上海血漿蛋白組學(xué)

來源: 發(fā)布時間:2022-06-01

作者進(jìn)行了綜合分析,將蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)中的***生物標(biāo)志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉(zhuǎn)化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結(jié)合蛋白質(zhì)和代謝標(biāo)志物來預(yù)測DKD狀態(tài)。五種機(jī)器學(xué)習(xí)模型表明,組合模型提高了DKD預(yù)測的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結(jié)果??偟膩碚f,組合多組學(xué)標(biāo)志物模型是一種強(qiáng)有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學(xué)結(jié)果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進(jìn)展的潛在生物標(biāo)志物。2.代謝組學(xué)結(jié)果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預(yù)測DKD的**標(biāo)志物。3.蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)的組合可以提高預(yù)測和診斷DKD的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學(xué)的生物標(biāo)志物可用于DKD的預(yù)警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數(shù)據(jù)資源。label free蛋白組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)原理。上海血漿蛋白組學(xué)

蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例:2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)對成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。天津蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析修飾蛋白質(zhì)組試劑及服務(wù),蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案。

作者使用通過單細(xì)胞蛋白組學(xué)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)來觀察在腎小球細(xì)胞或近端腎小管中***豐富的蛋白質(zhì)細(xì)胞。208個Glom富集區(qū)蛋白富含囊泡中間運(yùn)輸和細(xì)胞成分組織調(diào)節(jié)作為其**重要的生物學(xué)過程,細(xì)胞骨架蛋白結(jié)合和肌動蛋白結(jié)合是**重要的分子功能,肌動蛋白細(xì)胞骨架是**豐富的細(xì)胞成分。富含247個PT的蛋白質(zhì)主要集中在小分子代謝過程和藥物代謝過程中。在**重要的分子功能中,這些蛋白質(zhì)的氧化還原酶活性和催化活性豐富。*在GLOM切片中發(fā)現(xiàn)的67種蛋白質(zhì)中,有41種已被報導(dǎo)存在于腎臟中,在這41種蛋白質(zhì)中,18種(43.9%)與單細(xì)胞蛋白組學(xué)結(jié)果一致,23種(56.1%)在GLOM中與小管相比沒有增加。

2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持。蛋白組學(xué)技術(shù)對腎錯構(gòu)瘤尿液差異蛋白的研究。

蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析鑒定出了幾種參與肝葡萄糖脂代謝的蛋白質(zhì)(ACC、FASN、SCD1、CPT1A、GLUT2、GK、GS、G6Pase、PEPCK)。此外,AC顯示出抑制脂肪生成酶(ACC,F(xiàn)ASN和SCD1)表達(dá)的趨勢,同時***上調(diào)了GLUT2。與對照組相比,AC***增加了PEPCK的表達(dá),兩種化學(xué)物質(zhì)對G6Pase均無***影響(圖4A)。PRM蛋白靶向驗(yàn)證測定結(jié)果與蛋白質(zhì)組變化相一致,這進(jìn)一步證實(shí)了蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)中蛋白質(zhì)的表達(dá)(圖4B)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析結(jié)果顯示AC和AL***改善了線粒體功能。GSEA分析顯示,處理組的氧化磷酸化(OXPHOS)通路***上調(diào),AC組和AL組的富集得分分別為0.826和0.535。歐易生物鹿明生物蛋白組學(xué)聯(lián)合分析。福建蛋白組學(xué)的應(yīng)用

單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。上海血漿蛋白組學(xué)

綜上所述,本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外,作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機(jī)制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化,其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量,對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討。結(jié)果表明,黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。上海血漿蛋白組學(xué)

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