浙江代謝組學(xué)的應(yīng)用前景

來源: 發(fā)布時間:2022-09-22

非靶向代謝組學(xué)研究:對于代謝物分析,作者對非靶代謝組學(xué)測定,共檢測到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性(VIP)>1和p<0.05的篩選標(biāo)準(zhǔn),在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物(DAM)(表1)。在A果實(shí)(AF)與B果實(shí)(BF)的相同成熟階段,發(fā)現(xiàn)S3的DAM比S1和S2更豐富,這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3。隨后,利用京都基因和基因組百科全書(KEGG)富集分析進(jìn)一步了解與兩個東方甜瓜品種相關(guān)的生物學(xué)機(jī)制。其中,參與蔗糖和有機(jī)酸代謝的代謝物在果實(shí)中的積累差異更大,包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。非靶向代謝組學(xué),靶向代謝組學(xué)研究經(jīng)驗(yàn)。浙江代謝組學(xué)的應(yīng)用前景

通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)(GC-MS非靶向代謝組學(xué))對BPF暴露和對照組的細(xì)胞進(jìn)行分析,篩選到差異的基因和代謝物。分別通過富集分析,找到差異基因或代謝物參與的條目或通路。***通過差異轉(zhuǎn)錄本、代謝物和促炎細(xì)胞因子的綜合分析,揭露了它們之間的關(guān)系。本文通過多組學(xué)分析和體外模型的方式,發(fā)現(xiàn)了BPF暴露后腸上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和代謝組譜的改變,揭露了BPF可能在腸道炎癥發(fā)病機(jī)制的作用。中文標(biāo)題:轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象:人結(jié)腸粘膜上皮細(xì)胞系(NCM460)發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:7.963發(fā)表時間:2021年11月合作單位:上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR江蘇代謝組學(xué)數(shù)據(jù)怎么看代謝組學(xué)生物解析 非靶代謝組學(xué)研究 靶向代謝組學(xué)研究。

非靶向代謝組學(xué)研究:利用番茄的自然變異確定番茄復(fù)合體中果實(shí)多酚的途徑結(jié)構(gòu)和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學(xué)技術(shù):LC-MS靶向代謝組學(xué)、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學(xué)),本研究通過表征構(gòu)成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡(luò)的潛在生物合成和修飾反應(yīng),闡明了八種番茄復(fù)合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關(guān)代謝物和結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行了詳細(xì)注釋,并運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學(xué)方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實(shí)成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設(shè)計(jì)提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。

代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點(diǎn),并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機(jī)制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中,發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負(fù)離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴(yán)重組有59個,恢復(fù)組有64個;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復(fù)組有34個。使用靶向代謝組學(xué)分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組??臻g代謝組學(xué) 代謝組學(xué)測序原理 代謝組學(xué)研究價格。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究,中文標(biāo)題:代謝組學(xué)分析和氧化應(yīng)激反應(yīng)揭示了有機(jī)磷類阻燃劑磷酸三(2-氯乙基)和磷酸三苯基對大腸桿菌的毒性研究對象:大腸桿菌發(fā)表期刊:Chemosphere影響因子:7.086作者單位:廣東石油化工大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程學(xué)院涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:GC-MS非靶向代謝組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)以往有關(guān)嘔吐***的研究多集中在免疫毒性、神經(jīng)毒性、生殖毒性、遺傳毒性等方面,而關(guān)于生長發(fā)育影響的研究較少。該研究是一篇通過大腸桿菌作為研究對象利用非靶向代謝組學(xué)來探究有機(jī)磷阻燃劑影響生物的發(fā)育和功能的高質(zhì)量的、創(chuàng)新性的的研究文章,值得學(xué)習(xí)與借鑒。代謝組學(xué)-鹿明生物-歐易生物 以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象。江蘇代謝組學(xué)檢測方法

代謝組學(xué)研究行業(yè)放心品牌-歐易生物-鹿明生物。浙江代謝組學(xué)的應(yīng)用前景

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學(xué)研究方法,對92例樣品5個時間點(diǎn)的尿液樣品進(jìn)行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關(guān)的差異標(biāo)志物,結(jié)果揭示了年輕健康人在五個不同時間點(diǎn)的尿液代謝譜的動態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關(guān)的幾種潛在代謝物生物標(biāo)志物,發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會導(dǎo)致代謝改變并降低應(yīng)激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質(zhì)軸的***有關(guān);而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標(biāo)志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標(biāo)志物,可用于分別預(yù)測或診斷PM或生物氣溶膠相關(guān)疾病。浙江代謝組學(xué)的應(yīng)用前景

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