運用生物技術(shù)：TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術(shù)支持：2021年12月，上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通過TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測蛋白靶向驗證(PRM)技術(shù)研究方法，構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護(hù)的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為揭示荷花種子長壽的脫水保護(hù)機制提供了新的見解。蛋白質(zhì)組學(xué)-鹿明生物丨歐易生物。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學(xué)
隨著美國臨床蛋白質(zhì)組**分析項目（CPTAC）和中國人類蛋白質(zhì)組計劃(CNHPP)等大型蛋白質(zhì)組學(xué)研究計劃的推進(jìn)，發(fā)表了一系列**的大規(guī)模人群多組學(xué)分析文章[2,3]。這些高分文章通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、微生物組學(xué)等技術(shù)，在上百例的病例樣本中***表征了某種**的分子特征。對比這些文章，可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析中逐漸成為**結(jié)果，且蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析有些共同特點，即：1）基于蛋白質(zhì)組進(jìn)行**分子分型2）分析不同亞型患者的臨床特征3）免疫、代謝、突變、微生物等**領(lǐng)域研究熱點在不同亞型中的差別分析4）篩選亞型特征分子作為預(yù)后標(biāo)志物或潛在的藥靶進(jìn)行驗證或機制研究該文是樊嘉院士/周虎研究員/高大明研究員/**教授團(tuán)隊繼2019年Cell發(fā)表的肝細(xì)胞*多組學(xué)研究后，同樣基于蛋白質(zhì)組為**的多組學(xué)聯(lián)合分析策略，進(jìn)一步闡釋了蛋白質(zhì)組學(xué)驅(qū)動精細(xì)醫(yī)學(xué)的優(yōu)勢，為**的發(fā)***展機制、分子分型、預(yù)后監(jiān)測和個性化***策略提供新思路。廣東蛋白組學(xué) 武漢靶向蛋白質(zhì)組學(xué)，信號通路蛋白靶點高通量分析。
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個下調(diào)，1548個上調(diào)），560個基因（430個下調(diào)，130個上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個上調(diào)，121個下調(diào)），AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個上調(diào)，95個下調(diào)）。
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。蛋白組學(xué)研究組織,血液,植物,尿液,動物,細(xì)胞樣品,酵母,微生物.。
DIA蛋白組學(xué)：SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病，其發(fā)病率低，表現(xiàn)形式多樣，診斷困難。2022年1月，由北京中醫(yī)藥大學(xué)課題組在J Proteomics.期刊發(fā)表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果，通過DIA蛋白組學(xué)研究方法，***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質(zhì)組譜，為疾病診斷提供了潛在的生物標(biāo)志物。同時作者發(fā)現(xiàn)補體系統(tǒng)抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達(dá)上調(diào)，這可能在SAPHO綜合征的發(fā)病機制中發(fā)揮重要作用。一站式服務(wù),蛋白組學(xué)研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。福建蛋白組學(xué)差異
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)簡介及應(yīng)用場景。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學(xué)
采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析，共鑒定了5,477個蛋白質(zhì)。對測試樣本進(jìn)行了PCA分析，結(jié)果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個試驗組之間共有815個差異表達(dá)蛋白。其中，198個（32%）和198個（26%）蛋白質(zhì)豐度增加，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。內(nèi)蒙古非靶向蛋白組學(xué)
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