中文標(biāo)題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機(jī)制:多組學(xué)提供的見解研究對象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學(xué)健康培養(yǎng)教育部重點(diǎn)實驗室,北京中醫(yī)藥大學(xué)健康栽培北京市重點(diǎn)實驗室,北京中醫(yī)藥大學(xué)科學(xué)技術(shù)系運(yùn)用組學(xué)關(guān)鍵技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DIA蛋白組學(xué)、PRM靶向蛋白驗證(皆由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)。目前,改善飲食被認(rèn)為是**安全有效的***和預(yù)防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強(qiáng)胰島素敏感性。因此,使用膳食補(bǔ)充劑和來自肉桂的化學(xué)物質(zhì)來控制血糖和血脂可能成為***代謝類疾病的新方法。蛋白組學(xué),研究方法,高通量定性定量研究,有。江蘇定量蛋白組學(xué)研究進(jìn)展
label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細(xì)胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發(fā)生轉(zhuǎn)移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學(xué)的理解,加速了靶向***的進(jìn)程。中國科學(xué)家選取了103例未經(jīng)***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應(yīng)的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質(zhì)譜的label-free蛋白定量策略進(jìn)行蛋白組學(xué)的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和全外顯子組測序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了**相關(guān)特征,如**相關(guān)蛋白變異、特有的蛋白質(zhì)組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結(jié)果。江蘇定量蛋白組學(xué)研究進(jìn)展蛋白驗證新技術(shù)-PRM,平行反應(yīng)監(jiān)視蛋白組學(xué)。
4D蛋白組學(xué):tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度(TIMS)和同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù),可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時,其配備了***一代雙 TIMS 分析器,離子容量可提高三倍,比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個新的臺階,鹿明生物同時配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實現(xiàn)蛋白深度覆蓋,結(jié)果更精細(xì),也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。更高掃描速度:助力臨床大隊列項目研究,更高覆蓋深度:助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量,超高靈敏度:助力微量樣本蛋白組分析,鑒定更可信:助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定。
作者使用通過單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過程,細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報導(dǎo)存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜檢測未知蛋白進(jìn)行全檢測。
4D蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),不同的病因和疾病的嚴(yán)重程度中蛋白表達(dá)存在差異。嚴(yán)重的疾病同急性期的蛋白的增加,補(bǔ)體系統(tǒng)蛋白及功能相關(guān)的蛋白相關(guān);通過COVID-19和健康組對比,發(fā)現(xiàn)了49%的差異分析物;和膿毒癥相比,G-CSF,IL-8等在嚴(yán)重的COVID-19患者中含量更低;蛋白和臨床相關(guān)性分析則發(fā)現(xiàn)臨床特征和某些蛋白呈強(qiáng)相關(guān)性。本研究通過4D蛋白組學(xué)技術(shù)結(jié)合其他組學(xué)技術(shù)及免疫技術(shù),確定了COVID-19免疫特征和宿主反應(yīng)等相關(guān)因素,并為進(jìn)一步COVID-19的***打下了良好的基礎(chǔ)。蛋白組學(xué)方案為組學(xué)研究涉及的樣本獲取,前處理,數(shù)據(jù)采集到分析的各個環(huán)節(jié)提供自動化。吉林水稻蛋白組學(xué)研究
蛋白質(zhì)組學(xué) 找歐易生物-生物標(biāo)志物、機(jī)制研究一站式服務(wù)。江蘇定量蛋白組學(xué)研究進(jìn)展
為了更好地了解DON對C2C12細(xì)胞分化的影響,作者進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的整合分析。共鑒定了149個共同的***差異基因(co-DEG),其中91%被共下調(diào)(圖3A)。15%的co-DEG屬于真核細(xì)胞骨架,其中大部分屬于肌動蛋白絲,少數(shù)是中間絲和微管的成分。對co-DEG進(jìn)行GO分析,生物學(xué)過程富集了“骨骼肌肌球蛋白粗絲組裝”和“快肌纖維收縮的正向調(diào)節(jié)”條目。細(xì)胞組分中富集的**個條目是“纖維蛋白原復(fù)合物”、“細(xì)胞外空間”、“細(xì)胞外基質(zhì)”、“細(xì)胞外區(qū)域”和“蛋白質(zhì)細(xì)胞外基質(zhì)”,這些都是細(xì)胞外成分(圖3B)。結(jié)果表明,DON主要影響肌肉成分的組成和功能以及多種細(xì)胞外成分的表達(dá)。通路富集分析富集到了“ECM-受體相互作用”、“蛋白質(zhì)消化和吸收”、“人**瘤病毒***”和“粘著斑”等通路。江蘇定量蛋白組學(xué)研究進(jìn)展
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