糞便代謝組分析，中文標題：二烯丙基二硫化物(DADS)通過調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象：小鼠糞便發(fā)表期刊：FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子：5.293發(fā)表時間：2022年1月7日合作單位：復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科運用生物技術：糞便代謝組分析（由鹿明生物提供技術支持）、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導的腸道白色念珠菌小鼠模型，模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結(jié)腸炎的嚴重程度，另一方面通過微生物組學和代謝組學等手段確認了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(diào)（改變腸道微生物群和代謝物）、腸道通透性和全身炎癥反應。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。非靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析 靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析。上海代謝組學檢測方法
土壤代謝物可以間接反映微生物代謝過程的變化，使用基于GC-MS的非靶向代謝組學，在土壤樣品***鑒定272種代謝物并對其進行非靶向代謝組學定量，定量結(jié)果表明AgNPs暴露***改變了土壤代謝物的分布。通過參數(shù)VIP>1.5，在土壤中鑒定出20種具有重要變化的代謝物（圖3I），除少數(shù)幾個代謝物上調(diào)，大多數(shù)代謝物減少，表明AgNPs暴露通常會對土壤微生物的代謝產(chǎn)生負面影響。土壤代謝組學可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上應對AgNPs并作出反應，包括毒性機制和***策略。浙江代謝組學測試價格基因組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學 。
LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究案例，中文標題：***通絡***通過***和抗氧化作用預防及延緩糖尿病視網(wǎng)膜病變發(fā)展的機制研究研究對象：大鼠發(fā)表期刊：Biomedicine&Pharmacotherapy影響因子：6.529發(fā)表時間：2022年2月合作單位：中國中醫(yī)科學院廣安門醫(yī)院運用生物技術：LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學（由鹿明生物提供技術支持)。文章通過對中藥***—***通絡方改善糖尿病病理方面的深入研究，表明在預防及***方面和微觀層面均起到了***效果。同時，也探究出***通絡方的內(nèi)在作用機制。也為糖尿病視網(wǎng)膜病變的早期***，提供***、有效的***方法。其中LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學有助于對中藥成分進行***的分析，為藥物機制提供參考。
GC-MS非靶向代謝組：隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注，本篇為2020年2月，南京大學環(huán)境學院課題組在Environmental Science & Technology雜志（IF=9.028）發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術對土壤微生物組和代謝組學分析技術的獨特結(jié)合，提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角，***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。標題：銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊：EnvironmentalScience&Technology影響因子：9.028發(fā)表時間：2020年2月合作單位：南京大學環(huán)境學院運用生物技術：16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組（由鹿明生物提供技術支持）。代謝組學-鹿明生物-歐易生物 以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象。
尿液代謝組學研究案例，空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析，其中GC-MS檢測102種代謝物，LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性，結(jié)果表明性別和季節(jié)對本研究的結(jié)果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明，Pu1和Po1之間的差異代謝物數(shù)量大于Po1和C之間的差異，LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物，體現(xiàn)出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物，使用綜合分析獲得候選差異代謝物，其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物，確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物，包括8種脂質(zhì)、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明，***富集到5種代謝通路，與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關。代謝組學分析 代謝組學檢測 代謝組學價格 代謝組學數(shù)據(jù)分析流程 。上海氣質(zhì)代謝組學數(shù)據(jù)庫
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非靶向代謝組學研究：對于代謝物分析，作者對非靶代謝組學測定，共檢測到4,346種代謝物。根據(jù)所有檢測到的代謝物的投影中變量重要性（VIP）>1和p<0.05的篩選標準，在不同的比較組***研究了961種差異累積代謝物（DAM）（表1）。在A果實(AF)與B果實(BF)的相同成熟階段，發(fā)現(xiàn)S3的DAM比S1和S2更豐富，這意味著DAM的主要變化發(fā)生在S3。隨后，利用京都基因和基因組百科全書（KEGG）富集分析進一步了解與兩個東方甜瓜品種相關的生物學機制。其中，參與蔗糖和有機酸代謝的代謝物在果實中的積累差異更大，包括“半乳糖代謝”、“磷酸戊糖途徑”、“果糖和甘露糖代謝”、“亞油酸代謝”和“花生四烯酸”。上海代謝組學檢測方法
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