。exoRBase數(shù)據(jù)庫收集和描述人類血液外泌體中所有長的RNA,目前包含58330個circRNA、15501個LncRNA和18333個mRNA,提供了注釋、表達(dá)水平和可能的來源組織,數(shù)據(jù)庫將定期更新,提供更多的外泌體RNA信息。數(shù)據(jù)庫收錄的樣本包括健康對照者32例,冠狀動脈心臟疾?。–HD)6例,結(jié)腸*(CRC)12例,肝細(xì)胞*(HCC)21例,胰腺腺*(PAAD)14例,乳腺*2例。所有收集到的數(shù)據(jù)都經(jīng)過相同的預(yù)處理。除此之外,還分析了LncRNA和mRNA在人類組織中的組織特異性,以及circRNA的來源等。 血漿樣品抽提外泌體需要提供多少量?江蘇粒徑外泌體售后服務(wù)
有些研究證明外泌體miRNA的表達(dá)水平在不同生理條件下是會變化的。在健康人血清外泌體中,miR-21的水平比那些惡性膠質(zhì)瘤患者更低。在非小細(xì)胞肺*患者血漿囊泡中,let-7f,miR-20b和miR-30e-3p的水平比正常對照組更低。在良性**和卵巢*中,發(fā)現(xiàn)了八種外泌體miRNA的表達(dá)水平不同,包括miR-21和miR141。以上研究都表明外泌體的來源細(xì)胞有一種分揀機制來指導(dǎo)特異性的miRNA進(jìn)入外泌體。根據(jù)前人的研究,存在一種類型的miRNA,它們更偏好于被裝入外泌體,如miR-320和miR-150。miR-320家族***分布于正常組織和**分泌的外泌體中。miR-150在HEK293T細(xì)胞株、**患者的外周血、集落刺激因子-1誘導(dǎo)的骨髓來源的巨噬細(xì)胞和結(jié)腸*患者血清中的外泌體中都有高表達(dá)。而且,一些miRNA,如miR-451,在正常細(xì)胞來源的外泌體中高表達(dá),如HMC-1細(xì)胞株、HEK293T細(xì)胞株和初級T淋巴細(xì)胞。還有一些miRNA,如miR-214和miR-155,在**細(xì)胞株來源的和**患者外周血的外泌體中含量豐富。 浙江粒徑外泌體要多少錢細(xì)胞上清的外泌體怎么制備?
外泌體內(nèi)包含多種不同分子,如蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、DNA、mRNA和miRNA,其中miRNA受到**多的關(guān)注,由于它們在基因表達(dá)調(diào)控上有著重要作用。Goldieetal.發(fā)現(xiàn)在所有的小RNA中,miRNA在外泌體中所占的比例比它們的來源細(xì)胞更高。有證據(jù)顯示,miRNA并不是隨機整合入外泌體中的。Guduric-Fuchsetal.分析了許多不同細(xì)胞系和它們各自分泌的外泌體中miRNA的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)一些miRNA亞群,如miR-150,miR-142-3p,miR-451更偏好于進(jìn)入外泌體。類似的是,Ohshimaetal.比較了不同*細(xì)胞株分泌的外泌體中的let-7miRNAfamilymembers的表達(dá)水平,將胃*細(xì)胞株AZ-P7a的外泌體與其他細(xì)胞株如肺*細(xì)胞株SBC-3/DMS-35/NCI-H69,結(jié)直腸*細(xì)胞株SW480/SW620和胃*細(xì)胞株AZ-521的外泌體中的let-7miRNA家族的表達(dá)水平。結(jié)果是,他們發(fā)現(xiàn)let-7miRNA家族在胃*細(xì)胞株AZ-P7a分泌的外泌體中較豐富,但是不如其他細(xì)胞株中含量多。
Kalluri說,由于在這些外泌體中可以檢測出胰腺*特異性的遺傳特征,其有著極大的潛力提高M(jìn)RI或CT的特異性。
如果能夠早期檢測到**,就可以采用胰十二指腸切除術(shù)來***胰腺*患者。由于胰腺*確診時常常已到晚期,只有15%的患者適合于接受手術(shù)。
Kalluri說:“一些研究比較了疾病階段和手術(shù)后的結(jié)果,表明如果能夠在較早期診斷這一疾病就可以降低胰腺*的死亡率。這為早期檢測胰腺*以及設(shè)計出潛在的***手術(shù)方案提供了一個前所未有的機會?!?腦脊液抽提外泌體需要提供多少量?
目前,外泌體研究主要集中在以下幾個方向:開發(fā)疾病診斷和預(yù)后標(biāo)志物揭示疾病發(fā)病機制作為藥物載體,實現(xiàn)靶向給藥作為疾病***的靶點參與免疫反應(yīng)調(diào)控。外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù):云生物根據(jù)主流外泌體研究策略,開發(fā)了一套完整的外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)服務(wù)體系。提供從外泌體收集、鑒定到蛋白質(zhì)組定性定量、數(shù)據(jù)分析一系列的技術(shù)服務(wù)項目,確保外泌體研究在同樣技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)下獲得高質(zhì)量研究數(shù)據(jù)。外泌體收集:對于外泌體研究,分離和收**格的外泌體是非常關(guān)鍵的一步。目前對于外泌體收集有:超速離心、密度梯度離心、超濾、磁珠免疫、聚合物沉淀與試劑盒提取法等幾種主要方法,各種方法均存在不同優(yōu)缺點。云生物在現(xiàn)有試劑盒法的基礎(chǔ)上進(jìn)行大量技術(shù)優(yōu)化,形成了一套針對不同樣品的外泌體提取試劑盒和配套收集方法。可以在提高外泌體收集豐度的同時,***減少雜蛋白殘留,以保證蛋白質(zhì)組分析階段獲得的數(shù)據(jù)更加穩(wěn)定和可靠。 云生物專業(yè)致力于外泌體服務(wù)。浙江粒徑外泌體要多少錢
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UR51102外泌體**培養(yǎng)基。UR52121適用于細(xì)胞上清(尿液),可提取400ml細(xì)胞上清液。UR52126適用于尿液,可提取500ml尿液。UR52131適用于血清血漿,可提取20ml,應(yīng)用于蛋白方向CHEM COMMUN-IF=6.2-糖基化-UR52136。UR52136適用于血清血漿,可提取30ml,應(yīng)用于RNA方向。UR52141適用于提取體液,可提取60mlJ CELL MOL MED-IF=4.7-睪丸損傷-UR52101。UR52111適用于細(xì)胞上清液/尿液中外泌體的濃縮J CELL PHYSIOL-IF=4.5-白血病-UR52121。UR90102試劑盒配套純化柱。UR52301適用于外泌體CD63和TSG101蛋白的檢測。UR52302適用于外泌體的標(biāo)記染色實驗,監(jiān)測細(xì)胞吞噬作用。UR52303適用于外泌體的標(biāo)記染色實驗,監(jiān)測細(xì)胞吞噬作用。UR21017適用于***成像和示蹤FRONT。UR33101適用于高效裂解外泌體蛋白,也可用于細(xì)胞裂解。UR52135適用于血清血漿,可提取5ml,應(yīng)用于 RNA 方向。UR52130適用于血清或血漿,可提取6m。UR52100適用于細(xì)胞上清或者尿液,可提取100ml。UR52101適用于所有樣本CANCER。
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