歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-01

Visium空間轉(zhuǎn)錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么?10X Genomics測(cè)試過(guò)很多組織類型,絕大多數(shù)都可以用于空間轉(zhuǎn)錄組的分析。下圖是他們官網(wǎng)上測(cè)試過(guò)的組織類型的列表,測(cè)試過(guò)的組織都可以運(yùn)用在空間轉(zhuǎn)錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達(dá)玻片做正式實(shí)驗(yàn)前,務(wù)必用組織優(yōu)化的玻片測(cè)試一下,看組織能否用于空間轉(zhuǎn)錄組的實(shí)驗(yàn),同時(shí)也找到比較好的組織通透時(shí)間。切片厚度基本上以10μm為主,但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開(kāi)展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

空間轉(zhuǎn)錄組研究的的必要性。研究單細(xì)胞我們想要探究細(xì)胞間的異質(zhì)性,但是常規(guī)的單細(xì)胞是將細(xì)胞解離成單細(xì)胞懸液,然后利用單細(xì)胞分離技術(shù)(微孔,微板,液滴)等方法實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞建庫(kù),這里比較大的問(wèn)題是是細(xì)胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個(gè)空間信息在實(shí)際研究中有很重要。特別是在研究細(xì)胞命運(yùn)機(jī)制及細(xì)胞譜系發(fā)生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發(fā)展空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的位置信息的保留,對(duì)研究此類細(xì)胞狀態(tài)尤為必要。上海品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組scRNA-seq 技術(shù)的進(jìn)步啟發(fā)了利用高分辨率轉(zhuǎn)錄組定量分析與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的互補(bǔ)性質(zhì)的新方法。

許多當(dāng)前時(shí)代空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的基礎(chǔ)都是在自七十年代以來(lái)的幾十年間建立的。例如,于1976 年首先使用紫外線激光來(lái)切割組織。當(dāng)前流行的技術(shù),例如空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)和 10X Visium 依靠這種微陣列技術(shù),區(qū)別就在于是從放置在微陣列載玻片上的組織上而不是從溶液中來(lái)捕獲轉(zhuǎn)錄本信息。當(dāng)前時(shí)代的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)大致分為五類方向:激光顯微切割(LCM),單分子熒光原位雜交(smFISH),靶向原位測(cè)序(ISS),原位陣列捕獲和 其他非成像技術(shù)。

空間轉(zhuǎn)錄組的一般流程2。這使得在后續(xù)步驟中覆蓋細(xì)胞組織圖像和基因表達(dá)數(shù)據(jù)成為可能。用我們的滲透試劑對(duì)組織進(jìn)行滲透,這意味著在細(xì)胞膜上形成小孔。RNA分子可以通過(guò)這些通道離開(kāi)細(xì)胞,并與芯片上相鄰的捕獲探針結(jié)合。因此,基因表達(dá)信息被捕獲在芯片上。需要通過(guò)以下步驟將捕獲的RNA分子中存儲(chǔ)的信息轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù)。cDNA合成是為了創(chuàng)造穩(wěn)定的雙鏈DNA分子。這是必要的,因?yàn)閏dna - rna -雜交體的降解速度很快。此外,這是構(gòu)建可測(cè)序文庫(kù)之前的必要步驟。所有之前收集的信息都被匯集起來(lái),可以在線訪問(wèn)。這意味著在實(shí)踐中,您可以查看組織切片的圖像并選擇組織中的不同區(qū)域。然后你可以確定哪些基因在這些區(qū)域中以什么數(shù)量表達(dá)。因此,你可以在一個(gè)單一的實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行新分析??臻g轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)前沿技術(shù),涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作。

10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個(gè)被條形碼標(biāo)記的點(diǎn)(barcoded spots),每個(gè)點(diǎn)的直徑為55 μm,點(diǎn)和點(diǎn)之間中心的距離為100 μm,并且每個(gè)點(diǎn)都有一個(gè)barcode序列。組織切片的細(xì)胞中會(huì)釋放出mRNA,遷移到每個(gè)spot的mRNA會(huì)被標(biāo)記上相應(yīng)的barcode序列,然后進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建并進(jìn)行測(cè)序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,以確定哪些數(shù)據(jù)來(lái)自哪個(gè)位置,從而實(shí)現(xiàn)空間基因表達(dá)的可視化。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)高效的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。了解空間轉(zhuǎn)錄組樣本準(zhǔn)備注意事項(xiàng)。上海品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組

在未來(lái)的5-10年里,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)妥妥的是技術(shù)熱點(diǎn)。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

隨著科學(xué)技術(shù)發(fā)展,醫(yī)藥冷鏈物流技術(shù)不斷涌現(xiàn),同時(shí)在我國(guó)高度重視下,冷鏈物流標(biāo)準(zhǔn)逐漸完善。但我國(guó)醫(yī)藥健康仍存在體系不完善、物流成本高和技術(shù)、設(shè)施落后的問(wèn)題。在市場(chǎng)機(jī)遇與現(xiàn)存問(wèn)題面前,如何把握醫(yī)藥健康未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)顯得尤為重要。根據(jù)科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢相關(guān)領(lǐng)域極新技術(shù)發(fā)展趨勢(shì),《2019年本》在鼓勵(lì)類條目中新增了新型技術(shù)開(kāi)發(fā)和應(yīng)用的有關(guān)內(nèi)容。例如,在化學(xué)原料藥領(lǐng)域增加了“連續(xù)反應(yīng)”等技術(shù),在技術(shù)領(lǐng)域增加了“基因醫(yī)治”和“抗體偶聯(lián)”等技術(shù),在藥用包裝材料領(lǐng)域增加了“中性硼硅藥用玻璃”等新型材料與技術(shù)的開(kāi)發(fā)應(yīng)用,在醫(yī)藥領(lǐng)域增加了“人工智能輔助醫(yī)藥設(shè)備”等新技術(shù)內(nèi)容。隨著西方健康服務(wù)理念的進(jìn)入及國(guó)內(nèi)需求市場(chǎng)的飛速增長(zhǎng),國(guó)內(nèi)以體檢為重點(diǎn)的私營(yíng)合伙企業(yè)得到了飛速發(fā)展,尤其是近年來(lái),健康服務(wù)機(jī)構(gòu)飛速發(fā)展。盡管中國(guó)老年健康服務(wù)目前仍處于初始發(fā)展階段,但近年來(lái)我國(guó)出臺(tái)了一些扶持政策,市場(chǎng)空間逐漸打開(kāi)。加之檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。“兩票制”壓縮流通渠道層級(jí),減少中間環(huán)節(jié)層層加價(jià);反商業(yè)賄賂、稅務(wù)改進(jìn)等一系列政策的落地,迫使產(chǎn)業(yè)從不規(guī)范、低水平的商業(yè)化向規(guī)范的、高水平成熟的商業(yè)化進(jìn)化。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。歐易生物作為檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的企業(yè)之一,為客戶提供良好的科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。歐易生物創(chuàng)始人張怡,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶提供良好的服務(wù)。