福建空間轉錄組使用

 空間轉錄組學(ST)是一種方法，允許在組織樣本中可視化和定量分析轉錄組與空間分辨率。通過在載玻片上排列含有位置條形碼的寡核苷酸的組織切片，該方法聲稱可以生成具有精確位置信息的高質量的RNA-seq cDNA文庫。條形碼芯片有1007個帶有獨特條形碼序列的引物位點。每個位置都有一個直徑100μm(對應于一個組織域)中心到中心的距離是200μm。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，在空間轉錄組樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。盡管前傳時代的空間技術被迅速棄用，但其思想和方法是當今時代空間轉錄組學發(fā)展的基礎。福建空間轉錄組使用

基于原位測序的空間轉錄組技術?；谠粶y序（ISS）的方法通過測序產生空間轉錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環(huán)化和RCA擴增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測序，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針?；贗SS技術的優(yōu)勢包括：單細胞分辨率、亞細胞轉錄物定位和可應用于更大的組織區(qū)域。缺點是：檢測效率較低。重慶歐易生物空間轉錄組質量空間轉錄組組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學信息。

一些實現空間轉錄組學的重要技術，**早可以追溯到二十世紀七十年代，長期以來，各種形式的原位雜交技術（ISH）已用于可視化空間中的基因表達。從技術原理中不難看出，空間轉錄組技術**為特殊的載玻片。ISS 方法通常通過基于連接（SBL）或者基于合成（SBS） 的原位測序， 確定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段，**終獲得空間轉錄組信息。根據測序鏈接策略的不同（SOLiD，cPAL和SEDAL），基于 SBL 的原位測序技術方法的代表性技術分別為 FISSEQ，ISS，STARmap。

1. 10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前可選的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息?？臻g轉錄組是一項前沿技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗?？臻g轉錄組測序技術在進行 HE 染色的同時需要保證獲取組織基因表達信息。

空間轉錄組的應用有哪些？一、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續(xù)會在如下專輯更新）。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍圖：胚胎發(fā)育是一個復雜的過程，其中動態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預期使用空間轉錄組學技術可以表征胚胎發(fā)育的空間表達藍圖。Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉錄組解析人鱗狀細胞*的文章。吉林歐易生物空間轉錄組質量

10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉錄組測序技術。福建空間轉錄組使用

什么是空間轉錄組？空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數據的技術，從而解析單個組織切片中的所有mRNA?？臻g條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序，均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息，為研究和診斷提供有效數據支撐。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。福建空間轉錄組使用

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實現***管理的追求。歐易生物深耕行業(yè)多年，始終以客戶的需求為向導，為客戶提供***的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。歐易生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現成對用戶產品上的貼心，為用戶帶來良好體驗。歐易生物創(chuàng)始人張怡，始終關注客戶，創(chuàng)新科技，竭誠為客戶提供良好的服務。