湖南應(yīng)用酵母文庫做什么

來源: 發(fā)布時間:2023-03-20

酵母雜交試驗:隨著分子生物學(xué)研究進入以蛋白質(zhì)組學(xué)為標(biāo)志的后基因組時代,蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-DNA相互作用已成為互作組學(xué)研究的熱門主題。人類基因粗略約編碼2萬種蛋白,只算一對一的相互作用種類也有12萬到100萬種。而加上動態(tài)變化,每個物種、個體、細(xì)胞中都存在著一張張不同的互作網(wǎng)絡(luò)圖,這一張張圖譜中,蘊藏著各種生命的奧秘。有兩種通用的相互作用組圖譜繪制方式:第一種酵母雜交試驗,通過偶聯(lián)基因表達(dá)體現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)發(fā)生直接相互作用的蛋白對。第二種是通過抗體/標(biāo)簽分離純化復(fù)合體,然后用質(zhì)譜鑒定復(fù)合體內(nèi)部組分,識別直接相互作用或間接相互作用的蛋白質(zhì)。兩種高通量方法彼此互補,相互驗證。酵母文庫質(zhì)量檢測酵母基因功能鑒定。湖南應(yīng)用酵母文庫做什么

酵母單雜交結(jié)果顯示,磷酸鹽饑餓響應(yīng)因子OsPHR1/2/3可以***51個目標(biāo)啟動子中的25個,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以調(diào)控許多菌根共生相關(guān)基因的表達(dá)(圖A)。對叢枝菌根共生響應(yīng)基因啟動子序列預(yù)測分析顯示,有78個轉(zhuǎn)錄因子被富集,87%的菌根共生響應(yīng)基因受到OsPHR1/2/3的調(diào)控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接調(diào)控。因此推測OsPHR1/2/3可能是菌根共生調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的一個關(guān)鍵調(diào)控樞紐(圖A-B)。EMSA和熒光素酶報告實驗證實,OsPHR12可以直接結(jié)合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT11、OsAMT3啟動子序列(圖C-F),并且這種結(jié)合依賴于啟動子中的P1BS元件(圖G)。湖南發(fā)展酵母文庫報價酵母文庫是歐易生物***服務(wù)項目。

酵母雙雜交文庫:本研究通過藍(lán)/紅光誘導(dǎo)青蒿中青蒿素生物合成基因的表達(dá),使用轉(zhuǎn)錄組分析確定了一個WRKY轉(zhuǎn)錄因子AaWRKY9,可明顯***青蒿素生物合成相關(guān)基因的表達(dá)。實驗表明AaWRKY9通過光依賴JA信號通路調(diào)節(jié),在青蒿素生物合成中發(fā)揮重要作用,AaWRKY9通過與AaDBR2和AaGSW1的啟動子結(jié)合正向調(diào)節(jié)青蒿素的積累。此外,JA信號通路中的抑制因子AaJAZ9與AaWRKY9相互作用,并抑制其轉(zhuǎn)錄***活性,而在MeJA存在情況下,AaJAZ9被降解,AaWRKY9的轉(zhuǎn)錄***活性增加,進而促進青蒿素生物合成基因的表達(dá)。酵母雙雜交文庫結(jié)果表明,AaWRKY9有助于光和JA信號調(diào)節(jié)青蒿素的生物合成,為兩種信號途徑在植物次生代謝物合成中的整合調(diào)控提供了新見解。

酵母文庫實驗本研究鑒定了一個可以與MdMYB9相互作用的蛋白MdTRB1。實驗表明,MdTRB1可以正向調(diào)節(jié)花青素和原花青素的累積。MdTRB1與MdMYB9結(jié)合可以增強后者對下游基因的轉(zhuǎn)錄***活性。而MdTRB1與MdJAZ1的結(jié)合,可以干擾其與MdMYB9的互作,進而負(fù)向調(diào)控MdTRB1介導(dǎo)的對花青素和原花青素積累的促進作用。本研究表明,JAZ1-TRB1-MYB9復(fù)合物可以動態(tài)調(diào)控JA介導(dǎo)的花青素和原花青素的積累。本研究為進一步研究JA對花青素和原花青素生物合成的調(diào)節(jié)提供了新見解。酵母三雜交系統(tǒng)原理酵母雙雜交文庫構(gòu)建。

水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù):2021 年 10 月 12 日,中國科學(xué)院分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心王二濤研究員為通訊作者,在 Cell 上發(fā)表了題為“A phosphate starvation response-centered network regulates mycorrhizal symbiosis”的封面論文。文章***報道了水稻-叢枝菌根共生轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)植物直接營養(yǎng)吸收途徑與通過叢枝菌根共生的間接營養(yǎng)吸收途徑均受到磷信號網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)一調(diào)控,回答了菌根共生領(lǐng)域“自我調(diào)節(jié)”這一困擾領(lǐng)域的重要科學(xué)問題。分子植物科學(xué)***創(chuàng)新中心博士后石進彩為***作者,歐易生物肖云平也參與了此項研究。文章中水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫篩選服務(wù)由歐易生物提供。博士期間長期從事酵母單/雙雜交文庫構(gòu)建及篩選的工作。四川發(fā)展酵母文庫做什么

酵母單雜交/雙雜交文庫構(gòu)建簡述酵母雙雜交。湖南應(yīng)用酵母文庫做什么

酵母雙雜交(Y2H):植物轉(zhuǎn)錄因子(Plant transcripter factors, TFs)是調(diào)控植物生長發(fā)育和環(huán)境適應(yīng)性的關(guān)鍵分子。雖然在一些數(shù)據(jù)庫中,如RiceSRTFDB (Priya and Jain, 2013), Ricettissuetfdb (Chen et al.,PlnTFDB (Pérez-Rodríguez et al., 2009)和PlantTFDB (Jin et al., 2017),可以預(yù)測水稻轉(zhuǎn)錄因子功能。但通過具體實驗研究,來直接證實轉(zhuǎn)錄因子對植物的調(diào)控作用仍然是必不可少的。酵母雙雜交(Y2H)和酵母單雜交(Y1H)是被用于研究蛋白-蛋白以及蛋白-DNA互作的**常用技術(shù)。為了方便和促進水稻育種研究,陳凡老師與歐易生物達(dá)成合作,整合雙方優(yōu)勢資源,歷經(jīng)春秋與冬夏,成功構(gòu)建了基于粳稻(日本晴)基因組的水稻轉(zhuǎn)錄因子文庫。該項成果以“一種高效的篩選系統(tǒng)來鑒定大米轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)-DNA相互作用伙伴”為題,發(fā)表于雜志JGG上。湖南應(yīng)用酵母文庫做什么

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