廣東全自動多重數(shù)字PCR市場前景

來源: 發(fā)布時間:2023-06-18

數(shù)字PCR實驗步驟包括:1)試劑配制:將10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探針、無核酸酶水混合成dPCR預混液,并分裝到8聯(lián)排管中或96孔板中;將各待測樣本的核酸模板、陽性對照、陰性對照分別加入相應的8聯(lián)排管中或96孔板中;2)芯片進樣:在小海龜BioDigital·青全自動樣品處理系統(tǒng)上進行芯片上反應液進樣和液滴生成;3)芯片擴增:在小海龜BioDigital·青PCR擴增儀上進行芯片上PCR擴增反應;4)芯片閱讀:在小海龜BioDigital·青生物芯片閱讀儀上進行芯片上熒光信號閱讀;5)數(shù)據(jù)分析:使用生物芯片數(shù)據(jù)分析·青軟件進行數(shù)據(jù)分析和報告導出;在使用dPCR進行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。廣東全自動多重數(shù)字PCR市場前景

基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術(shù),將樣品平均分配到20000個微滴油包水中,利用微滴分析儀對微滴進行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅(qū)動下,將每個標準反應體系分割成包含100萬至1000萬個皮升級別微滴的反應乳液。數(shù)字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數(shù)字PCR,其原理都是有限稀釋,終點PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標準PCR反應體系,平均分配成幾萬個PCR反應,分配到芯片或微滴中,使每個反應中盡可能含有一個模板分子,進行單分子模板PCR反應,通過讀取熒光信號的有或無進行計數(shù),經(jīng)過統(tǒng)計學泊松分布的校準進行定量。華南地區(qū)雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR樣品回收我國數(shù)字PCR市場的整體規(guī)模、公司影響力、行業(yè)話語權(quán)等也將迎來進一步提升,從而助推行業(yè)高質(zhì)量創(chuàng)新發(fā)展。

基于數(shù)字PCR技術(shù)平臺,塔歌生物成功地開發(fā)了胎兒染色體非整倍體(T21,T18和T13)無創(chuàng)產(chǎn)前篩查試劑盒(數(shù)字PCR-NIPT),并已完成數(shù)百例臨床樣本驗證。數(shù)字PCR-NIPT的陽性檢出率和NGS相似,且成本接近血清學,可以在上述應急策略中取代血清學作為靈敏度和特異性更高的初篩方法,以有效提高陽性檢出率,降低需要復篩的假陽性樣本數(shù)和節(jié)省總的篩查成本。數(shù)字PCR應用前景廣闊,可用于病原微生物檢測、基因檢測、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測序結(jié)果驗證等領(lǐng)域。但目前,大多數(shù)醫(yī)院采購的數(shù)字PCR儀器是用于科研層面,在臨床應用上仍處于起步階段,未得到普遍應用。

了解泊松分布,我們先要從二項式分布說起,二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標實體隨機“投擲”到一組分區(qū)中,當目標落在選定的分區(qū)中時,就是成功。如果有n個分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機的,則目標出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗重復m次,樣品中的每個分子一次。如下所示的二項式分布給出了k個成功的概率,即所選分區(qū)恰好包含k個分子的概率。數(shù)字PCR通常采用大量分區(qū)。當n很大,并且嘗試成功的概率(1/n)很小時,二項分布可以近似為泊松分布。數(shù)字PCR具有諸多優(yōu)點,但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復雜、經(jīng)濟效益低等。

現(xiàn)有dPCR分析方法采用熒光探針和基于光的檢測方法來鑒定擴增產(chǎn)物。這些方法要求足夠的靶分子擴增以產(chǎn)生足以被檢測到的信號,但可能會導致額外的錯誤或偏差,因此,希望能夠提供一種改進的、用于檢測樣品內(nèi)感興趣的核酸的方法,其采用替代性分析方法,具有提高的準確度和精確度,并且其具有可以與基于dPCR的方法關(guān)聯(lián)使用的靈敏度。dPCR還在樣品內(nèi)進行單一反應,但是所述樣品被分離成大量的分區(qū)(partition),并且所述反應在每個分區(qū)中單獨進行。這種分離允許對核酸量進行靈敏的測量。DPCR已被證明可有效用于研究基因序列中的變異,例如拷貝數(shù)變異或點突變。影響dPCR定量結(jié)果的因素:儀器采用的分散方式與數(shù)量、溶液稀釋方法、分散體積的準確性以及結(jié)果表達方式。廣州醫(yī)療系統(tǒng)認證數(shù)字PCR性能特點

dPCR的測量結(jié)果通常表示為含量,即拷貝數(shù)轉(zhuǎn)基因質(zhì)量百分比,而QPCR結(jié)果通常表示為拷貝數(shù)的質(zhì)量分數(shù)。廣東全自動多重數(shù)字PCR市場前景

在使用dPCR進行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。使用不同技術(shù)對相同樣品檢測時,兩種方法的靈敏度是否具有可比性成為關(guān)注的問題。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765個微單元)芯片數(shù)字PCR分析儀測定標準物質(zhì)ERM-AD413檢測轉(zhuǎn)基因玉米MON810。該小組應用dPCR技術(shù)評估在qPCR定義下的靈敏度數(shù)值,在拷貝數(shù)200-700之間,dPCR與qPCR的測量結(jié)果具有一致性。但與qPCR的靈敏度相比,dPCR在低于拷貝數(shù)200時有被低估的風險,在高于拷貝數(shù)1000時有被高估的風險。dPCR在同一陣列上同時測量轉(zhuǎn)基因和內(nèi)源性靶點時,需要稀釋內(nèi)源性靶點和轉(zhuǎn)基因靶點在合理拷貝數(shù)范圍內(nèi)以保證dPCR測量結(jié)果的準確性。廣東全自動多重數(shù)字PCR市場前景

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