非靶向代謝組學研究：通過在三個成熟階段收獲兩個東方甜瓜品種的果實作者使用非靶代謝組學聯(lián)合轉錄組學發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機酸在轉錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項研究運用多組學技術聯(lián)合揭示了兩個品種成熟過程中關鍵的代謝和轉錄特征。在本研究中，通過代謝和轉錄組分析的綜合分析，研究了控制兩個東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機酸代謝的基因網絡。篩選了與糖和有機酸代謝相關的關鍵代謝物和候選基因，并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結果提高了對決定甜瓜發(fā)育和成熟過程中糖和有機酸積累和代謝的分子機制的理解。代謝組學-歐易生物/鹿明生物 客戶好評 專注代謝組學研究。北京代謝組學研究的內容
非靶向代謝組學研究：2022年5月，歐易/鹿明生物合作客戶甘肅省農業(yè)科學院程鴻團隊和中國農業(yè)大學林濤團隊在Frontiers in Plant Science期刊發(fā)表的題為 “Identification of Key Gene Networks Controlling Soluble Sugar and Organic Acid Metabolism During Oriental Melon Fruit Development by Integrated Analysis of Metabolic and Transcriptomic Analyses”的研究成果，采用非靶代謝組學和轉錄組研究方法，發(fā)現(xiàn)了蔗糖、D-葡萄糖、棉子糖的高積累以及相對較低的檸檬酸和蘋果酸可能有助于東方甜瓜“甜寶”的甜味。北京代謝組學資源代謝組學 生物標志物挖掘**-歐易生物。
糞便LC-MS代謝組學研究方法，2022年，復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果，通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***，并改變了小鼠腸道微生物群落結構和代謝特征，探究了DADS可以調節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內在機理，為***白色念珠菌***提供了理論依據。
GC-MS非靶向代謝組學研究，2022年2月，上海市農業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果，通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質組學和代謝組學分析，發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色重要過程，并對其在蛋白質組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。中文標題：氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉色形成的重要過程發(fā)表期刊：FrontiersinMicrobiology影響因子：5.64作者單位：上海市農業(yè)科學院食用菌研究所涉及的歐易/鹿明生物服務產品：iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學。聚焦于代謝產物研究，采用高精尖的分析儀器,對細胞內的代謝物進行定性和定量分析。
代謝組學數(shù)據提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點，并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段，靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中，發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰，負離子模式631個、正離子模式下的1835個；通過篩選，鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合，而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D)；與正常組對比，***上調的代謝物：輕癥組有48個，嚴重組有59個，恢復組有64個；***下調的代謝物：輕癥組有33個，重癥組有29個，恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析；首先根據發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除)；定量到了199種代謝物。根據不同組的濃度，將199個代謝物分為16個簇；然后根據恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。常用的代謝組學相關數(shù)據庫有人類代謝組數(shù)據庫KEGG數(shù)據庫、Reactome數(shù)據庫。北京代謝組學資源
代謝組學-方法與應用-實驗操作-儀器設備。北京代謝組學研究的內容
代謝組學等多組學研究，2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。北京代謝組學研究的內容
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