原理:在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,通過熒光化學(xué)物質(zhì)測定每次PCR循環(huán)后產(chǎn)物總量。目的:實(shí)現(xiàn)定量而不止是定性分析。通過與內(nèi)參基因進(jìn)行對比,對樣品中的特定基因進(jìn)行相對表達(dá)量的計(jì)算,以實(shí)現(xiàn)定量分析。qPCR的檢測方法有兩種,SYBRGreenl法和TaqMan探針法,下面介紹常用的SYBRGreenl法。原理:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR熒光染料,使其特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射熒光信號(hào),而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會(huì)發(fā)射任何熒光信號(hào),從而保證熒光信號(hào)的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。試劑及儀器:Hieff®QpcrSYBR®GreenMasterMix試劑(翌圣)和ABI7500Real-TimeSystem實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行qRT-PCR擴(kuò)增。自聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)被發(fā)明以來,其簡單、可靠、快速、靈敏的質(zhì)量,PCR是分子生物學(xué)中使用的技術(shù)。深圳單通道qPCR儀供應(yīng)商
PCR:Polymerase chain reaction. 是體外模擬生物的DNA 復(fù)制。需要DNA 聚合酶,DNA 模板,兩端引物,脫氧核苷酸dNTPs( dATP, ACTP, dGTP, dTTP),以及適當(dāng)?shù)木彌_體系。PCR 產(chǎn)物的增長形式為2N (如果各種試劑和外部所加條件均理想化,N 是循環(huán)數(shù))。實(shí)際中,擴(kuò)增效率不為100%。Real time PCR 是定量PCR 的一種,當(dāng)然是在PCR 的基礎(chǔ)上發(fā)展出來的。(普通)PCR 包含很多因素,屬性,如:試劑,溫度,循環(huán)數(shù),程序,PCR 產(chǎn)物(擴(kuò)增子,amplicon)的量,擴(kuò)增曲線(擴(kuò)增子累積曲線),摻錯(cuò)率,擴(kuò)增子長度。一般來說,人們關(guān)心的是擴(kuò)增子的量。而real time PCR 主要利用的是擴(kuò)增曲線(amplification curve), 循環(huán)數(shù);擴(kuò)增子長度,擴(kuò)增效率,擴(kuò)增子多少,也加以考慮。深圳單通道qPCR儀供應(yīng)商熒光檢測系統(tǒng)可接收熒光信號(hào),每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,熒光信號(hào)累積和PCR產(chǎn)物形成是同步。
制備DNA——解交聯(lián)和DNA純化現(xiàn)在含有目標(biāo)蛋白質(zhì)的染色質(zhì)片段已分離,需要解交聯(lián)并純化DNA。解交聯(lián)通常采用高熱孵育和/或消化來完成。注意:此時(shí)可以停止ChIP。經(jīng)過解交聯(lián)和/或DNA純化后,可以將樣品于-20°C儲(chǔ)存。定量DNA——測定目標(biāo)蛋白質(zhì)-DNA水平在該步驟中,通過qPCR定量純化的DNA產(chǎn)物,通過qPCR,您可以確定目標(biāo)蛋白是否存在于特定位點(diǎn)。ChIP的qPCR如何定量分析ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。兩種常用的標(biāo)準(zhǔn)化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法(Fold Enrichmen)。與input相關(guān)的ChIP-qPCR數(shù)據(jù)包括ChIP的背景水平和input染色質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)化。建議ChIP 實(shí)驗(yàn)重復(fù),盡可能將結(jié)果與背景信號(hào)和標(biāo)準(zhǔn)誤差一起顯示。
所有儀器的操作都基本一致。設(shè)置的時(shí)候包括反應(yīng)板設(shè)置(plate setup)和程序設(shè)置(program setup)。我們以 ABI StepOne為例,詳細(xì)看一下反應(yīng)設(shè)置:A. 首先是實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇:定量還是其他。我們命名為“BioTeke”,進(jìn)行“定量”實(shí)驗(yàn)。B. 實(shí)驗(yàn)方法的選擇:我們選用的比較Ct的SYBR Green方法, Fast程序,以cDNA為模板進(jìn)行。C. 目的基因的設(shè)置:有幾個(gè)目的基因和目的基因的名稱。D. 樣品的設(shè)置:包括哪個(gè)是實(shí)驗(yàn)組,哪個(gè)是對照組。以及負(fù)對照的設(shè)置和生物重復(fù)的設(shè)置。E. 對照組和內(nèi)參基因的設(shè)置:這個(gè)是為后面的定量做準(zhǔn)備F. 反應(yīng)程序的設(shè)置:PCR反應(yīng)程序的設(shè)置要根據(jù)不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶(ABI的需要10 分鐘)。循環(huán)反應(yīng)是95℃15秒,60℃15秒的40個(gè)循環(huán)。溶解曲線程序采用儀器默認(rèn)設(shè)置就可以?;蛘呤莾x器說明書上建議的程序。G. 反應(yīng)體系的設(shè)置:A-G這五個(gè)步驟簡單設(shè)置好,可以保存,修改反應(yīng)程序或者立刻進(jìn)行反應(yīng)。
qPCR面對小的差異較弱,dPCR則可識(shí)別差異較小的拷貝數(shù)。
染料法是指在qPCR反應(yīng)體系中加入一種與雙鏈DNA分子結(jié)合的熒光染料,包括SYBR®Green I、BEBO和LC Green TMI等染料,它們可以與雙鏈DNA(double strands DNA,dsDNA)的小溝非特異性結(jié)合,激發(fā)較強(qiáng)的熒光產(chǎn)生。經(jīng)熒光定量PCR儀器檢測后,對核酸進(jìn)行定性和定量分析。qPCR 染料法原理:這種方法的優(yōu)點(diǎn)是,需要一對特異性引物,操作簡單、檢測成本低。缺點(diǎn)是由于熒光染料非特異結(jié)合dsDNA產(chǎn)物,無法正確區(qū)分目的產(chǎn)物,尤其是染料結(jié)合引物二聚體易產(chǎn)生錯(cuò)誤的擴(kuò)增曲線,易形成誤判。雖然在PCR擴(kuò)增程序后添加熔解曲線分析,可以方便判斷生成的熒光擴(kuò)增曲線是否屬于目的產(chǎn)物,但是對于高靈敏度要求的實(shí)驗(yàn)來說,染料法并不是比較好的選擇。與標(biāo)準(zhǔn) PCR 一樣,SYBR Green 方案由變性、退火和延伸階段組成。深圳單通道qPCR儀供應(yīng)商
PCR 反應(yīng)中通過控制溫度變化使得核酸分子重復(fù)地解鏈與延伸,從而實(shí)現(xiàn)對目的片段的指數(shù)擴(kuò)增。深圳單通道qPCR儀供應(yīng)商
Quantagene q225 系列熒光定量PCR 43分鐘完成實(shí)驗(yàn),再加3分鐘做完熔解曲線需43分鐘即可完成一個(gè)40循環(huán)的常規(guī)qpcr實(shí)驗(yàn)。DNA熔解曲線的檢測快可在3分鐘內(nèi)完成。使用快速試劑,30個(gè)熱循環(huán)的檢測更可縮短至20分鐘。精密設(shè)計(jì)的加熱塊和孔板q225的加熱塊經(jīng)過精密設(shè)計(jì),能夠很大程度地貼合孔板形狀,實(shí)現(xiàn)高效的熱傳導(dǎo),使得在加熱塊達(dá)到預(yù)定溫度后反應(yīng)溶液也能在短時(shí)間內(nèi)達(dá)到相同溫度,反應(yīng)溶液溫度更為均一??焖傺h(huán),穩(wěn)定溫度 q225 出色的熱循環(huán)系統(tǒng)設(shè)計(jì)使得40 個(gè)循環(huán)的常規(guī) qPCR 可以在短短43 分鐘內(nèi)輕松完成,讓您的工作效率獲得質(zhì)的提升。整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程中溫度穩(wěn)定,不受實(shí)驗(yàn)時(shí)間延長而導(dǎo)致的機(jī)器內(nèi)部背景溫度上升的影響。深圳單通道qPCR儀供應(yīng)商
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司是一家儀器儀表批發(fā);商品批發(fā)貿(mào)易(許可審批類商品除外);商品零售貿(mào)易(許可審批類商品除外);教學(xué)設(shè)備的研究開發(fā);辦公設(shè)備耗材批發(fā);生物技術(shù)開發(fā)服務(wù);生物技術(shù)推廣服務(wù);計(jì)算機(jī)批發(fā);生物技術(shù)轉(zhuǎn)讓服務(wù);農(nóng)業(yè)科學(xué)研究和試驗(yàn)發(fā)展;醫(yī)學(xué)研究和試驗(yàn)發(fā)展;自然科學(xué)研究和試驗(yàn)發(fā)展;水處理設(shè)備的研究、開發(fā);食品科學(xué)技術(shù)研究服務(wù);環(huán)保設(shè)備批發(fā);辦公設(shè)備批發(fā);的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷售為一體的專業(yè)化公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀,是精細(xì)化學(xué)品的主力軍。雙螺旋科學(xué)儀器致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗(yàn)。雙螺旋科學(xué)儀器創(chuàng)始人姜艷,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。