根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們設(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點(diǎn),在檢測的過程中,并不是說一個樣本中檢測到了幾個亮點(diǎn),這個反應(yīng)當(dāng)中就有幾個目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個發(fā)光的微滴中,可能有一個或者三個四個,甚至更多個目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對一的對應(yīng)關(guān)系。影響dPCR定量結(jié)果的因素:儀器采用的分散方式與數(shù)量、溶液稀釋方法、分散體積的準(zhǔn)確性以及結(jié)果表達(dá)方式。德國雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR
在精細(xì)診療領(lǐng)域,患者外周血中的循環(huán)DNA(ctDNA),在的早期篩查,圍術(shù)期監(jiān)測,藥物療效評估,預(yù)后等方面具有重要的臨床應(yīng)用價值。在肺液體活檢領(lǐng)域,EGFR突變由于其在東亞人群中的高突變率,實(shí)現(xiàn)精細(xì)檢測顯得尤為重要。研究表明,相較于熒光定量PCR,數(shù)字PCR對于血液ctDNA的檢測靈敏度更高(0.01%),EGFR突變的陽性檢出率也更高。在患者術(shù)后復(fù)發(fā)檢測中,數(shù)字PCR評估出的ctDNA陽性,可以早于影像學(xué)數(shù)月提前揭示出患者復(fù)發(fā)。因此,該項(xiàng)技術(shù)在肺精細(xì)診療中具有重要的作用。法國臻準(zhǔn)數(shù)字PCR原理數(shù)字PCR具有諸多優(yōu)點(diǎn),但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復(fù)雜、經(jīng)濟(jì)效益低等。
微滴數(shù)字PCR主要是將兩種互不相溶的液體,以其中一種作為連續(xù)相(油),另一種作為分散相(水),在水/油兩相表面張力和剪切共同作用下分散相以微小體積單元的形式存在于連續(xù)中,從而成液滴。這種液滴式的反應(yīng)腔室具有體積小、樣品間無擴(kuò)散等優(yōu)勢。在ddPCR中,利用微滴發(fā)生器可以一次生成數(shù)萬乃至百萬個納升甚至皮升級別的單個油包水微滴,作為數(shù)字PCR的樣品分散載體。這里,液滴中包裹了單拷貝DNA模板和PCR反應(yīng)液,然后將液滴收集在PCR反應(yīng)管中進(jìn)行擴(kuò)增。?PCR反應(yīng)結(jié)束后檢測每個微滴的熒光信號。目前Bio-Rad公司的QX100系統(tǒng)、QX200系統(tǒng)均為采用液滴技術(shù)的數(shù)字PCR系統(tǒng)。圖6.Bio-Rad的液滴數(shù)字PCR系統(tǒng)
數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)步驟包括:1)試劑配制:將10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探針、無核酸酶水混合成dPCR預(yù)混液,并分裝到8聯(lián)排管中或96孔板中;將各待測樣本的核酸模板、陽性對照、陰性對照分別加入相應(yīng)的8聯(lián)排管中或96孔板中;2)芯片進(jìn)樣:在小海龜BioDigital·青全自動樣品處理系統(tǒng)上進(jìn)行芯片上反應(yīng)液進(jìn)樣和液滴生成;3)芯片擴(kuò)增:在小海龜BioDigital·青PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行芯片上PCR擴(kuò)增反應(yīng);4)芯片閱讀:在小海龜BioDigital·青生物芯片閱讀儀上進(jìn)行芯片上熒光信號閱讀;5)數(shù)據(jù)分析:使用生物芯片數(shù)據(jù)分析·青軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和報告導(dǎo)出;通過不同cluster的位置進(jìn)行突變位點(diǎn)的判斷時存在誤判的現(xiàn)象。
現(xiàn)有dPCR分析方法采用熒光探針和基于光的檢測方法來鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物。這些方法要求足夠的靶分子擴(kuò)增以產(chǎn)生足以被檢測到的信號,但可能會導(dǎo)致額外的錯誤或偏差,因此,希望能夠提供一種改進(jìn)的、用于檢測樣品內(nèi)感興趣的核酸的方法,其采用替代性分析方法,具有提高的準(zhǔn)確度和精確度,并且其具有可以與基于dPCR的方法關(guān)聯(lián)使用的靈敏度。dPCR還在樣品內(nèi)進(jìn)行單一反應(yīng),但是所述樣品被分離成大量的分區(qū)(partition),并且所述反應(yīng)在每個分區(qū)中單獨(dú)進(jìn)行。這種分離允許對核酸量進(jìn)行靈敏的測量。DPCR已被證明可有效用于研究基因序列中的變異,例如拷貝數(shù)變異或點(diǎn)突變。在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊證的申報。德國雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR系統(tǒng)
數(shù)字PCR是通過將一個樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應(yīng)單元,每個單元至少包含一個拷貝的目標(biāo)分子 。德國雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR
PCR已成為分子診斷領(lǐng)域重要的技術(shù)手段之一,占據(jù)分子診斷市場的半壁江山。數(shù)字PCR是一代PCR技術(shù),也是當(dāng)前靈敏度和定量精度比較高的分子檢測技術(shù)。但數(shù)字PCR使用成本仍然相對較高,檢測靶點(diǎn)數(shù)少(一般≤6靶點(diǎn)/反應(yīng)),阻礙了其在臨床中的大規(guī)模應(yīng)用,提高數(shù)字PCR的多重檢測能力迫在眉睫?;跓晒馔ǖ罃?shù)的增加和基于探針濃度梯度增加,均可以在一定程度上提高數(shù)字PCR檢測重數(shù),然而只能達(dá)到"線性"增加的目的?;谔结槤舛忍荻鹊亩嘀貦z測技術(shù)雖然光'f明顯增加多重能力,但由于無法避免交叉反應(yīng)現(xiàn)象,不能確保獲得位點(diǎn)特異性的分簇,因此穩(wěn)定性不足、靈敏度較差,難以滿足臨床級別的數(shù)據(jù)要求。而基于創(chuàng)新的且數(shù)字PCR獨(dú)特適用的熒光編碼技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)“指數(shù)”級的多重檢測,顛覆性的提高數(shù)字PCR檢測重數(shù),覆蓋臨床應(yīng)用多場景需求。德國雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司致力于精細(xì)化學(xué)品,是一家服務(wù)型的公司。公司業(yè)務(wù)分為數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造精細(xì)化學(xué)品良好品牌。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造高質(zhì)量服務(wù)體驗(yàn),為客戶成功提供堅實(shí)有力的支持。