山東蛋白組學質(zhì)譜分析

DIA蛋白組學：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學研究方法，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質(zhì)組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標志物。同時作者發(fā)現(xiàn)補體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調(diào)，這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用。蛋白組學近期研究進展的盤點。山東蛋白組學質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)（ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK）。此外，AC顯示出抑制脂肪生成酶（ACC，F(xiàn)ASN和SCD1）表達的趨勢，同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比，AC***增加了PEPCK的表達，兩種化學物質(zhì)對G6Pase均無***影響（圖4A）。PRM蛋白靶向驗證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致，這進一步證實了蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達（圖4B）。轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示，處理組的氧化磷酸化（OXPHOS）通路***上調(diào)，AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。安徽植物蛋白組學實驗心得體會扎根蛋白組學臨床科研基礎(chǔ)研究領(lǐng)域,多年項目服務(wù)經(jīng)驗。

4D蛋白質(zhì)組學分析發(fā)現(xiàn)，不同的病因和疾病的嚴重程度中蛋白表達存在差異。嚴重的疾病同急性期的蛋白的增加，補體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān)；通過COVID-19和健康組對比，發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物；和膿毒癥相比，G-CSF，IL-8等在嚴重的COVID-19患者中含量更低；蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強相關(guān)性。本研究通過4D蛋白組學技術(shù)結(jié)合其他組學技術(shù)及免疫技術(shù)，確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素，并為進一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。

作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?；抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻酰化，而過表達NMT1會誘導NDP和NUP的N-豆蔻酰化（圖2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會導致NDP和NUP的去N-豆蔻?；?，這可以通過在肝臟中表達外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對NDP和NUP的表達起著相反的作用，但NMT1同時刺激NDP和NUP的N-豆蔻?；?。蛋白組學常見研究模式,蛋白樣本準備注意事項以及經(jīng)典案例解讀。

運用生物技術(shù)：磷酸化蛋白質(zhì)組學（歐易鹿明提供）：2022年1月，***醫(yī)學研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員，廣西醫(yī)科大學附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作（一作：萬祿明、鄧永強、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天）在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果，通過磷酸化蛋白質(zhì)組學、LC-MS靶向代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調(diào)控***——GP73，***會誘導GP73的產(chǎn)生和分泌，從而導致過度的糖異生。單細胞蛋白質(zhì)組學，極微量樣本檢測。遼寧干眼蛋白組學

蛋白質(zhì)組學基本策略 研究基礎(chǔ) 研究內(nèi)容 研究意義背景。山東蛋白組學質(zhì)譜分析

iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法：2021年7月，海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發(fā)表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術(shù)研究方法，發(fā)現(xiàn)了油茶種子成熟過程中與油質(zhì)相關(guān)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累模式特征，探究了不同成熟度油茶轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜機理，描繪了海南油茶種子成熟過程的動態(tài)變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據(jù)。山東蛋白組學質(zhì)譜分析

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