廣東磷酸化蛋白組學(xué)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-25

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個(gè)上調(diào),121個(gè)下調(diào)),AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個(gè)上調(diào),95個(gè)下調(diào))。靶向蛋白質(zhì)組學(xué),信號(hào)通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。廣東磷酸化蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)特定氨基酸上的過(guò)程,是生物體內(nèi)**為常見(jiàn)、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是一個(gè)瞬時(shí)且可逆的過(guò)程,通過(guò)磷酸化修飾可以改變蛋白質(zhì)空間構(gòu)象,從而影響蛋白質(zhì)的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來(lái),一直專(zhuān)注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,是國(guó)內(nèi)早期開(kāi)展以蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。影響因子:13.511發(fā)表時(shí)間:2022-01-06發(fā)表單位:***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供)、LC-MS靶向代謝組學(xué)吉林蛋白組學(xué)應(yīng)用單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù) 。

為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡(luò)模塊是否也存在于其他的隊(duì)列和大腦區(qū)域,使用 TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)多個(gè)隊(duì)列的所有組織,為每個(gè)隊(duì)列生成蛋白質(zhì)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),并評(píng)估了 AD 網(wǎng)絡(luò)模塊是否保留在每個(gè)隊(duì)列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡(luò)模塊都保留在隊(duì)列和大腦區(qū)域(圖2b)。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學(xué)方向出發(fā),建立蛋白共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),綜合轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)果,解析疾病相關(guān)的蛋白組學(xué)模塊或能為AD提供可靠的生物標(biāo)志物,并為治療帶來(lái)希望。

作者通過(guò)iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白(NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF)(圖2A)。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?;抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是,敲低NMT1會(huì)減少NDP和NUP的N-豆蔻?;?,而過(guò)表達(dá)NMT1會(huì)誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻?;▓D2B)。在小鼠模型中,敲除NMT1會(huì)導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?;?,這可以通過(guò)在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來(lái)部分逆轉(zhuǎn)(圖2C)。這些發(fā)現(xiàn)表明,盡管NMT1對(duì)NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用,但NMT1同時(shí)刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù),蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究案例:作為一種常見(jiàn)的******,脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)在田間或加工和儲(chǔ)存過(guò)程中會(huì)污染谷物和飼料。DON在動(dòng)物中會(huì)引起厭食和生長(zhǎng)遲緩在內(nèi)的一系列不良反應(yīng)。本文作者使用轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)鼠C2C12細(xì)胞進(jìn)行了研究,分析DON對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響。研究結(jié)果表明,DON通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路來(lái)影響成肌細(xì)胞的分化。本文研究體現(xiàn)了組學(xué)技術(shù)在機(jī)制研究中的重要作用。中文標(biāo)題:霉菌***脫氧雪腐鐮刀菌烯醇通過(guò)下調(diào)細(xì)胞骨架和ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路影響成肌細(xì)胞分化研究對(duì)象:脫氧雪腐鐮刀菌烯醇、C2C12細(xì)胞發(fā)表期刊:EcotoxicologyandEnvironmentalSafety影響因子:6.291發(fā)表時(shí)間:2021年10月發(fā)表單位:中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所運(yùn)用生物技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、免疫熒光、免疫印跡、PCR蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤(pán)點(diǎn)。廣東磷酸化蛋白組學(xué)

一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。廣東磷酸化蛋白組學(xué)

通過(guò)磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個(gè)磷酸化蛋白質(zhì),其中474個(gè)(38%)在**組織中***增加,183個(gè)(15%)***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學(xué)的比較結(jié)果揭示了亞型特異性的活性激酶。進(jìn)一步對(duì)差異改變的磷酸化位點(diǎn)的研究顯示,在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運(yùn)的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術(shù),是對(duì)蛋白組學(xué)+磷酸化組學(xué)的雙重升級(jí),可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性,**臨床蛋白質(zhì)組學(xué)在定性數(shù)量更多、定量更準(zhǔn)確、位點(diǎn)鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測(cè)周期更短等性能上***提升,從蛋白質(zhì)表達(dá)和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機(jī)制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標(biāo)志物等多重作用。廣東磷酸化蛋白組學(xué)

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