廣東蛋白組學 itraq

來源: 發(fā)布時間:2022-08-25

單細胞蛋白組學研究方法:2020年9月,加州大學的MinnieM.Sarwal課題組在FrontiersinMedicine發(fā)表的題為“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通過單細胞蛋白組學研究方法,分析正常人近端腎小管和腎小球區(qū)域的腎臟細胞,研究為解開急性和慢性腎臟疾病病因和腎臟亞細胞功能擾動提供依據(jù)。中文標題:正常人腎臟近端腎小管和腎小球的單細胞蛋白質(zhì)組學分析研究對象:人體腎臟組織發(fā)表期刊:FrontiersinMedicine影響因子:5.091發(fā)表時間:2020年9月運用重點組學技術(shù):單細胞蛋白質(zhì)組學技術(shù)蛋白組+代謝組+脂質(zhì)組-數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)。廣東蛋白組學 itraq

作者使用通過單細胞蛋白組學產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運輸和細胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學過程,細胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動蛋白細胞骨架是**豐富的細胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報導存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細胞蛋白組學結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。北京蛋白組學kegg分析蛋白質(zhì)組學測序 蛋白組學技術(shù)缺點。

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學結(jié)果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學分析,在短梯度下實現(xiàn)蛋白深度覆蓋。

通過蛋白質(zhì)組學+轉(zhuǎn)錄組學研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標題:大黃素通過抑制胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化減輕嚴重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時間:2021年10月合作單位:四川大學華西醫(yī)院運用生物技術(shù):TMT標記定量蛋白組學(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學蛋白組學—精選文章推薦。

TMT標記定量蛋白質(zhì)組學研究案例:2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學中心和紀念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過蛋白質(zhì)組學和代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細胞的離散亞群表現(xiàn)出細胞內(nèi)銅水平升高特征,探究了TM 介導的復合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸,為高風險三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù)。中文標題:銅耗竭調(diào)節(jié)線粒體氧化磷酸化以損害三陰性乳腺*轉(zhuǎn)移研究對象:高風險三陰性乳腺*(TNBC)發(fā)表期刊:NatureCommunications影響因子:14.919發(fā)表時間:2021年12月合作單位:紀念斯隆凱特琳**中心,Sandra和EdwardMeyer**中心運用關(guān)鍵生物技術(shù):TMT標記定量蛋白質(zhì)組學和靶向代謝組學蛋白質(zhì)組學生物標志物&機制研究一站式服務(wù)。吉林itraq 蛋白組學多少錢

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通過蛋白質(zhì)組學分析檢測了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs,在0、24和48小時各種基因的表達增加(圖2A)。此外,熱圖分析揭示了不同表達的功能基因,包括與炎癥、細胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時序分析表明,HBMECs中標記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān),增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進人腦微血管內(nèi)皮細胞的血管生成能力,因此初步驗證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達明顯增強(圖2I)。綜上所述,結(jié)果證實了M-Exos誘導了人腦微血管內(nèi)皮細胞的功能改變。廣東蛋白組學 itraq

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