山西空間代謝組學 藥效物質(zhì)

來源: 發(fā)布時間:2023-02-13

1.樣本準備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測。2.空間代謝組實驗使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過轉化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡信息。大腦中復雜網(wǎng)絡可視化使用Cyctoscope軟件完成。鹿明生物空間代謝組多組學服務。山西空間代謝組學 藥效物質(zhì)

空間代謝組學主要從事質(zhì)譜成像新技術、空間分辨代謝組學新方法及其在生物醫(yī)藥應用研究和臨床前新藥代謝研究。近年來在質(zhì)譜成像空間分辨代謝組學領域取得重要突破,并**國際前沿發(fā)展。目前,承擔著國家自然科學基金、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等多項課題,科研經(jīng)費充足;擁有先進的液質(zhì)聯(lián)用儀器和質(zhì)譜成像儀器數(shù)臺,建立了新藥研發(fā)質(zhì)量管理規(guī)范體系,實驗條件完備。具有分析化學、或藥物分析、或生物學等相關專業(yè)的博士學位。2、具有以下研究經(jīng)驗或能力之一:質(zhì)譜分析;代謝組學研究;與新藥或疾病相關的分子生物學研究;生物信息學等。湖南空間代謝組學 中藥活性成分曾經(jīng)錯過熱潮—空間轉錄組,別再錯過新秀—空間代謝組。

在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡的關鍵因素,基于空間分辨的代謝組學信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡分析必須進一步驗證蛋白質(zhì)和基因表達水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡作圖方法,通過無需衍生化、特定標記或復雜樣品預處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學策略,在具有復雜結構化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測出多種極性內(nèi)源性代謝物,并繪制相關代謝網(wǎng)絡,提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化。

作者使用NMR對C原子進行示蹤實驗,發(fā)現(xiàn)MYC驅(qū)動葡萄糖和谷氨酰胺的C參與脂肪生成(圖3)。采用空間代謝組學檢測小鼠模型以及人BCL細胞中的FA,發(fā)現(xiàn)MYC**中不飽和脂肪酸(FA(18:1))的豐度增加。進一步發(fā)現(xiàn)13C-油酸酯在MYC誘導的BCL細胞未發(fā)生代謝,而13C-葡萄糖增加了不飽和FA中的標記碳。當MYC失活時,細胞中3H標記的棕櫚酸酯氧化速率明顯變高。MYC-ON和MYC-OFF的BCL細胞中的油酸酯均未被氧化。因此,MYC可能在抑制FA氧化的同時上調(diào)FA的合成。空間代謝組學-代謝組學服務-擅長多組學聯(lián)合分析。

空間代謝組學:在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度,通過人類代謝組數(shù)據(jù)庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)(CNS)的特定功能和特定解剖區(qū)域相關。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達;γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì),其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。空間代謝組技術流程 。廣東空間代謝組學鹿明

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分子成像技術是研究大腦中DNA、RNA、蛋白質(zhì)和代謝產(chǎn)物的強大工具。質(zhì)譜成像技術(MSI)是一種檢測大腦中蛋白質(zhì)、代謝物和脂質(zhì)物質(zhì)的高靈敏度和高通量分子成像技術,在**邊緣診斷、**生物標志物發(fā)現(xiàn)、藥物分布和機理闡述等領域有***的應用。本文作者開發(fā)了一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)技術的代謝網(wǎng)絡映射方法,對大鼠腦不同極性的小分子代謝物(m/z50-500Da)進行微區(qū)分布研究,不僅鑒定出腦部幾乎所有重要的代謝物,還繪制了包含神經(jīng)遞質(zhì)、嘌呤,有機酸,多胺,膽堿、碳水化合物和脂類等20條通路的代謝網(wǎng)絡,并使用這種代謝網(wǎng)絡映射質(zhì)譜成像方法解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化,為***系統(tǒng)疾病的***提供新的信息和見解。山西空間代謝組學 藥效物質(zhì)

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