糞便LC-MS代謝組學研究方法,2022年,復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***,并改變了小鼠腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和代謝特征,探究了DADS可以調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內(nèi)在機理,為***白色念珠菌***提供了理論依據(jù)。代謝組學 尋找代謝物與生理病理的研究方式。浙江代謝組學軟件
本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關(guān)的差異標志物,結(jié)果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關(guān)的幾種潛在代謝物生物標志物,發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質(zhì)軸的***有關(guān);而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關(guān)疾病。江蘇單細胞 代謝組學代謝組學 研究一站式服務平臺。
**靶向代謝組學研究,中文標題:代謝組學分析揭示了COVID-19新的發(fā)展特征研究對象:****患者發(fā)表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影響因子:16.671發(fā)表時間:2021.7.21運用生物技術(shù):LC-MS非靶代謝組學+靶向代謝組學,****已經(jīng)***了1.6億多人,并導致全世界數(shù)以百萬的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,識別****的潛在分子機制對于戰(zhàn)勝**是至關(guān)重要的。此外,代謝物通過在疾病進展過程中獲得***的病理生理學意義來反映個體的疾病進展。因此,中國廣州多家研究機構(gòu)的科研人員使用了非靶向和靶向代謝組學分析對****患者所有階段血清的代謝特征進行了***的觀察。與健康對照組比較,在發(fā)現(xiàn)隊列和驗證隊列中,輕度、重度和恢復期循環(huán)代謝物的變化模式不同,提示糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是****進展的潛在病理機制。
糞便代謝組分析,中文標題:二烯丙基二硫化物(DADS)通過調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象:小鼠糞便發(fā)表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子:5.293發(fā)表時間:2022年1月7日合作單位:復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科運用生物技術(shù):糞便代謝組分析(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導的腸道白色念珠菌小鼠模型,模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結(jié)腸炎的嚴重程度,另一方面通過微生物組學和代謝組學等手段確認了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(diào)(改變腸道微生物群和代謝物)、腸道通透性和全身炎癥反應。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。代謝組學-歐易生物/鹿明生物 客戶好評 專注代謝組學研究。
代謝組學數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據(jù)恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。代謝組學分析價格-歐易生物特色研究-多項目經(jīng)驗-自有實驗室代謝組學。上海腸道菌群的代謝組學
非靶向代謝組學,靶向代謝組學研究經(jīng)驗。浙江代謝組學軟件
有機酸靶向代謝組學研究:中文標題:通過代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析鑒定控制東方甜瓜果實發(fā)育過程中可溶性糖和有機酸代謝的關(guān)鍵基因網(wǎng)絡研究對象:甜瓜發(fā)表期刊:Front.PlantSci.影響因子:5.753發(fā)表時間:2022年5月12日合作單位:甘肅省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所,中國農(nóng)業(yè)大學園藝學院運用生物技術(shù):非靶向代謝組學(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(由歐易生物提供技術(shù)支持)在本研究中,通過***的轉(zhuǎn)錄組分析和代謝物分析,作者發(fā)現(xiàn)東方甜瓜品種'甜寶'(A)的果實含糖量高,'小翠瓜'(B)的果實含糖量低,并同時在不同的發(fā)展階段進行了比較。研究有助于闡明與甜瓜中糖和有機酸代謝相關(guān)的基因的動態(tài)和差異表達。浙江代謝組學軟件
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