相比于qPCR,dPCR在轉(zhuǎn)基因檢測中具有以下優(yōu)勢:(1)檢測靈敏度高:理論上dPCR的靈敏度可達(dá)1個拷貝,而實際應(yīng)用中dPCR的小檢出限和比較低定量限數(shù)值非常接近,所以dPCR可以在非常低的目標(biāo)拷貝數(shù)下得到精確的結(jié)果;通常轉(zhuǎn)基因比參考基因(內(nèi)源基因)濃度低很多;(2)前處理簡單且受基質(zhì)成分干擾較?。篸PCR反應(yīng)效率和精密度受到食品基質(zhì)成分干擾影響較小,可應(yīng)用于混合基質(zhì)樣品中低豐度DNA的檢測;(3)dPCR對抑制劑的敏感性較低:由于dPCR結(jié)果表示為“有熒光“或“無熒光”,即使存在抑制劑降低了熒光強度仍可以表示為“有熒光;(4)適合多重轉(zhuǎn)基因檢測:食品或飼料提取的DNA中可能包含多種轉(zhuǎn)基因片段,可以進(jìn)行多重dPCR檢測,提高分析效率。同時,dPCR可以直接溯源至SI國際單位制摩爾,適合單一、雙重及多重轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)研究,一次可識別不同的轉(zhuǎn)基因區(qū)域。下面詳細(xì)進(jìn)行說明。dPCR的測量結(jié)果通常表示為含量,即拷貝數(shù)轉(zhuǎn)基因質(zhì)量百分比,而QPCR結(jié)果通常表示為拷貝數(shù)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)。廣州國產(chǎn)數(shù)字PCR性能特點
數(shù)字PCR技術(shù)的出現(xiàn)不是為了完全取代原有分子診斷技術(shù),而是更好的補充和完善現(xiàn)有技術(shù)平臺。數(shù)字PCR為不同應(yīng)用場景下的多樣化核酸檢測需求提供了新的思路,尤其是在臨床檢測方面。國產(chǎn)數(shù)字PCR企業(yè)在商業(yè)化應(yīng)用方面,也不斷“攻城略地”。數(shù)字PCR作為當(dāng)下靈敏的核酸檢測技術(shù),盡管目前國產(chǎn)數(shù)字PCR企業(yè)異軍突起,在臨床市場中實現(xiàn)了彎道超車,但未來仍然需要聚焦客戶需求,不斷夯實底層創(chuàng)新,同時在檢測成本、自動化、試劑盒申報注冊、出海國際化等方面不斷努力,提供更為的解決方案。國際局勢,波譎云詭。在百年未有之大變局,實現(xiàn)中華民族的偉大復(fù)興,需要國內(nèi)企業(yè)瞄準(zhǔn)技術(shù)高地,以爭分奪秒的精神,解決技術(shù)"卡脖子"的難題,不斷攻堅克難,自主創(chuàng)新,在與國際品牌的同臺競技中,彰顯中國實力。珠三角國產(chǎn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細(xì)胞肺*樣品進(jìn)行檢測,并挑選樣本驗證一致性。
對于檢測需要高靈敏度以及技術(shù)確認(rèn)的情況下,數(shù)字PCR技術(shù)也可以發(fā)揮重要作用。技術(shù)數(shù)據(jù)表明,數(shù)字PCR技術(shù)對的比較低檢測下限可到2copies/ml,比qPCR靈敏度提升了100倍。經(jīng)測試,數(shù)字PCR在檢測和診斷的某些方面優(yōu)于金標(biāo)準(zhǔn)qPCR,尤其是在低病毒載量樣本中,相比起qPCR,數(shù)字PCR特異性、靈敏度、重現(xiàn)性和檢測限受影響更小。因此,未來預(yù)計數(shù)字PCR技術(shù)也將在類疾病中得到更加廣的應(yīng)用。數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測以外,也可運用于基因擴增的檢測。通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重?zé)晒怏w系,用于同時檢測比如非小細(xì)胞肺中常見的MET和HER2耐藥擴增。有研究報道,使用數(shù)字PCR技術(shù)對436例非小細(xì)胞肺樣品進(jìn)行檢測,并挑選樣本驗證了數(shù)字PCR與RNA fish的檢測一致性。結(jié)果表明,該數(shù)字PCR技術(shù)在保證了基因擴增檢測準(zhǔn)確性的同時,還節(jié)約了檢測時間。
二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當(dāng)擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標(biāo)實體隨機“投擲”到一組分區(qū)中,當(dāng)目標(biāo)落在選定的分區(qū)中時,就是成功。如果有n個分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機的,則目標(biāo)出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗重復(fù)m次,樣品中的每個分子一次。更多關(guān)于PCR的相關(guān)信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。在dPCR中,樣品被分區(qū),使得樣品內(nèi)單個的核酸分子被定位并被集中在許多分離的區(qū)域內(nèi)。
基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術(shù),將樣品平均分配到20000個微滴油包水中,利用微滴分析儀對微滴進(jìn)行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅(qū)動下,將每個標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系分割成包含100萬至1000萬個皮升級別微滴的反應(yīng)乳液。數(shù)字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數(shù)字PCR,其原理都是有限稀釋,終點PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)體系,平均分配成幾萬個PCR反應(yīng),分配到芯片或微滴中,使每個反應(yīng)中盡可能含有一個模板分子,進(jìn)行單分子模板PCR反應(yīng),通過讀取熒光信號的有或無進(jìn)行計數(shù),經(jīng)過統(tǒng)計學(xué)泊松分布的校準(zhǔn)進(jìn)行定量。數(shù)字PCR是直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的定量。珠三角國產(chǎn)數(shù)字PCR分析應(yīng)用
dPCR的結(jié)果統(tǒng)計方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計的數(shù)據(jù)處理方法。廣州國產(chǎn)數(shù)字PCR性能特點
產(chǎn)物越短,往往擴增效率越高。模板二級結(jié)構(gòu)(Templatesecondarystructure):PCR變性中和變性后的單鏈DNA不夠穩(wěn)定,容易自發(fā)折疊形成二級結(jié)構(gòu)。應(yīng)避免可形成穩(wěn)定二級結(jié)構(gòu)的模板鏈區(qū)域,因為如果模板鏈形成的二級結(jié)構(gòu)在退火溫度下穩(wěn)定存在,定位在模板鏈二級結(jié)構(gòu)處的引物將無法同模板鏈相結(jié)合。使用mfold可預(yù)測引物待結(jié)合的區(qū)域是否存在復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)。設(shè)計引物時,盡量使引物定位在模板二級結(jié)構(gòu)以外的序列上。避免具有4個以上相同的連續(xù)堿基的區(qū)域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸階段聚合酶“滑動(PolymeraseSlippage)”。選擇GC含量(GCContent)在50-60%之間的區(qū)域。如果高GC含量區(qū)域不可避免,可以嘗試提高退火溫度,并使用添加劑,例如甘油,廣州國產(chǎn)數(shù)字PCR性能特點
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司公司是一家專門從事數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀產(chǎn)品的生產(chǎn)和銷售,是一家服務(wù)型企業(yè),公司成立于2015-04-17,位于廣州市黃埔區(qū)銳豐三街4號617房。多年來為國內(nèi)各行業(yè)用戶提供各種產(chǎn)品支持。臻準(zhǔn),美國艾科浦,銳訊生物,Sysmex,Eprerdia目前推出了數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀等多款產(chǎn)品,已經(jīng)和行業(yè)內(nèi)多家企業(yè)建立合作伙伴關(guān)系,目前產(chǎn)品已經(jīng)應(yīng)用于多個領(lǐng)域。我們堅持技術(shù)創(chuàng)新,把握市場關(guān)鍵需求,以重心技術(shù)能力,助力精細(xì)化學(xué)品發(fā)展。廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司研發(fā)團隊不斷緊跟數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀行業(yè)發(fā)展趨勢,研發(fā)與改進(jìn)新的產(chǎn)品,從而保證公司在新技術(shù)研發(fā)方面不斷提升,確保公司產(chǎn)品符合行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)和要求。廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司嚴(yán)格規(guī)范數(shù)字PCR,純水機,病理切片機,倍性分析儀產(chǎn)品管理流程,確保公司產(chǎn)品質(zhì)量的可控可靠。公司擁有銷售/售后服務(wù)團隊,分工明細(xì),服務(wù)貼心,為廣大用戶提供滿意的服務(wù)。