dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對于測量拷貝數(shù)濃度會產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學(xué)顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對實驗結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對6種不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進(jìn)行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準(zhǔn)了運(yùn)行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。數(shù)字PCR具有諸多優(yōu)點,但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復(fù)雜、經(jīng)濟(jì)效益低等。上海賽默飛數(shù)字PCR
本次推出的全自動數(shù)字PCR一體機(jī)可以適用于包括醫(yī)療檢測領(lǐng)域在內(nèi)的多種應(yīng)用場景。對于可以實現(xiàn)早期篩查、早期診斷、用藥指導(dǎo)以及監(jiān)測的復(fù)發(fā)。對于病原體可以實現(xiàn)超多重檢測,以利于快速診斷。在優(yōu)生優(yōu)育領(lǐng)域也可以實現(xiàn)更多遺傳性疾病的診斷和檢測。對于臨床應(yīng)用具有極大的潛力和價值。通過線上+線下的方式舉行了數(shù)字PCR2.0技術(shù)方案研討會,來自醫(yī)療界的**學(xué)者共聚一堂,圍繞PCR技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用進(jìn)行交流和討論。歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。蘇州國產(chǎn)數(shù)字PCR品牌在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊證的申報。
在PCR進(jìn)行的過程中,首先是引物和探針分別結(jié)合,然后開始擴(kuò)增。如果一個微滴當(dāng)中有目標(biāo)基因的片段,Taqman探針就會被酶切碎,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離。在后面的檢測過程中,熒光基團(tuán)被激發(fā)光路激發(fā)之后就會發(fā)熒光。如果沒有,Taqman探針就不會被切碎,在后面的檢測過程中,熒光基團(tuán)吸收到激發(fā)光的能量,就會被淬滅基團(tuán)給淬滅,那么儀器就檢測不到這個微滴的信號。檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點,這個反應(yīng)當(dāng)中就有幾個目標(biāo)基因的拷貝。因為目標(biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。
Drop-off實驗包括兩個針對相同擴(kuò)增子的TaqMan探針:與野生型序列互補(bǔ)而與突變位點不發(fā)生互補(bǔ)的Drop-off探針和與突變型和野生型基因都互補(bǔ)的Reference探針(如圖1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探針和Reference探針都將與目標(biāo)雜交,產(chǎn)生雙重陽性信號(如圖1B,藍(lán)色群)。相反,如果存在突變的等位基因,即使一個核苷酸的突變也會阻止Drop-off探針與之雜交,因此只有Reference探針對目標(biāo)基因進(jìn)行退火,從而得到一個陽性信號。三重ddPCR檢測體系存在的問題:不同位點檢測體系之間的cross-reactivity。
引物設(shè)計(DesignPrimers):引物長度(PrimerLength):18-25個堿基之間。短的引物更易于同靶序列結(jié)合,但過短的引物也更可能同基因組上的多個區(qū)域相結(jié)合而產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物。更長的引物會提高同靶序列結(jié)合的特異性,但過長的引物(>30bp)同靶序列結(jié)合速度變慢,降低結(jié)合率。引物長度和組成直接影響引物Tm值(PrimerMeltingTemperature)和退火溫度(AnnealingTemperatures)。引物的組成——GC%含量(GCContent):指引物總堿基中G和C堿基數(shù)量的百分比,該值應(yīng)在40-60%之間。如果模板序列的GC含量較高,推薦使用較高Tm值的引物。dPCR被稱作第三代PCR技術(shù),但dPCR技術(shù)的廣泛應(yīng)用逐漸顯現(xiàn)出一些不足之處。深圳全自動多重數(shù)字PCR價格
相同模板進(jìn)行 96 次擴(kuò)增,終點處產(chǎn)物量不恒定,但 Ct 值卻極具重現(xiàn)性。上海賽默飛數(shù)字PCR
naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于crystal微滴芯片數(shù)字PCR技術(shù),自動化微滴生成和擴(kuò)增,每個樣本孔可實現(xiàn)6熒光通道的檢測,智能化識別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時內(nèi)即可獲得至少6個靶標(biāo)基因的一定程度上拷貝數(shù)濃度,融合傳統(tǒng)微滴式和芯片式優(yōu)勢,被稱為下一代數(shù)字PCR技術(shù)。只需一步移液操作,將PCR反應(yīng)液加載于創(chuàng)新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)即可自動生成單層平鋪的2D微滴陣列,隨后對每個微滴進(jìn)行溫度均勻一致的PCR擴(kuò)增后,進(jìn)行六通道熒光信號采集,計數(shù)陰陽性微滴,通過泊松分布計算獲得靶標(biāo)基因一定程度上拷貝數(shù)濃度。上海賽默飛數(shù)字PCR
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