遼寧研究蛋白組學(xué)的方法

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-20

文章使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,分析鑒定了差異表達(dá)的蛋白質(zhì),對(duì)下調(diào)的蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體論(GO)分析,顯示下調(diào)參與線粒體電子傳遞鏈(ETC)的途徑富集,證明了TM處理特別影響了具有較高細(xì)胞內(nèi)銅水平的SOX2/OCT4+細(xì)胞中的線粒體ETC途徑。確定TM介導(dǎo)的銅依賴性線粒體復(fù)合物IV失活是SOX2/OCT4+群體中的主要代謝缺陷。研究結(jié)果確定了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸,并強(qiáng)調(diào)了其作為高危TNBC患者的下一代治療方法的潛力。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線粒體功能的途徑。細(xì)胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,是線粒體ETC的終末酶。靶向蛋白質(zhì)組學(xué),信號(hào)通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。遼寧研究蛋白組學(xué)的方法

通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過(guò)抑制代謝通路來(lái)減少肺泡巨噬細(xì)胞的活化和改善肺部炎癥的特征,探究了外泌體在參與炎癥相關(guān)***損傷中的重要作用,為大黃素可以通過(guò)減少胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化來(lái)減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標(biāo)題:大黃素通過(guò)抑制胰腺外泌體介導(dǎo)的肺泡巨噬細(xì)胞活化減輕嚴(yán)重急性胰腺炎相關(guān)的急性肺損傷研究對(duì)象:大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊:ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子:11.413發(fā)表時(shí)間:2021年10月合作單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)浙江蛋白組學(xué)方法蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對(duì)測(cè)試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個(gè)新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測(cè)靈敏度,帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測(cè)。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì),也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。蛋白質(zhì)組學(xué)的特點(diǎn)蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。

TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過(guò)TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹(shù)根部響應(yīng)的差異表達(dá)蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見(jiàn)解,為茶樹(shù)翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。一站式服務(wù),蛋白組學(xué)研究不同生物體在不同時(shí)刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達(dá)的變化。遼寧研究蛋白組學(xué)的方法

單細(xì)胞蛋白組學(xué)之質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)。遼寧研究蛋白組學(xué)的方法

蛋白質(zhì)磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)特定氨基酸上的過(guò)程,是生物體內(nèi)**為常見(jiàn)、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是一個(gè)瞬時(shí)且可逆的過(guò)程,通過(guò)磷酸化修飾可以改變蛋白質(zhì)空間構(gòu)象,從而影響蛋白質(zhì)的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來(lái),一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域,是國(guó)內(nèi)早期開(kāi)展以蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。影響因子:13.511發(fā)表時(shí)間:2022-01-06發(fā)表單位:***醫(yī)學(xué)研究院生物工程研究所運(yùn)用生物技術(shù):磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(歐易鹿明提供)、LC-MS靶向代謝組學(xué)遼寧研究蛋白組學(xué)的方法

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司。公司業(yè)務(wù)涵蓋科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),還有一批專業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。歐易生物憑借創(chuàng)新的產(chǎn)品、專業(yè)的服務(wù)、眾多的成功案例積累起來(lái)的聲譽(yù)和口碑,讓企業(yè)發(fā)展再上新高。