空間基因表達技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時，多方位測量轉(zhuǎn)錄組譜。然而，現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發(fā)了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預處理數(shù)據(jù)作為輸入，無縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中，該對象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置轉(zhuǎn)錄信息，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量
轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取，目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報道， 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術(shù)，通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本，并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來，其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù)，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置。云南歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用空間轉(zhuǎn)錄組樣本的組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列。
空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當今前沿的科研技術(shù)，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學培訓班”落下帷幕。培訓中，歐易講師團隊以其豐富的項目經(jīng)驗及專業(yè)的生信能力，從空間轉(zhuǎn)錄組學的發(fā)展歷程、測序原理、實驗實操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度，向遠道而來的學員們展開了系統(tǒng)性的培訓。
空間轉(zhuǎn)錄組是在組織原位檢測基因表達的一種技術(shù)，與bulk RNA-seq或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相比，空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失，使得我們在檢測基因表達的同時獲得基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。正是由于空間轉(zhuǎn)錄組可以從多維度解析生物學過程的特點，近年來關于空間轉(zhuǎn)錄組無論是在技術(shù)開發(fā)，還是大規(guī)模應用或商業(yè)化，都得到蓬勃發(fā)展。例如2019年4月，Science發(fā)文通過空間轉(zhuǎn)錄組揭示ALS（肌萎縮側(cè)索硬化癥，又稱漸凍癥）分子病理的時空動態(tài)；2019年8月，Nature在線發(fā)表了景乃禾團隊解析小鼠早期胚胎細胞的時空表達數(shù)據(jù)；2020年9月，Cell上發(fā)表了一篇利用空間轉(zhuǎn)錄組解析人鱗狀細胞*的文章；2021年1月，Science發(fā)表了將組織擴展和原位RNA測序結(jié)合起來的新型空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)ExSeq；2021年4月，10x Genomics公司宣布了新一代FFPE空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化解決方案。在未來的5-10年里，空間轉(zhuǎn)錄組學妥妥的是技術(shù)熱點。
和單細胞轉(zhuǎn)錄組一樣，空間轉(zhuǎn)錄組也可以進行細胞間通訊分析，區(qū)別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。通常通過了解配體受體（LR）對并測試 LR 對是否更有可能在鄰近細胞或 spot 中表達來完成。還有很多其他類型的分析可用于空間轉(zhuǎn)錄組學數(shù)據(jù)，包括基因模式的識別，空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組定義， 基因間的相互作用推斷，轉(zhuǎn)錄本的亞細胞定位以及基于H＆E圖像的基因表達估算等。1. 歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉(zhuǎn)錄組細胞通訊分析方法簡介及實操。安徽空間轉(zhuǎn)錄組使用
空間轉(zhuǎn)錄組學和 10X Visium 依靠這種微陣列技術(shù)，區(qū)別在于微陣列載玻片上的組織上的轉(zhuǎn)錄本信息。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量
空間轉(zhuǎn)錄組的應用有哪些？一、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質(zhì)性：同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學問題。在不同的環(huán)境下，明智地選擇這些方法在生物學研究中也是至關重要的，例如在神經(jīng)科學中，基于FISH的方法很普遍；基于LCM的方法適用于小樣本（例如臨床樣本）以及整個轉(zhuǎn)錄組或基因組分析。二、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉(zhuǎn)錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù)，得到多個***的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜（相關研究后續(xù)會在如下專輯更新）。10x空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司是一家服務型類企業(yè)，積極探索行業(yè)發(fā)展，努力實現(xiàn)產(chǎn)品創(chuàng)新。是一家私營合伙企業(yè)企業(yè)，隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求，與多家企業(yè)合作研究，在原有產(chǎn)品的基礎上經(jīng)過不斷改進，追求新型，在強化內(nèi)部管理，完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時，良好的質(zhì)量、合理的價格、完善的服務，在業(yè)界受到寬泛好評。以滿足顧客要求為己任；以顧客永遠滿意為標準；以保持行業(yè)優(yōu)先為目標，提供***的科研服務，科研檢測，學術(shù)研究，技術(shù)咨詢。歐易生物將以真誠的服務、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品，為彼此贏得全新的未來！