江蘇代謝組學(xué)的應(yīng)用并舉例

微生物16S rRNA測序+代謝組學(xué)研究：標(biāo)題：EphB6缺陷小鼠的腸道菌群通過介導(dǎo)維生素B6動態(tài)平衡調(diào)節(jié)孤獨癥行為期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*樣本類型：小鼠糞便、腦組織*檢測平臺：LC-MS非靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測自閉癥譜系障礙（ASD）是一種發(fā)育障礙，目前對孤獨癥的**癥狀的有效***很有限。ASD患者臨床研究證據(jù)表明，腸道菌群與ASD發(fā)展之間存在聯(lián)系，但腸道菌群與ASD的腦功能障礙（腸腦軸）聯(lián)系機(jī)制尚未完全闡明。在腸道穩(wěn)態(tài)起著重要作用的EphB6基因（位于7q號染色體，屬于受體酪氨酸激酶Eph家族），因基因突變和在ASD患者中表達(dá)下調(diào)，被認(rèn)為是ASD的候選基因。但尚不清楚EphB6在調(diào)節(jié)腸道菌群和ASD發(fā)生的作用機(jī)制。本研究中作者發(fā)現(xiàn)EphB6在功能上與ASD相關(guān)，并通過腸道菌群介導(dǎo)的維生素B6和多巴胺，調(diào)節(jié)患者自閉癥樣行為。作者建立了EphB6缺陷小鼠腸道菌群失調(diào)與內(nèi)側(cè)前額葉皮層（mPFC）（關(guān)鍵的腸腦功能軸）的興奮/抑制失衡之間的功能聯(lián)系。代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析教程 代謝組學(xué)一般測幾個樣。江蘇代謝組學(xué)的應(yīng)用并舉例

代謝組學(xué)研究：濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來，在中國白酒釀造行業(yè)中，人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質(zhì)量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學(xué)機(jī)制，以及這種變化與生產(chǎn)高質(zhì)量濃香白酒之間的聯(lián)系，本文對該釀造微生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行了***進(jìn)行了16S rRNA測序，蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)聯(lián)合分析。多組學(xué)方法能夠更***地了解高質(zhì)量濃香白酒生產(chǎn)過程中人工窖泥微生物群落發(fā)生的代謝過程變化，這將有助于進(jìn)一步優(yōu)化人工窖泥培養(yǎng)技術(shù)和改善濃香白酒的質(zhì)量。上海蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的結(jié)合代謝組學(xué) 生物標(biāo)志物挖掘**-歐易生物。

非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法，2021年7月，廣州多家研究機(jī)構(gòu)科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發(fā)表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果，該研究以****患者為研究對象，運用非靶向和靶向代謝組學(xué)研究方法，提供了****患者所有階段循環(huán)代謝物特征的綜合視圖，并確定糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重新編程是****的潛在病理機(jī)制；提出以宿主代謝為靶點可能是在病程不同階段對抗****的一種可行的方法。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究，2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《Frontiers in Microbiology》期刊發(fā)表的題為“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果，通過iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對香菇菌絲進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程，并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識。中文標(biāo)題：氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色形成的重要過程發(fā)表期刊：FrontiersinMicrobiology影響因子：5.64作者單位：上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品：iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)。代謝組學(xué)-歐易生物-鹿明生物-專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊-值得信賴。

代謝組學(xué)等多組學(xué)研究，2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對262例肝內(nèi)膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進(jìn)行了分析，通過繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。代謝組學(xué)研究技術(shù)與應(yīng)用、代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫。上海代謝組學(xué)數(shù)據(jù)驗證

代謝組學(xué) 尋找代謝物與生理病理的研究方式。江蘇代謝組學(xué)的應(yīng)用并舉例

GC-MS非靶向代謝組學(xué)yan'j2021年11月，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院馮麗萍教授課題組在Science of the Total Environment期刊發(fā)表了題為“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of  Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果，通過GC-MS非靶向代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了BPF暴露的腸道毒性的特征，探究了可能的發(fā)病機(jī)理。

中文標(biāo)題：轉(zhuǎn)錄組學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)揭示了雙酚F(BPF)暴露對腸道炎癥的影響研究對象：人結(jié)腸粘膜上皮細(xì)胞系(NCM460)發(fā)表期刊：ScienceoftheTotalEnvironment影響因子：7.963發(fā)表時間：2021年11月合作單位：上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院運用生物技術(shù)：GC-MS非靶向代謝組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、qRT-PCR 江蘇代謝組學(xué)的應(yīng)用并舉例

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