浙江代謝組學(xué)能做什么

來源: 發(fā)布時間:2022-06-06

GC-MS非靶向代謝組研究,隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進(jìn)入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學(xué)家的***關(guān)注,本篇為2020年2月,南京大學(xué)趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運(yùn)用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對土壤微生物組和代謝組學(xué)分析技術(shù)的獨特結(jié)合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。聚焦于代謝產(chǎn)物研究,采用高精尖的分析儀器,對細(xì)胞內(nèi)的代謝物進(jìn)行定性和定量分析。浙江代謝組學(xué)能做什么

糞便代謝組分析,中文標(biāo)題:二烯丙基二硫化物(DADS)通過調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護(hù)小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象:小鼠糞便發(fā)表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子:5.293發(fā)表時間:2022年1月7日合作單位:復(fù)旦大學(xué)上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學(xué)科運(yùn)用生物技術(shù):糞便代謝組分析(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導(dǎo)的腸道白色念珠菌小鼠模型,模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強(qiáng) DSS 結(jié)腸炎的嚴(yán)重程度,另一方面通過微生物組學(xué)和代謝組學(xué)等手段確認(rèn)了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(diào)(改變腸道微生物群和代謝物)、腸道通透性和全身炎癥反應(yīng)。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。上海氨基酸代謝組學(xué)代謝組學(xué) 研究一站式服務(wù)平臺-專業(yè)代謝組學(xué)研究。

非靶向代謝組學(xué)研究:通過在三個成熟階段收獲兩個東方甜瓜品種的果實作者使用非靶代謝組學(xué)聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機(jī)酸在轉(zhuǎn)錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項研究運(yùn)用多組學(xué)技術(shù)聯(lián)合揭示了兩個品種成熟過程中關(guān)鍵的代謝和轉(zhuǎn)錄特征。在本研究中,通過代謝和轉(zhuǎn)錄組分析的綜合分析,研究了控制兩個東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機(jī)酸代謝的基因網(wǎng)絡(luò)。篩選了與糖和有機(jī)酸代謝相關(guān)的關(guān)鍵代謝物和候選基因,并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結(jié)果提高了對決定甜瓜發(fā)育和成熟過程中糖和有機(jī)酸積累和代謝的分子機(jī)制的理解。

頂空GC-MS代謝組學(xué),中文標(biāo)題:利用BADH2新等位基因生產(chǎn)芳香三系雜交稻研究對象:水稻發(fā)表期刊:PlantBiotechnologyJournal影響因子:9.803發(fā)表時間:2021.08.31發(fā)表單位:中國水稻研究所運(yùn)用生物技術(shù):GC-MS頂空代謝組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、基因編輯技術(shù)香味是決定稻米烹飪和食用特性的獨特和關(guān)鍵指標(biāo)之一。2021年8月,中國水稻研究所胡培松院士團(tuán)隊在PlantBiotechnologyJournal期刊發(fā)表的研究成果,依靠GC-MS頂空代謝組學(xué)的平臺對BADH2等位基因系成熟籽粒進(jìn)行性狀分析。研究新型BADH2等位基因生產(chǎn)芳香雜交水稻機(jī)理,加快了水稻品種香味研究改良進(jìn)程。鹿明生物頂空GC-MS代謝組學(xué)測定技術(shù)還可用于茶葉、花卉以及各種農(nóng)產(chǎn)品中酚類、酯類、醇類等揮發(fā)類代謝物使揮發(fā)性物質(zhì)成分檢測。常用的代謝組學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。

GC-MS代謝組學(xué)結(jié)果:通過GC-MS代謝組學(xué)觀察到 92種化合物,其中,49種與數(shù)據(jù)庫中可用的化合物相匹配,包括重要的發(fā)酵代謝物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和幾種 (n=10) 初級氨基酸。NMR也觀察到了七種已鑒定的化合物。通過 GC-MS 測量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸濃度隨溫度處理而變化,隨著溫度的升高,通常趨向于更高的糖濃度和更低的游離氨基酸濃度(圖 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一個明顯的例外,在濃度與溫度處理中觀察到了積極的趨勢(圖 3)。此外,與植物應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羥基-3-甲氧基苯甲酸)隨溫度升高而增加(SI 附錄,圖 S5)。代謝組學(xué)——研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。浙江代謝組學(xué)數(shù)據(jù)預(yù)處理

歐易生物/鹿明生物提供專業(yè)的靶向代謝組學(xué)服務(wù)。浙江代謝組學(xué)能做什么

代謝組學(xué)研究:浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風(fēng)險評估研究團(tuán)隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學(xué)在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應(yīng)機(jī)制研究中取得新進(jìn)展,作者:楊桂玲,王彥華,李健,王豆,鮑志偉,王強(qiáng)(通訊作者),靳遠(yuǎn)詳(共同通訊作者),在Journal of Hazardous Materials期刊發(fā)表了題為“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通過代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)的多組學(xué)整合分析技術(shù)來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復(fù)雜病理生理和毒性通路。浙江代謝組學(xué)能做什么

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