蛋白組學(xué)研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學(xué)教育部中醫(yī)養(yǎng)生學(xué)重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理。為預(yù)防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。蛋白組學(xué)專業(yè)客服在線為您答疑 。遼寧靶向蛋白組學(xué)專題
本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)，對不同成熟度水平的油脂種子進(jìn)行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達(dá)，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學(xué)依據(jù)。中文標(biāo)題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學(xué)園藝園林學(xué)院運用生物技術(shù)：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)文章中iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持廣東代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)扎根蛋白組學(xué)臨床科研基礎(chǔ)研究領(lǐng)域,多年項目服務(wù)經(jīng)驗。
中文標(biāo)題：肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機制：多組學(xué)提供的見解研究對象：小鼠發(fā)表期刊：FrontiersinNutrition影響因子：6.576發(fā)表時間：2022年1月11日合作單位：北京中醫(yī)藥大學(xué)健康培養(yǎng)教育部重點實驗室，北京中醫(yī)藥大學(xué)健康栽培北京市重點實驗室，北京中醫(yī)藥大學(xué)科學(xué)技術(shù)系運用組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DIA蛋白組學(xué)、PRM靶向蛋白驗證(皆由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)。目前，改善飲食被認(rèn)為是**安全有效的***和預(yù)防代謝性疾病的方法，其中肉桂（主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮）及其成分被證明具有多種***作用，包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強胰島素敏感性。因此，使用膳食補充劑和來自肉桂的化學(xué)物質(zhì)來控制血糖和血脂可能成為***代謝類疾病的新方法。
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展，特別是離子淌度的引入，增加了一個新的分離維度，將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面，打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸，大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度，帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升，可以更好的解決大隊列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器，離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì)，也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析，在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。蛋白質(zhì)組學(xué)的特點蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。
通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs，在0、24和48小時各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外，熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因，包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時序分析表明，HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān)，增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力，因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(圖2I)。綜上所述，結(jié)果證實了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。蛋白組學(xué)常見研究模式 | 蛋白質(zhì)組專題_鹿明生物。江西質(zhì)譜的蛋白組學(xué)
蛋白組學(xué)研究必看的經(jīng)典綜述。遼寧靶向蛋白組學(xué)專題
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。遼寧靶向蛋白組學(xué)專題
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