作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題：氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發(fā)表時間：2021年9月1日發(fā)表單位：安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術(shù)：TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。單細胞蛋白組學之質(zhì)譜流式細胞技術(shù)。山東分子蛋白組學
4D蛋白組學：tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù)，可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時，其配備了***一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質(zhì)組學分析再上一個新的臺階，鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現(xiàn)蛋白深度覆蓋，結(jié)果更精細，也成為轉(zhuǎn)化組學應用不可或缺的工具。更高掃描速度：助力臨床大隊列項目研究，更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量，超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析，鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。內(nèi)蒙古蛋白組學非標記定量質(zhì)譜技術(shù),生物信息學方法,提供蛋白質(zhì)組學 。
蛋白質(zhì)組學(由鹿明生物提供技術(shù)支持)；2021年8月，中國醫(yī)學科學院基礎(chǔ)醫(yī)學研究所趙春華和韓欽課題組在Aging and disease期刊發(fā)表了題為“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果，通過蛋白質(zhì)組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了間充質(zhì)干細胞衍生的外泌體可以通過增加ICAM1的表達來促人腦MECs血管生成，并減輕MPP+對細胞的損傷，***間充質(zhì)干細胞衍生外泌體***帕金森的可能性。
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學分析和DIA蛋白質(zhì)組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個下調(diào)，1548個上調(diào)），560個基因（430個下調(diào)，130個上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個上調(diào)，121個下調(diào)），AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個上調(diào)，95個下調(diào)）。蛋白組學檢測一個樣多少錢。
隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目（CPTAC）和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學研究計劃的推進，發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、磷酸化蛋白質(zhì)組學、代謝組學、微生物組學等技術(shù)，在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章，可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)在多組學數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果，且蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析有些共同特點，即：1）基于蛋白質(zhì)組進行**分子分型2）分析不同亞型患者的臨床特征3）免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點在不同亞型中的差別分析4）篩選亞型特征分子作為預后標志物或潛在的藥靶進行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細胞*多組學研究后，同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學聯(lián)合分析策略，進一步闡釋了蛋白質(zhì)組學驅(qū)動精細醫(yī)學的優(yōu)勢，為**的發(fā)***展機制、分子分型、預后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路。蛋白組學問題解答知乎都做不到哦。山東蛋白組學研究雜志
蛋白組學研究必看的經(jīng)典綜述。山東分子蛋白組學
為了更好地了解DON對C2C12細胞分化的影響，作者進行了轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因（co-DEG），其中91%被共下調(diào)（圖3A）。15%的co-DEG屬于真核細胞骨架，其中大部分屬于肌動蛋白絲，少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進行GO分析，生物學過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復合物”、“細胞外空間”、“細胞外基質(zhì)”、“細胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細胞外基質(zhì)”，這些都是細胞外成分（圖3B）。結(jié)果表明，DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細胞外成分的表達。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。山東分子蛋白組學
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