天津swath蛋白組學(xué)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-28

iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)研究實(shí)用案例:2021年8月,浙江大學(xué)藥學(xué)院何俏軍、羅沛華團(tuán)隊(duì)在Autophagy期刊發(fā)表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通過(guò)動(dòng)物模型、功能實(shí)驗(yàn)、iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)了舒尼替尼誘導(dǎo)的自噬導(dǎo)致心肌細(xì)胞凋亡和心臟功能障礙,探究了舒尼替尼誘導(dǎo)的適應(yīng)不良自噬通過(guò)TOLLIP介導(dǎo)的內(nèi)體相關(guān)通路選擇性降解心肌細(xì)胞存活介質(zhì)CCN2的機(jī)理,揭示了調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞死亡的自噬降解新靶標(biāo)蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據(jù)。中文標(biāo)題:CCN2的自噬降解導(dǎo)致舒尼替尼的心臟毒性研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:Autophagy影響因子:16.016發(fā)表時(shí)間:2021年8月合作單位:浙江大學(xué)藥學(xué)院運(yùn)用生物技術(shù):iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見(jiàn)問(wèn)題答疑解惑。天津swath蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué)研究案例:2022年1月,歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了肉桂酸(AC)和肉桂醛(AL)在改善葡萄糖脂代謝中的特征,探究了其代謝作用機(jī)理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。遼寧蛋白組學(xué)高通量修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。

作者通過(guò)泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹(shù)作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹(shù)根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹(shù)根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹(shù)根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過(guò)蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。

為了更好地了解DON對(duì)C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個(gè)共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動(dòng)蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對(duì)co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過(guò)程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個(gè)條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué) 。

iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過(guò)程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢(shì),確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。蛋白驗(yàn)證新技術(shù)-PRM,平行反應(yīng)監(jiān)視蛋白組學(xué)。上海國(guó)內(nèi)蛋白組學(xué)公司排名

靶向蛋白質(zhì)組學(xué),信號(hào)通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。天津swath蛋白組學(xué)

作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對(duì)種子發(fā)育過(guò)程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對(duì)比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?;钴S。為了評(píng)估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。天津swath蛋白組學(xué)

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