網(wǎng)絡(luò)藥理學方法研究四君子湯治病胃前病變的機制:四君子湯是如何起作用的呢?因為化合物眾多,靶點復雜,使得探索作用機制的過程十分困難。近年來網(wǎng)絡(luò)藥理學已成為一種中草藥研究的流行方法,是我們探索此類問題的有益方法。方法:運用網(wǎng)絡(luò)藥理學分析四君子湯治病胃前病變的活性成分、藥物作用靶點及作用通路。通過TCMSP數(shù)據(jù)篩選四君子湯的活性成分及潛在靶點;通過GeneCards數(shù)據(jù)庫篩選胃前病變的疾病靶點。進而對這些靶點進行GO富集和KEGG通路富集分析,從而揭示四君子湯治病胃前病變的作用機制。網(wǎng)絡(luò)藥理學強調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié)。江西中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學費用
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(其實不是中藥也適用)的分析思路一般有兩類:其一,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學的某中方子劑醫(yī)療某疾病/改善某表型的分子機制研究。這類研究,側(cè)重于整體研究,不需要做實驗,基于公共數(shù)據(jù)庫、文本挖掘、軟件分析、高通量測序的分析,可以單獨成一篇1-3分的SCI文章。其二,某中方子劑通過某某基因調(diào)節(jié)某某通路醫(yī)療某某疾病/表型的研究。這類研究,側(cè)重于細節(jié)研究,把網(wǎng)絡(luò)藥理學當做篩選靶基因、通路的手段,再用常規(guī)的分子生物學、細胞生物學的技術(shù)加以驗證。上海醫(yī)療網(wǎng)絡(luò)藥理學服務(wù)網(wǎng)絡(luò)藥理學可提高發(fā)現(xiàn)活性天然產(chǎn)物的效率。
事實上,人體內(nèi)存在復雜的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)以及代謝網(wǎng)絡(luò)等。人體本身就是一個有機的整體,疾病的產(chǎn)生是眾多因素共同作用的結(jié)果,研究疾病的醫(yī)療應(yīng)該更加注重對整體的把握。如果將疾病認為是身體原有網(wǎng)絡(luò)平衡狀態(tài)的改變,那么有效的藥物應(yīng)該是使得原有平衡狀態(tài)恢復的藥物或藥物組合,由于網(wǎng)絡(luò)的復雜性和穩(wěn)定性,這通常需要同時對多個靶點進行調(diào)節(jié)。近年來研究人員發(fā)現(xiàn),在精神疾病和抗傳染等方面,具有多靶點藥理作用的藥物比單靶點藥物具有更好的療效,并由此產(chǎn)生了多向藥理學和多靶點藥物設(shè)計,并已經(jīng)應(yīng)用于多種復雜疾病的藥物研究。
網(wǎng)絡(luò)藥理學數(shù)據(jù)的獲取和驗證:1、網(wǎng)絡(luò)可視化技術(shù):該技術(shù)是指運用可視化工具,將聯(lián)系表反應(yīng)成一張相互聯(lián)系的可視網(wǎng)絡(luò)的過程。一般有兩個步驟:一是豐富網(wǎng)絡(luò)屬性,通過增添網(wǎng)絡(luò)本身、節(jié)點及連接的屬性,使節(jié)點聯(lián)系表擴展為包含豐富信息的網(wǎng)絡(luò),二是網(wǎng)絡(luò)描述,通過豐富的特征描述手段,使網(wǎng)絡(luò)表現(xiàn)更加直觀。目前,大部分網(wǎng)絡(luò)藥理學研究中的可視化可以通過Cytoscape、GUESS、Pajek等專業(yè)軟件工具來實現(xiàn)。2、網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù):該技術(shù)可以對網(wǎng)絡(luò)進行分析,從中提取出有用信息。主要有網(wǎng)絡(luò)拓撲學信息計算,可以得到網(wǎng)絡(luò)本身的統(tǒng)計屬性,反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中的隱藏信息;隨機網(wǎng)絡(luò)生成和比較,用來對現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)進行可靠性驗證;網(wǎng)絡(luò)分層和聚類,簡化網(wǎng)絡(luò)復雜度的重要算法,也是尋找網(wǎng)絡(luò)潛在信息的方法。網(wǎng)絡(luò)藥理學生物網(wǎng)絡(luò)是采用數(shù)學領(lǐng)域圖論的研究手段,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象。
網(wǎng)絡(luò)分析通常包括:網(wǎng)絡(luò)拓撲學信息計算、隨機網(wǎng)絡(luò)生成和比較以及網(wǎng)絡(luò)分層和聚類。常用的網(wǎng)絡(luò)拓撲學分析內(nèi)容包括度、介數(shù)、較短路徑、瓶頸、中心節(jié)點、模塊、楔點等。在生物網(wǎng)絡(luò)中,大多數(shù)節(jié)點度較小,而一小部分節(jié)點度比較大,度值大的節(jié)點被認為是中心節(jié)點。介數(shù)是網(wǎng)絡(luò)中所有較短路徑中經(jīng)過該節(jié)點的路徑的數(shù)目占較短路徑總數(shù)的比例。一個節(jié)點的介數(shù)值越大,流經(jīng)它的數(shù)據(jù)分組越多,意味著它更容易擁塞,成為網(wǎng)絡(luò)的瓶頸,是網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點。網(wǎng)絡(luò)分析中關(guān)注較多的是度和介數(shù),高的度值和介數(shù)值節(jié)點是新藥發(fā)現(xiàn)和靶點預測的重點。網(wǎng)絡(luò)藥理學是在系統(tǒng)生物學與計算機技術(shù)高速發(fā)展的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的。上海醫(yī)療網(wǎng)絡(luò)藥理學服務(wù)
網(wǎng)絡(luò)藥理學的發(fā)展可追溯至20世紀90年代。江西中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學費用
網(wǎng)絡(luò)藥理學是基于系統(tǒng)生物學的理論,對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號節(jié)點(Nodes)進行多靶點藥物分子設(shè)計的新學科。網(wǎng)絡(luò)藥理學強調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的治病效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗的成功率,節(jié)省藥物的研發(fā)費用。網(wǎng)絡(luò)藥理學(networkpharmacology)從系統(tǒng)生物學和生物網(wǎng)絡(luò)平衡的角度闡釋疾病的發(fā)展過程、從改善或恢復生物網(wǎng)絡(luò)平衡的整體觀角度認識藥物與機體的相互作用并指導新藥發(fā)現(xiàn)。"網(wǎng)絡(luò)藥理學"被迅速應(yīng)用于眾多領(lǐng)域的研究中,顯示出重要的理論和實際應(yīng)用價值。江西中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學費用
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