陜西初級網(wǎng)絡藥理學分析服務

來源: 發(fā)布時間:2022-02-10

針對用于篩選重要作用靶標(群)、關鍵藥效成分(群)等要素分析指標進行合理性評價,包括軟件/算法參數(shù)、網(wǎng)絡分析參數(shù)等。其中,網(wǎng)絡分析參數(shù)包括節(jié)點與邊的特征(如節(jié)點度、節(jié)點中心性、邊權重等)、網(wǎng)絡的凝聚性(如密度、聚類系數(shù)、子圖、連通性等)、網(wǎng)絡的可分割性(如層次聚類、譜分割等)、網(wǎng)絡模塊性、網(wǎng)絡基序等。針對研究的具體疾病,應該綜合考慮以上指標,建立合理的病證生物分子網(wǎng)絡,確定適宜的網(wǎng)絡靶標。如使用全新計算方法確定藥效成分群與網(wǎng)絡靶標,還應該考察所選藥效成分及網(wǎng)絡靶標對整體網(wǎng)絡穩(wěn)態(tài)的重要性。中藥網(wǎng)絡藥理學中,有些藥物的結構和功能具有類似性,可以構建出藥物-藥物,藥物-靶標等網(wǎng)絡。陜西初級網(wǎng)絡藥理學分析服務

網(wǎng)絡藥理學常見的生物復雜網(wǎng)絡模型:藥物與靶基因網(wǎng)絡:將細胞組分,如蛋白質(zhì)、代謝產(chǎn)物作為節(jié)點,與藥物建立二部圖模型。蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)外均不孤立的發(fā)揮作用,而是作為細胞高度關聯(lián)的相互作用網(wǎng)絡的一部分。通過藥物與靶點的相互作用網(wǎng)絡和通路網(wǎng)絡,可以更好的理解藥物作用與靶點之間的相互作用關系,如基因表達模式等。蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡:將蛋白質(zhì)作為節(jié)點,相互作用關系作為邊,將蛋白質(zhì)組構建為一個系統(tǒng)的網(wǎng)絡。通過蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡對藥物靶點的觀察,發(fā)現(xiàn)藥物靶點普遍位于高度鏈接但非關鍵節(jié)點的位置。上海中藥網(wǎng)絡藥理學服務費用網(wǎng)絡藥理學主要是通過系統(tǒng)生物學的研究方法進行研究,加速藥物靶點的確認以及發(fā)現(xiàn)新的生物標志物。

在網(wǎng)絡藥理學研究中,針對不同的分析對象(疾病、藥物)和分析目的(數(shù)據(jù)庫開發(fā)、算法開發(fā)、機制研究、診療發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)等),必需開展的評價內(nèi)容,以保證分析結果的真實可信。在基礎性評價之上,針對不同的分析對象和分析目,可選擇開展的評價內(nèi)容,使評價活動更加深入和客觀,以提升網(wǎng)絡藥理學分析結果的可信度。主要評價藥物的物質(zhì)基礎、生物靶標等基礎數(shù)據(jù)來源及收集方法的可靠性。評價內(nèi)容如下:1、數(shù)據(jù)來源:評價使用數(shù)據(jù)的出處,如文獻、數(shù)據(jù)庫、實驗數(shù)據(jù)等;2、數(shù)據(jù)信息:評價使用數(shù)據(jù)的整體情況,如數(shù)據(jù)總量、收集時間、相關數(shù)據(jù)庫版本等;3、關聯(lián)信息:評價不同數(shù)據(jù)間進行關聯(lián)的相關內(nèi)容,如關聯(lián)信息的數(shù)量、種類等。

中藥網(wǎng)絡藥理學研究思路及應用:網(wǎng)絡藥理學通過基因、蛋白、化合物和毒性反應之間的網(wǎng)絡構建,可在復雜體系中尋找有效物質(zhì)、預測已知化合物的有效作用,為解釋其作用機制提供有價值的信息。網(wǎng)絡藥理學在中藥研究中可以有以下幾方面的應用:尋找單味中藥或方劑中的潛在有效成分:中藥復方是中藥防病治病的主要形式,是在中醫(yī)辨證施治的理論指導下,根據(jù)病機和藥理論等,按照“君、臣、佐、使”等原則配伍組成的具有特定主治功效的藥。中醫(yī)關于方劑的配伍有高度的科學性,中藥復方蘊含了中醫(yī)理論豐富、深刻而復雜的科學內(nèi)涵。網(wǎng)絡的構建是網(wǎng)絡藥理學研究的中心。

網(wǎng)絡藥理學相關技術:網(wǎng)絡藥理學的一般研究流程包括:(1)從文獻、數(shù)據(jù)庫和實驗數(shù)據(jù)中抽提藥物、八點、蛋白、毒性、副作用等多種要素;(2)將這些要素作為網(wǎng)絡中的節(jié)點,通過計算節(jié)點之間的相互關系,構建網(wǎng)絡模型(藥物、基因、靶點、藥物相互作用的網(wǎng)絡);(3)在此基礎上推測各要素間的相互關系,從而研究藥物的藥理學性質(zhì)以及相關機制等,為藥物潛在靶點預測、毒副作用預測和藥物安全性評價提供理論依據(jù)和技術支持。現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫已為開展網(wǎng)絡藥理學研究奠定了堅實基礎。網(wǎng)絡藥理學強調(diào)從系統(tǒng)層次和生物網(wǎng)絡的整體角度出發(fā),解析藥物及治病對象之間的分子關聯(lián)規(guī)律。河南中醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學哪家好

網(wǎng)絡藥理學的研究離不開生物網(wǎng)絡的構建。陜西初級網(wǎng)絡藥理學分析服務

網(wǎng)絡藥理學研究進展:網(wǎng)絡藥理學強調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的治病效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗的成功率,節(jié)省藥物的研發(fā)費用。目前,網(wǎng)絡藥理學的研究方法大致分為兩類:一是根據(jù)公共數(shù)據(jù)庫和公開發(fā)表的已有數(shù)據(jù),建立特定藥物作用機制網(wǎng)絡預測模型,預測藥物作用靶點,并從生物網(wǎng)絡平衡的角度解析藥物作用機制。網(wǎng)絡藥理學的研究離不開生物網(wǎng)絡的構建。生物網(wǎng)絡是采用數(shù)學領域圖論的研究手段,借助復雜網(wǎng)絡的研究方法,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象,如將構成系統(tǒng)內(nèi)的各個組分抽象成節(jié)點,他們之間的聯(lián)系或相互作用關系描繪成邊,由節(jié)點和邊構成的圖就是網(wǎng)絡,較后組成一個包含多個體、多層次相互作用的復雜網(wǎng)絡。陜西初級網(wǎng)絡藥理學分析服務

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