廣東磷酸化蛋白組學(xué)研究

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-09-28

4D蛋白組學(xué):tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度(TIMS)和同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù),可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí),其配備了***一代雙 TIMS 分析器,離子容量可提高三倍,比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個(gè)新的臺(tái)階,鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋,結(jié)果更精細(xì),也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。更高掃描速度:助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究,更高覆蓋深度:助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量,超高靈敏度:助力微量樣本蛋白組分析,鑒定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。蛋白組學(xué)—精選文章推薦。廣東磷酸化蛋白組學(xué)研究

2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對(duì)成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號(hào)通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持。安徽蛋白組學(xué)的結(jié)果怎么分析蛋白質(zhì)組學(xué)-鹿明生物丨歐易生物。

TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應(yīng)的差異表達(dá)蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解,為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。

作者運(yùn)用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)對(duì)種子發(fā)育過程中蛋白質(zhì)表達(dá)的定量比較,同時(shí)進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。結(jié)果表明所有鑒定的蛋白被分為29類,主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對(duì)比較中,普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中,參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非?;钴S。為了評(píng)估轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組之間的一致性,以及了解轉(zhuǎn)錄后的mRNA在蛋白質(zhì)水平上是如何表現(xiàn)的,作者進(jìn)行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯(lián)合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù),蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。

作者通過泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學(xué)區(qū)別在哪。上海蛋白組學(xué)植物

歐易鹿明生物基于質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué)。廣東磷酸化蛋白組學(xué)研究

蛋白組學(xué)技術(shù)可以提供細(xì)胞狀態(tài)和調(diào)控的功能信息,本研究建立了單細(xì)胞蛋白組學(xué)方法,實(shí)現(xiàn)了高靈敏度的蛋白組學(xué)檢測。該技術(shù)有助于揭示疾病的發(fā)病機(jī)制,探討預(yù)后和風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的不同腎臟疾病亞型中的蛋白組學(xué)異質(zhì)性和獨(dú)特的蛋白標(biāo)志物,為藥物靶點(diǎn)***提供希望。大規(guī)模單細(xì)胞分析對(duì)于捕獲復(fù)雜細(xì)胞系統(tǒng)中的生物異質(zhì)性至關(guān)重要,但*基于RNA技術(shù)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)并不能很好地**蛋白質(zhì)水平上的變化。而單細(xì)胞蛋白組學(xué)技術(shù)能夠從蛋白質(zhì)水平上破譯細(xì)胞機(jī)制并且獲得更多的信息。廣東磷酸化蛋白組學(xué)研究

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