法國數(shù)字PCR

來源: 發(fā)布時間:2023-06-17

20世紀(jì)末,Vogelstein等提出數(shù)字PCR(digitalPCR,dPCR)的概念,通過將一個樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應(yīng)單元,每個單元至少包含一個拷貝的目標(biāo)分子(DNA模板),在每個反應(yīng)單元中分別對目標(biāo)分子進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后對各個反應(yīng)單元的熒光信號進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。PCR實際上是一個在模板DNA、引物(模板片段兩端的已知序列)和四種脫氧核苷酸等存在的情況下,DNA聚合酶依賴的酶促合成反應(yīng),擴(kuò)增的特異性取決于引物與模板DNA的特異結(jié)合。在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊證的申報。法國數(shù)字PCR

常規(guī)PCR和實時熒光PCR定量檢測都需要已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA制定標(biāo)準(zhǔn)曲線,由于樣品測定在各種條件上不會完全一致,會造成PCR擴(kuò)增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而ddPCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增動力學(xué)影響,可以進(jìn)行定量。如何在雙通道設(shè)置及雙探針標(biāo)記的情況下實現(xiàn)多重檢測?不同位點的雙探針檢測體系中引物和探針采用不同的終濃度,這樣陽性微滴的終點FAM/HEX熒光信號強(qiáng)度就會不同,利用陽性微滴不同的“分簇(cluster)”來區(qū)分不同的突變位點。采用對應(yīng)的KRAS野生型和突變型細(xì)胞系對雙重ddPCR檢測體系的性能進(jìn)行驗證。結(jié)果顯示除了Q61H位點外,其他位點的檢測體系在54C的情況下均能很好的區(qū)分4個明顯的cluster。廣州臻準(zhǔn)數(shù)字PCR市場前景數(shù)字PCR作為研發(fā)階段的驗證方案之一。

dPCR的結(jié)果統(tǒng)計方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,通過不同檢測通道分辨不同顏色和強(qiáng)度,再根據(jù)分散液滴的數(shù)量計算待測基因的含量;另一種采用概率統(tǒng)計的數(shù)據(jù)處理方法,即通過泊松分布的方法對結(jié)果進(jìn)行分析。應(yīng)用概率統(tǒng)計分析數(shù)據(jù)和對數(shù)據(jù)處理方法的模型直接關(guān)系著結(jié)果的準(zhǔn)確性和分析時間的長短。常用的統(tǒng)計方法是假設(shè)每個微反應(yīng)單元的體積相同,根據(jù)泊松統(tǒng)計計算拷貝數(shù),公式為:M=-Vx1n(1-x/)其中M是目標(biāo)總拷貝數(shù)量;V是微反應(yīng)單元數(shù)量;x是發(fā)光的微反應(yīng)單元數(shù)量。

目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品,包括微孔板,毛細(xì)管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設(shè)分子種群遵循泊松分布來估計不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應(yīng)體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計算,從而解決了多個目標(biāo)分子存在于單個液滴中的可能性。數(shù)字以靈敏度和準(zhǔn)確度測量突變的變異程度、檢測稀有的DNA靶拷貝以及解析拷貝數(shù)變?異狀態(tài)。

微滴數(shù)字PCR主要是將兩種互不相溶的液體,以其中一種作為連續(xù)相(油),另一種作為分散相(水),在水/油兩相表面張力和剪切共同作用下分散相以微小體積單元的形式存在于連續(xù)中,從而成液滴。這種液滴式的反應(yīng)腔室具有體積小、樣品間無擴(kuò)散等優(yōu)勢。在ddPCR中,利用微滴發(fā)生器可以一次生成數(shù)萬乃至百萬個納升甚至皮升級別的單個油包水微滴,作為數(shù)字PCR的樣品分散載體。這里,液滴中包裹了單拷貝DNA模板和PCR反應(yīng)液,然后將液滴收集在PCR反應(yīng)管中進(jìn)行擴(kuò)增。?PCR反應(yīng)結(jié)束后檢測每個微滴的熒光信號。目前Bio-Rad公司的QX100系統(tǒng)、QX200系統(tǒng)均為采用液滴技術(shù)的數(shù)字PCR系統(tǒng)。圖6.Bio-Rad的液滴數(shù)字PCR系統(tǒng)數(shù)字PCR主要采用當(dāng)前分析化學(xué)熱門研究領(lǐng)域的微流控或微滴化方法。德國國產(chǎn)數(shù)字PCR價格

Drop-off數(shù)字PCR檢測方法的**主要優(yōu)勢是能夠能夠在一個反應(yīng)中檢測到基因組序列范圍短的同源基因突變。法國數(shù)字PCR

數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀屬于技術(shù)密集型行業(yè),行業(yè)附加值較高,能夠體現(xiàn)一個地區(qū)綜合技術(shù)水平。我國十分重視精細(xì)化工行業(yè)的發(fā)展,目前精細(xì)化工行業(yè)已經(jīng)成為化工產(chǎn)業(yè)的重要發(fā)展方向之一,近年來我國精細(xì)化工行業(yè)已取得較大的發(fā)展。精細(xì)化工在生產(chǎn)過程中會產(chǎn)生廢水、廢氣、固體廢物等有害物質(zhì),企業(yè)需加入大量資本用于這些有害物質(zhì)的治理,使服務(wù)型企業(yè)生產(chǎn)符合我國環(huán)境保護(hù)標(biāo)準(zhǔn)。隨著我國環(huán)境保護(hù)標(biāo)準(zhǔn)日益提高,企業(yè)必須持續(xù)加大污染物處理技術(shù)研發(fā)、環(huán)境保護(hù)設(shè)施加入和污染物處置力度。隨著我國經(jīng)濟(jì)的穩(wěn)定增長、工業(yè)化及信息化進(jìn)程的不斷深入、銷售企業(yè)結(jié)構(gòu)的調(diào)整升級,尤其是我國對精細(xì)化工行業(yè)的高度重視,2020年我國精細(xì)化工行業(yè)將迎來良好機(jī)遇和廣闊空間。與基礎(chǔ)化工行業(yè)相比,精細(xì)化工行業(yè)主要生產(chǎn)精細(xì)化學(xué)品,是在基礎(chǔ)化學(xué)品的基礎(chǔ)上深加工的產(chǎn)物,行業(yè)內(nèi)產(chǎn)品覆蓋了社會生活的各個方面,從涂料、電子、油墨、醫(yī)藥、造紙、食品添加劑等,到航空航天、汽車、機(jī)械、建筑新材料、新能源技術(shù)等高新技術(shù)方面均得到非常普遍的應(yīng)用,在國民經(jīng)濟(jì)的發(fā)展中起到了不可替代的作用。由于精細(xì)化工產(chǎn)業(yè)在國民經(jīng)濟(jì)、地區(qū)產(chǎn)業(yè)中的重要作用,其發(fā)展程度也被視為地區(qū)戰(zhàn)略發(fā)展的重要部分。法國數(shù)字PCR

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