廣東空間代謝組學 書籍

1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死（處理組，3只），對照組大鼠（3只）也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦，在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片（暴露出海馬和紋狀體），用于Nissl染色、H&E染色和質譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析，代謝物質量數(shù)范圍50-500Da，質譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉化，再使用自建MassImager軟件獲取成像結果；在獲取差異代謝物的高分辨率質譜信息后，使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠（rattusnorvegicus）為參考完成代謝物高通量定性，并輸出代謝網(wǎng)絡信息。大腦中復雜網(wǎng)絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。空間代謝組分析測序服務。廣東空間代謝組學 書籍

如空間代謝組。研究中開發(fā)了一種新的基于拉曼光譜和空間代謝組學分析的脂質組學(HSL)成像策略，用于分子表征和定量再髓鞘形成，并通過特定髓鞘蛋白的免疫標記進行了驗證。利用拉曼和空間代謝組學數(shù)據(jù)生成了分子成像圖譜，用于體外組織的生物分子結構和組成的關聯(lián)。將相關脂質組成像方法應用于局灶性脫髓鞘小鼠模型和多發(fā)性硬化癥死后腦標本的髓鞘再分化研究。發(fā)現(xiàn)不僅在脫髓鞘腦組織和正常腦組織之間，在有髓鞘組織和正常有髓組織之間，脂質成分皆存在差異。湖南空間代謝組學的質譜成像定量和定位分析，結合生物信息學分析，發(fā)展為空間代謝組學方法。

AFADESI-MSI空間代謝組學：1、已落地執(zhí)行項目100+，其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。高準性的定性算法通過物質表達空間情況、加和離子及同位素峰表達強度相似性、同位素表達空間分布相似性進行初步代謝物注釋，并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫或非靶質譜數(shù)據(jù)基礎上在初步注釋結果基礎上進一步獲得更加準確定性的結果。已形成心、肝、腦等多個組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。

以上結果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡圖要了解大腦的結構區(qū)域發(fā)生的復雜代謝過程，不僅應準確表征代謝物，還要研究其相關性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡重建。從15個微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進行峰挑選和峰對齊（圖1F），包括松果體、中腦導水管、腦橋、梨狀皮質、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。歐易生物空間代謝組學為廣大研究者提供一站式服務。

空間代謝組學探究MYC、SREBP1與**發(fā)生的能量機制探索。斯坦福大學Dean W. Felsher課題組在Cell Metabolism發(fā)表的題為“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果，通過空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術研究*基因MYC促進**發(fā)生機制，發(fā)現(xiàn)MYC與膽固醇調節(jié)元件結合蛋白（SREBP1）協(xié)同調節(jié)脂質生成，從而促進疾病的發(fā)生。中文標題：MYC*基因與固醇調節(jié)元件結合蛋白協(xié)同調節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象：小鼠空間代謝組性價比高.擁有專業(yè)技術團隊。重慶空間代謝組學在植物葉片

空間分辨代謝組學進展和挑戰(zhàn)。廣東空間代謝組學 書籍

隊列1：收集手術切除的食管腺*（EA）組織和與之匹配的健康食管上皮組織（MHEE）。隊列2：收集健康食管上皮組織（來自健康志愿者，HEE）和未經(jīng)***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活檢樣本，用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進程中甘油磷脂的變化，以及隊列1的外部驗證。樣本制備：樣本制成冰凍組織切片，并結合H&E染色。研究方法：空間代謝組學；qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達；細胞轉染沉默ACYL基因；免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達。廣東空間代謝組學 書籍

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