福建分子蛋白組學

3篇經(jīng)典的蛋白組學和代謝組學在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展，同時可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎和技術支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學、代謝組學在其中起到什么作用呢？期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標題：CO2誘導的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細胞和蛋白質組學的綜合研究研究對象：牡蠣發(fā)表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：6.551合作單位：中國科學院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術：iTRAQ標記定量蛋白質組學（由鹿明生物提供技術支持）單細胞蛋白組學之質譜流式細胞技術。福建分子蛋白組學

文章使用TMT標記定量蛋白質組學的方法，分析鑒定了差異表達的蛋白質，對下調的蛋白質進行基因本體論(GO)分析，顯示下調參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM介導的銅依賴性線粒體復合物IV失活是SOX2/OCT4+群體中的主要代謝缺陷。研究結果確定了銅-代謝-轉移軸，并強調了其作為高危TNBC患者的下一代治療方法的潛力。蛋白質組學分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶，是線粒體ETC的終末酶。天津非標定量蛋白組學歐易鹿明生物蛋白質研究技術。

label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma，LUAD)是肺*的一種，屬于非小細胞*，早期一般沒有明顯的臨床癥狀，且易發(fā)生轉移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學的理解，加速了靶向***的進程。中國科學家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應的*旁組織（NAT）（樣本策略），利用基于質譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質組、磷酸化蛋白質組、轉錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關特征，如**相關蛋白變異、特有的蛋白質組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結果。

運用生物技術：磷酸化蛋白質組學（歐易鹿明提供）：2022年1月，***醫(yī)學研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員，廣西醫(yī)科大學附屬**醫(yī)院吳飛翔教授等為共同通訊作（一作：萬祿明、鄧永強、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天）在Nature Metabolism期刊發(fā)表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果，通過磷酸化蛋白質組學、LC-MS靶向代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)了一個全新的糖異生調控***——GP73，***會誘導GP73的產(chǎn)生和分泌，從而導致過度的糖異生。蛋白組+代謝組+脂質組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。

為了驗證TMT蛋白組學數(shù)據(jù)，作者選擇了18個與蓮種胚脫水保護功能密切相關的候選DEPs進行PRM蛋白靶向驗證。PRM鑒定了18個候選DEPs。這些蛋白質的表達模式在PRM和TMT的定量結果之間顯示出類似的趨勢。然而，PRM檢測到的蛋白豐度的倍數(shù)變化值要大于TMT數(shù)據(jù)。這一結果在很大程度上支持了TMT數(shù)據(jù)的可靠性。基于TMT標記定量蛋白質組學的生物信息學分析，對脅迫生理指標進行了測定，以驗證蓮種胚脫水的保護機制。在快速脫水階段，REC和MDA含量的變化與RWC相反，它們的水平迅速增加（圖6A，B）。ABA含量在快速脫水和脫水成熟階段前略有增加（圖6C）。上修飾蛋白質組試劑及服務，蛋白質組學解決方案。天津非標定量蛋白組學

歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。福建分子蛋白組學

TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎?。―KD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標志物。為優(yōu)化糖尿病腎?。―KD）管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標題：血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術支持)、ELISA福建分子蛋白組學

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