qPCR的熒光標記方法分為以SYBR Green I染料法為主的熒光染料嵌合法,以Taqman探針法為主的熒光探針法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬滅染料引物法。SYBR Green I 是高靈敏度的非特異性雙鏈DNA熒光染料,具有綠色激發(fā)波長。它以非特異性方式結(jié)合在dsDNA雙螺旋小溝區(qū)域。游離的SYBR Green I 只發(fā)出極弱的熒光信號,PCR過程中,當擴增生成dsDNA時,SYBR Green I 逐漸與dsDNA結(jié)合,熒光信號被千倍放大,熒光信號的強度與擴增得到的dsDNA的濃度成正比。熒光信號被儀器檢測并采集得到“擴增曲線”,通過熒光信號的強度反映出體系中dsDNA的濃度。為了增加qPCR實驗可靠性、重復性,需要制定統(tǒng)一的實驗標準來進行規(guī)范。上??焖賟PCR儀消毒
原理:在DNA擴增反應中,通過熒光化學物質(zhì)測定每次PCR循環(huán)后產(chǎn)物總量。目的:實現(xiàn)定量而不止是定性分析。通過與內(nèi)參基因進行對比,對樣品中的特定基因進行相對表達量的計算,以實現(xiàn)定量分析。qPCR的檢測方法有兩種,SYBRGreenl法和TaqMan探針法,下面介紹常用的SYBRGreenl法。原理:在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,使其特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。試劑及儀器:Hieff®QpcrSYBR®GreenMasterMix試劑(翌圣)和ABI7500Real-TimeSystem實時熒光定量PCR儀進行qRT-PCR擴增。上海快速qPCR儀消毒qPCR只能實現(xiàn)相對定量,即必須使用標準品生成標準曲線,才能進行定量。
PCR:Polymerase chain reaction. 是體外模擬生物的DNA 復制。需要DNA 聚合酶,DNA 模板,兩端引物,脫氧核苷酸dNTPs( dATP, ACTP, dGTP, dTTP),以及適當?shù)木彌_體系。PCR 產(chǎn)物的增長形式為2N (如果各種試劑和外部所加條件均理想化,N 是循環(huán)數(shù))。實際中,擴增效率不為100%。Real time PCR 是定量PCR 的一種,當然是在PCR 的基礎上發(fā)展出來的。(普通)PCR 包含很多因素,屬性,如:試劑,溫度,循環(huán)數(shù),程序,PCR 產(chǎn)物(擴增子,amplicon)的量,擴增曲線(擴增子累積曲線),摻錯率,擴增子長度。一般來說,人們關(guān)心的是擴增子的量。而real time PCR 主要利用的是擴增曲線(amplification curve), 循環(huán)數(shù);擴增子長度,擴增效率,擴增子多少,也加以考慮。
Quantagene q225 系列熒光定量PCR 系統(tǒng)主要特點:精確定量 以可靠的數(shù)據(jù)助力您的研究。采用擬合算法計算 Ct 值,定量誤差不超過±10%。液體冷卻循環(huán)系統(tǒng)確??组g溫度高度一致,溫差不超過 ±0.15°C。光學系統(tǒng)無運動部件,穩(wěn)定性增加,長期使用無需校準與維護。的儀器間重復性,不同位置、不同反應體積均不影響定量結(jié)果。快速高效 用更短的時間獲得更多數(shù)據(jù)。40 個循環(huán)的常規(guī) qPCR 只需43 分鐘,較常見qPCR 儀多縮短60% 的時間。在提高速度的同時保持了96 孔的高通量,滿足絕大多數(shù)實驗需求。小巧輕便 節(jié)省空間及您的寶貴樣品小體積為移動實驗和大量部署提供可能。5-10 μl 的推薦反應體積,較常規(guī)實驗節(jié)省80%的試劑用量,更節(jié)約您的珍貴樣品。自聚合酶鏈式反應技術(shù)被發(fā)明以來,其簡單、可靠、快速、靈敏的質(zhì)量,PCR是分子生物學中使用的技術(shù)。
制備DNA——解交聯(lián)和DNA純化現(xiàn)在含有目標蛋白質(zhì)的染色質(zhì)片段已分離,需要解交聯(lián)并純化DNA。解交聯(lián)通常采用高熱孵育和/或消化來完成。注意:此時可以停止ChIP。經(jīng)過解交聯(lián)和/或DNA純化后,可以將樣品于-20°C儲存。定量DNA——測定目標蛋白質(zhì)-DNA水平在該步驟中,通過qPCR定量純化的DNA產(chǎn)物,通過qPCR,您可以確定目標蛋白是否存在于特定位點。ChIP的qPCR如何定量分析ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進行標準化,包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。兩種常用的標準化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法(Fold Enrichmen)。與input相關(guān)的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標準化。建議ChIP 實驗重復,盡可能將結(jié)果與背景信號和標準誤差一起顯示。由于qPCR的高靈敏性,陰性對照有出現(xiàn)擴增信號的情況,那么在針對這類問題時,我們需要判斷其原因所在。佛山快速qPCR儀型號
定量檢測是一種實時的PCR (qPCR) 檢測。測量(定量)每輪PCR擴增循環(huán)中,檢測目標核酸片段的量。上??焖賟PCR儀消毒
相對定量實驗方法包括兩種重要方法:ΔΔCT Method:使用內(nèi)參基因定量所研究樣品和參照樣品的目的基因。內(nèi)參基因與目的基因可以同時反應,也可以單獨反應;雙標準曲線法:對每個樣品的內(nèi)參基因和目的基因都做定量,求出每個樣品中內(nèi)參基因和目的基因的數(shù)量,然后根據(jù)相對定量的基本公式來求出目的基因的差異表達。定量需要由標準曲線建立Ct值跟拷貝數(shù)之間的關(guān)系,標準曲線由標準品生成,標準品可以是已知濃度的RNA、質(zhì)?;蚝铣傻墓押塑账徭溕桑课粗0鍟r標準樣品和未知樣品必須同時反應。上??焖賟PCR儀消毒
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