水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù):2021 年 10 月 12 日,中國科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心王二濤研究員為通訊作者,在 Cell 上發(fā)表了題為“A phosphate starvation response-centered network regulates mycorrhizal symbiosis”的封面論文。文章***報道了水稻-叢枝菌根共生轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)植物直接營養(yǎng)吸收途徑與通過叢枝菌根共生的間接營養(yǎng)吸收途徑均受到磷信號網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)一調(diào)控,回答了菌根共生領(lǐng)域“自我調(diào)節(jié)”這一困擾領(lǐng)域的重要科學(xué)問題。分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心博士后石進彩為***作者,歐易生物肖云平也參與了此項研究。文章中水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù)由歐易生物提供。酵母單雜交/雙雜交文庫構(gòu)建簡述酵母雙雜交。遼寧歐易生物酵母文庫
目前,歐易生物負責(zé)該水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫的維護和保存工作,并對廣大水稻科研工作者提供轉(zhuǎn)錄因子篩選服務(wù)。如去年歐易生物助力中國科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心的王二濤老師應(yīng)用該文庫對水稻-叢枝菌根進行了深入研究,成功構(gòu)建了水稻-叢枝菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),結(jié)果發(fā)表于《Cell》封面。截至文章發(fā)表,該文庫已收錄了1683個水稻轉(zhuǎn)錄因子,隸屬于54個家族,覆蓋預(yù)測的水稻轉(zhuǎn)錄因子總量的70%。文庫中水稻轉(zhuǎn)錄因子的a基因信息來源于PlantTFDB和KOME數(shù)據(jù)庫。文庫載體使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一個轉(zhuǎn)錄因子菌株**保存于96孔板中。北京酵母文庫多少錢酵母結(jié)構(gòu)及功能介紹酵母的應(yīng)用 。
本研究利用水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選,繪制了水稻轉(zhuǎn)錄因子和菌根共生相關(guān)基因之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該網(wǎng)絡(luò)受到保守的磷感應(yīng)途徑統(tǒng)一控制,以磷酸鹽饑餓響應(yīng)因子(PHR)為中心。PHRs 是菌根共生所必需的,通過 P1BS 順式作用元件調(diào)控菌根共生相關(guān)基因表達。高磷條件下,SPX蛋白抑制 OsPHR2 介導(dǎo)的對菌根共生相關(guān)基因表達的調(diào)控,進而抑制菌根共生。過表達 OsPHR2 可以部分拮抗磷介導(dǎo)的對菌根共生的抑制作用。本研究發(fā)現(xiàn),植物直接營養(yǎng)吸收和通過菌根共生的間接營養(yǎng)吸收,都受到相同的磷信號網(wǎng)絡(luò)統(tǒng)一調(diào)控。本研究將有助于高效用磷植株的培育。
酵母雙雜交還可以這么用?Y2H-seq 揭示不老松年齡。***小歐又給大家?guī)砹艘黄湍鸽p雜交結(jié)合高通量測序技術(shù)的應(yīng)用文章。北京林業(yè)大學(xué)鈕世輝老師團隊,在傳統(tǒng)的酵母雙雜交技術(shù)流程基礎(chǔ)上,巧妙的結(jié)合了NGS技術(shù),優(yōu)化建立了Y2H-seq技術(shù),**縮短了常規(guī)的篩庫后測序驗證周期,節(jié)約了實驗成本。文章中應(yīng)用Y2H-seq技術(shù),對不老松年齡密碼進行了有趣的研究,其中所用酵母雙雜交文庫由歐易生物協(xié)助完成。眾所周知,酵母雙雜交技術(shù)是研究蛋白相互作用的利器。目前已知的蛋白質(zhì)相互作用至少有一半是通過酵母雙雜交技術(shù)發(fā)現(xiàn)的。但是做過酵母雜交實驗的小伙伴也都知道蛋白篩選較容易,但是篩選后,想知道獲得的陽性克隆都對應(yīng)的是啥基因,所花費的人力物力相當(dāng)不小。有困難解決困難,勇敢牛牛不怕困難。歐易生物酵母文庫項目發(fā)表 Science 封面文章歐易生物。
酵母單雜交結(jié)果顯示,磷酸鹽饑餓響應(yīng)因子OsPHR1/2/3可以***51個目標(biāo)啟動子中的25個,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以調(diào)控許多菌根共生相關(guān)基因的表達(圖A)。對叢枝菌根共生響應(yīng)基因啟動子序列預(yù)測分析顯示,有78個轉(zhuǎn)錄因子被富集,87%的菌根共生響應(yīng)基因受到OsPHR1/2/3的調(diào)控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接調(diào)控。因此推測OsPHR1/2/3可能是菌根共生調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的一個關(guān)鍵調(diào)控樞紐(圖A-B)。EMSA和熒光素酶報告實驗證實,OsPHR12可以直接結(jié)合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3啟動子序列(圖C-F),并且這種結(jié)合依賴于啟動子中的P1BS元件(圖G)。酵母文庫 技術(shù)服務(wù)歐易生物分子互作一站式服務(wù)。吉林運用酵母文庫
酵母單雜篩庫酵母文庫篩選酵母雙雜交篩庫步驟。遼寧歐易生物酵母文庫
酵母文庫實驗由歐易生物完成。6.902)在線發(fā)表了題為“MKK4-MPK3-WRKY17-mediated salicylic acid degradation increases susceptibility to Glomerella leaf spot in apple”的研究論文,報道了一個蘋果炭疽葉枯病易感相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子 MdWRKY17,并對其作用機制進行了詳細探討。蘋果是世界上頗受歡迎的水果。蘋果炭疽葉枯病(Glomerellaleafspot,GLS)在我國多次爆發(fā),是蘋果相當(dāng)有毀滅性的***病害之一,嚴(yán)重影響蘋果質(zhì)量和產(chǎn)量。但目前在蘋果中尚未鑒定出GLS的抗性基因。遼寧歐易生物酵母文庫
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