山西空間代謝組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2023-03-08

質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識別其生物學(xué)功能。鹿明生物購入空間代謝組學(xué),并構(gòu)建深度空間代謝組學(xué)的完整解決方案。山西空間代謝組學(xué)

收集了15名前列腺*患者共計45份新鮮冷凍組織**樣本,進(jìn)行空間代謝組學(xué)分析。從而實現(xiàn)對良性區(qū)域和**、NCE(包括正常腺體和增生)和**的不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)研究。樣品和分析概述成功鑒定了 27 種代謝物和 44 種脂質(zhì),發(fā)現(xiàn)NCE(非*上皮細(xì)胞)、基質(zhì)細(xì)胞和**組織代謝存在明顯差異。歐易生物鹿明生物豐富的項目實戰(zhàn)經(jīng)驗1、已落地執(zhí)行項目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測。2、檢測組織樣本類型20+。青海空間代謝組學(xué)研究意義空間代謝組學(xué)基本研究流程。

通過空間代謝組學(xué)測量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,發(fā)現(xiàn)在不同的**中,MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油(PGs)的豐度(圖 4A),能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后,PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平(圖 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通過向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成,因此,PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而,在體內(nèi)PGs相對于其他GPs的相對優(yōu)先合成,這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。

AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):中文標(biāo)題:一種基于分子組織學(xué)的高靈敏高覆蓋質(zhì)譜成像方法用于檢測功能性代謝物研究對象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發(fā)表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運用生物技術(shù):AFADESI-MSI空間代謝組學(xué)2018年11月中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發(fā)表的研究論文,通過優(yōu)化的空氣動力輔助解吸電噴霧質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術(shù),繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時空變化與組織結(jié)構(gòu)和生物功能聯(lián)系起來。本研究開發(fā)了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發(fā)現(xiàn)特異性生物標(biāo)志物。通過非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數(shù)千種代謝物,為分子組織學(xué)研究提供了有力的分析工具。空間代謝組學(xué)找出其代謝物的差異,提供定量檢測。

隊列1:收集手術(shù)切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經(jīng)***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進(jìn)程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結(jié)合H&E染色。研究方法:空間代謝組學(xué);qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達(dá);細(xì)胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達(dá)??臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫。青??臻g代謝組學(xué)研究意義

空間代謝組技術(shù)特點。山西空間代謝組學(xué)

空間代謝組學(xué):繪制了不同代謝物在組織內(nèi)濃度的圖像,直觀顯示了代謝物在NCE細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞和**細(xì)胞的濃度差異。在正離子和負(fù)離子模式下檢測到的質(zhì)量分別用紅色加號和藍(lán)色減號表示。組織邊緣用黑色邊框勾勒出輪廓,但**區(qū)域還包含一些無法單獨注釋的*細(xì)胞與基質(zhì)的區(qū)域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羥基丁酰肉堿,HE=蘇木精和伊紅,LPC=溶血磷脂酰膽堿,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇山西空間代謝組學(xué)

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