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2021 年 1 月,山東大學(xué)齊魯醫(yī)院泌尿外科李巖老師發(fā)表了小鼠膀胱尿路上皮細胞圖譜和上皮亞群分化特征的相關(guān)成果,文章的 10x Genomics 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序?qū)嶒灪头治龉ぷ饔蓺W易生物提供。該研究對小鼠的膀胱上皮進行了高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,繪制了小鼠膀胱尿路上皮細胞圖譜,發(fā)現(xiàn)了一種可能與宿主反應(yīng)和傷口愈合有關(guān)的新型 Plxna4+ 膀胱尿路上皮細胞,以及一群由 ASPM 標記的基底樣細胞,可能是膀胱尿路上皮祖細胞。通過 SCENIC 分析確定了調(diào)控尿路上皮細胞分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)了膀胱疾病相關(guān)調(diào)控基因在不同尿路上皮細胞亞群中存在差異表達。該研究解析了小鼠膀胱尿路上皮細胞的特征,為膀胱尿路上皮和膀胱疾病的相關(guān)研究提供生物學(xué)基礎(chǔ)。單細胞蛋白組和代謝組受制于質(zhì)譜儀器的靈敏度,目前還存在一定的難度。上海包含什么單細胞測序
子宮內(nèi)膜異位癥是一種常見的、良性的婦科疾病,與盆腔疼痛和不孕有關(guān),其特征是異位子宮內(nèi)膜樣組織常被月經(jīng)周期***改變。該病影響全球6% - 10%的女性人口,主要是育齡女性。此外,其高度可變的癥狀使診斷具有挑戰(zhàn)性,經(jīng)常導(dǎo)致誤診。目前尚無有效的***措施,主要原因是其病因和發(fā)病機制尚不明確。本研究作者通過scRNA-seq技術(shù)進行分析,從包括來自子宮內(nèi)膜異位癥女性的異位子宮內(nèi)膜、正位子宮內(nèi)膜和來自健康女性的正常子宮內(nèi)膜三組樣本中提取了大約55,000個單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以創(chuàng)建一個子宮內(nèi)膜異位癥的單細胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。上海有什么單細胞測序目前已在動物組織單細胞測序中有所應(yīng)用,那么能不能把轉(zhuǎn)錄抑制劑也應(yīng)用于植物原生質(zhì)體解離及測序中呢?
2021年3月30日,暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院舉行了“單細胞聯(lián)合實驗室”的簽約儀式。簽約儀式由暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院院長尹芝南教授主持,生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院郝健磊副研究員、上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司營銷副總經(jīng)理董棟先生和單細胞事業(yè)部總經(jīng)理張志明先生等人出席簽約儀式。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司、暨南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究院攜手成立的單細胞聯(lián)合實驗室,旨在促進單細胞技術(shù)在科研領(lǐng)域的深入應(yīng)用,惠及更多的研究工作者,加強產(chǎn)學(xué)研合作,推動科技成果產(chǎn)業(yè)化
單細胞懸液制備難于標準化。
基于酶學(xué)的樣本處理方法,大都會存在一定程度的解離偏好性,即不同的酶處理不同的組織往往會有不太一樣的「效果」,而這種效果不僅*反應(yīng)在細胞得率,細胞活性和細胞碎片等參數(shù)上,往往也會在**終細胞類型有所反映,比如可能會導(dǎo)致部分稀有細胞的丟失,細胞比例的失真等,從而偏離組織的真實狀態(tài)。另外,細胞懸液的制備過程較長,通常需要3-5小時,這個過程會導(dǎo)致細胞處于「應(yīng)激狀態(tài)」中,轉(zhuǎn)錄的過程可能已經(jīng)發(fā)生變化,偏離臨床實驗的終點設(shè)計,會對結(jié)果的判斷造成一定的影響。針對如上問題,歐易團隊從已發(fā)表的高影響力的文獻中,匯總出針對不同類型組織的處理方法,確保實驗結(jié)果與文獻并軌(同頻)。對于應(yīng)激問題,我們也開發(fā)出了低溫解離方法,使樣本始終處于「休眠」狀態(tài),從而保證了樣本符合臨床取樣終點,還原其生物學(xué)的真實狀態(tài)。另外細胞核測序也是一個替代的選擇,對樣本的要求較低,可以解鎖大量臨床信息明確、低溫冷凍的標本。細胞核制備也不依賴于酶學(xué),全程在低溫環(huán)境,也能真實還原樣本的臨床狀態(tài)。歐易在細胞核測序的核懸液準備上積累了很多經(jīng)驗。 未來 3-5 年將持續(xù)加大單細胞技術(shù)的服務(wù)廣度,拓展單細胞基因組、單細胞表觀組等多組學(xué)的產(chǎn)品應(yīng)用。
歐易生物是國內(nèi)**早開展單細胞測序分析的公司之一。目前擁有10x Genomics及BD Rhapsody兩個單細胞測序平臺,以及完整、系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析技術(shù)和流程。除了能夠進行常規(guī)的scRNA-seq(single-cell RNA sequencing),還能夠進行凍存樣本的snRNA-seq(single-nucleus RNA sequencing),為各種類型生物樣本進行單細胞測序提供了系統(tǒng)、完整的解決方案。竭誠為廣大制藥行業(yè)客戶提供高質(zhì)量的單細胞測序服務(wù),助力您加快藥物研發(fā)進程、降低臨床試驗風(fēng)險、節(jié)約研發(fā)成本。歐易生物單細胞事業(yè)部致力于為廣大科研工作者提供周到、貼心、專業(yè)的技術(shù)服務(wù),專注于以口碑鑄就品牌形象。黑龍江是什么單細胞測序
10.目前認知下的制備單細胞懸液需要將組織置于37℃保溫,以便蛋白酶發(fā)揮作用。上海包含什么單細胞測序
(2)基因檢出率低當前主流的單細胞平臺對基因的捕獲效率較低,常見的臨床標本,可檢測到的基因中位值在1-5k不等,占總基因數(shù)的10-20%。低豐度的基因往往捕獲不到。
(3)測序數(shù)據(jù)的高背景單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞RNA含量很少,擴增和捕獲效率的微小變化,就可能在細胞間產(chǎn)生與生物學(xué)無關(guān)的巨大差異。批次效應(yīng)處理是單細胞數(shù)據(jù)分析中必須考慮的因素之一。在不同日期制備的相似樣本,可能會因為純粹的技術(shù)原因而不盡相同,矯正和過矯正也仍是數(shù)據(jù)處理中非常棘手的一件事情。 上海包含什么單細胞測序
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢,是醫(yī)藥健康的主力軍。歐易生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點,以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務(wù)。歐易生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時代,對自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。