上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)特點(diǎn)

代謝組學(xué)經(jīng)典研究：本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究，***篇文章運(yùn)用LC-MS/GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)探究番茄果實(shí)成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運(yùn)用16S rRNA測(cè)序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機(jī)制。第三篇文章運(yùn)用GC-MS頂空代謝組學(xué)探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發(fā)現(xiàn)了幾種不同的揮發(fā)性化合物。第四篇文章運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對(duì)對(duì)全氟辛酸（PFOA）暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進(jìn)行了研究。代謝組學(xué)——尋找代謝物與生理病理變化的相對(duì)關(guān)系研究方式。上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)特點(diǎn)

LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法，2021年11月，寧波大學(xué)海洋科學(xué)學(xué)院王春琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)在Frontiers in Marine Science期刊發(fā)表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果，通過LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應(yīng)鹽度變化的主要因素，而脂質(zhì)代謝物起輔助作用。中文標(biāo)題：青蟹在適應(yīng)鹽度急劇下降過程中的代謝變化研究對(duì)象：青蟹發(fā)表期刊：FrontiersinMarineScience影響因子：4.912發(fā)表時(shí)間：2021年11月2日合作單位：寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術(shù)支持)浙江代謝組學(xué) 富集分析代謝組學(xué)行業(yè)解決方案和技術(shù)服務(wù)流程。

代謝組學(xué)數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點(diǎn)，并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機(jī)制。在****病程的不同階段，靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學(xué)分析中，發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中的樣品共鑒定出2466個(gè)代謝物峰，負(fù)離子模式631個(gè)、正離子模式下的1835個(gè)；通過篩選，鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合，而重癥組和恢復(fù)組很容易區(qū)分(圖1B)。240個(gè)代謝物中有193個(gè)與COVID-19***相關(guān)(圖1C)。火山圖顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D)；與正常組對(duì)比，***上調(diào)的代謝物：輕癥組有48個(gè)，嚴(yán)重組有59個(gè)，恢復(fù)組有64個(gè)；***下調(diào)的代謝物：輕癥組有33個(gè)，重癥組有29個(gè)，恢復(fù)組有34個(gè)。使用靶向代謝組學(xué)分析；首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊(duì)列中59名受試者的血清代謝物(4個(gè)樣本因體積小而被排除)；定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度，將199個(gè)代謝物分為16個(gè)簇；然后根據(jù)恢復(fù)組的代謝物是否恢復(fù)到正常水平將這些簇分為三組。

LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究案例，中文標(biāo)題：***通絡(luò)***通過***和抗氧化作用預(yù)防及延緩糖尿病視網(wǎng)膜病變發(fā)展的機(jī)制研究研究對(duì)象：大鼠發(fā)表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子：6.529發(fā)表時(shí)間：2022年2月合作單位：中國中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù)：LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持)。文章通過對(duì)中藥***—***通絡(luò)方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在預(yù)防及***方面和微觀層面均起到了***效果。同時(shí)，也探究出***通絡(luò)方的內(nèi)在作用機(jī)制。也為糖尿病視網(wǎng)膜病變的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)有助于對(duì)中藥成分進(jìn)行***的分析，為藥物機(jī)制提供參考。代謝組學(xué)-歐易生物/鹿明生物 客戶好評(píng) 專注代謝組學(xué)研究。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究：不同分子量聚乙烯顆粒改變了玉米根際土壤微生物群落組成和代謝譜AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究對(duì)象：聚乙烯顆粒、玉米、根際土壤發(fā)表期刊：JournalofHazardousMaterials影響因子：10.588組學(xué)技術(shù)：GC-MS非靶向代謝組學(xué)和16SrRNA測(cè)序(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)；這項(xiàng)研究的重點(diǎn)是確定不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機(jī)制。本文運(yùn)用非靶向代謝組學(xué)，微生物16SrRNA測(cè)序等方法研究的結(jié)果證實(shí)，不同分子量的PE顆粒對(duì)土壤-植物系統(tǒng)有不利影響。不同分子量的PE顆粒在形狀和表面微觀結(jié)構(gòu)上存在明顯差異。土壤蔗糖酶和過氧化物酶對(duì)不同分子量的PE顆粒有***響應(yīng)。代謝組學(xué) 尋找代謝物與生理病理的研究方式。北京代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的分析

常用的代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)特點(diǎn)

LC-MS靶向代謝組+16S微生物多樣性檢測(cè)研究。題目：糞便微生物可以區(qū)分酒精性肝炎引起的酒精攝入量，但不能區(qū)分疾病的嚴(yán)重程度期刊：HepatologyIF=17.425研究思路：*樣本類型：人糞便*檢測(cè)平臺(tái)：LC-MS靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測(cè)為了表征酒精性肝炎有關(guān)的糞便微生物生態(tài)學(xué)，考察微生物組變化和疾病嚴(yán)重程度的關(guān)系，推斷微生物生態(tài)學(xué)變化的功能相關(guān)性，本文作者將中度或重度酒精性肝炎患者（MAH和SAH）的糞便微生物組與健康（HC）和重度飲酒對(duì)照組（HDC）進(jìn)行比較，通過16SrRNA基因測(cè)序鑒定微生物群分類，使用LC/MS平臺(tái)測(cè)量糞便短鏈脂肪酸（SCFA）含量。重度飲酒患者與健康對(duì)照組相比、重度飲酒組與酒精性肝炎相比，均可以發(fā)現(xiàn)明顯的微生物組特征分布。但微生物分類不能區(qū)分中度和重度酒精性肝炎。在酒精性肝炎患者中，糞便中短鏈脂肪酸與產(chǎn)生SCFA的微生物菌群均減少，可以推斷出，酒精性肝炎患者的糞便微生物組有明顯的變化，與酒精性肝炎的嚴(yán)重程度無關(guān)。上海代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)特點(diǎn)

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