絳紅鏈霉菌菌株

錳氧化褐黃海水菌（Fulvimarinamanganoxydans）是一種具有特定代謝功能的海洋細(xì)菌，它能夠?qū)⒖扇苄缘亩r錳離子（Mn(II)）氧化為不溶性的高價錳氧化物。這一過程對海洋環(huán)境中的錳循環(huán)具有重要作用。以下是關(guān)于錳氧化褐黃海水菌的一些關(guān)鍵信息：1.**分類與特性**：錳氧化褐黃海水菌屬于Fulvimarina屬，是一種模式菌株，具有生物危害程度為四類，表明其對人類、動植物或環(huán)境可能構(gòu)成風(fēng)險。2.**培養(yǎng)條件**：這種細(xì)菌的培養(yǎng)溫度為30℃，需要在需氧條件下生長，通常使用2216E培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng)。3.**分離來源**：錳氧化褐黃海水菌開始是從西南印度洋的熱液羽流中分離得到的。4.**基因組信息**：錳氧化褐黃海水菌的全基因組序列為FWXR00000000.1，這為研究其氧化機(jī)制和生物學(xué)特性提供了重要資源。5.**生理功能**：研究表明，錳氧化褐黃海水菌通過其代謝活動，能夠促進(jìn)Mn(II)的氧化，生成的錳氧化物為空心球狀。這一過程可能涉及到微生物和光的共同作用，其中細(xì)菌產(chǎn)生的超氧自由基與二價錳離子發(fā)生反應(yīng)，占總氧化量的86±2.7%。抗性微桿菌作為異養(yǎng)型細(xì)菌，在生長過程中需要氧氣，不需要陽光，接觸酶反應(yīng)陽性，氧化酶反應(yīng)陰性。絳紅鏈霉菌菌株

巨大芽孢桿菌（Bacillusmegaterium）是一種革蘭氏陽性細(xì)菌，具有以下特點(diǎn)：1.**形態(tài)特征**：巨大芽孢桿菌的菌體呈桿狀，末端圓，單個或呈短鏈排列。大小約為1.2-1.5×2.0-4.0微米。它們能形成橢圓形的芽孢，中生或次端生，芽孢大小約為1.0-1.2×1.5-2.0微米。2.**培養(yǎng)特性**：巨大芽孢桿菌在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基上形成不多于1個的抗熱芽孢，為中生到端生，形狀為橢圓形或圓形不等。菌落生長豐富，不擴(kuò)展，有光澤或較暗，有時微皺，生長后期一般帶黃色，長時間培養(yǎng)生長物和培養(yǎng)基可變成褐色或黑色。3.**應(yīng)用價值**：巨大芽孢桿菌在工業(yè)上用于生產(chǎn)葡萄糖異構(gòu)酶，并且在回收貴重金屬方面有著重要作用。它們還能降解土壤中難溶的含磷化合物，使之成為作物能吸收的可溶物。巨大芽孢桿菌與球形芽孢桿菌混合培養(yǎng)時具有固氮增效作用，非常適合制成微生物肥料。4.**環(huán)境適應(yīng)性**：巨大芽孢桿菌屬于耐熱嗜冷菌，也是兼性厭氧菌，能在不同的環(huán)境條件下生長，包括溫暖的水中， 適生長溫度為28℃，有些菌株在5℃也可生長，比較大生長溫度為38-41℃。5.**生物防治作用**：巨大芽孢桿菌在植物病害生物防治中具有重要作用，能夠產(chǎn)生拮抗性或競爭性的代謝產(chǎn)物，抑制病原菌生長或殺死病原菌。多粘類芽胞桿菌菌株在某些情況下，這些微生物不僅能夠產(chǎn)生紅色素，還可能含有一種叫做細(xì)菌視紫紅質(zhì)的蛋白質(zhì)。

遲鈍水桿形菌（Undibacteriumpigrum）是一種革蘭氏陰性桿菌，具有以下特點(diǎn)：1.**分類學(xué)信息**：遲鈍水桿形菌屬于細(xì)菌域，其拉丁學(xué)名為Undibacteriumpigrum，原始編號為DSM19792，來源于德國的飲用水。2.**形態(tài)特征**：該菌為G-桿菌，周身鞭毛，有動力，無芽孢，無莢膜。在血平板上35℃培養(yǎng)18-24小時后，可以形成圓形、濕潤、凸起、光滑、灰白色的菌落，有些可形成黏液型菌落。在麥康凱上形成無色半透明、濕潤、光滑的菌落。3.**生化反應(yīng)**：遲鈍水桿形菌的氧化酶（-）、TSI為K/A、IMViC為++--，發(fā)酵葡萄糖，不發(fā)酵乳糖和甘露醇，硫化氫（+）。4.**培養(yǎng)條件**：遲鈍水桿形菌的培養(yǎng)溫度為25℃，使用的培養(yǎng)基為0908號培養(yǎng)基。5.**分離來源**：該菌株開始是從瑞典的飲用水中分離出來的。6.**生物安全等級**：遲鈍水桿形菌的生物安全等級為1級，屬于低風(fēng)險微生物。7.**菌株用途**：作為模式菌株，遲鈍水桿形菌主要用于分類學(xué)研究和教學(xué)。8.**保藏信息**：該菌株被多個機(jī)構(gòu)保藏，包括DSMZ、CCUG49009和CIP109318。9.**Genbank序列信息**：遲鈍水桿形菌的Genbank序列登錄號為AM397630。

格木慢生根瘤菌（B）是一種與格木（一種豆科植物）共生的根瘤菌。根據(jù)搜索結(jié)果，以下是格木慢生根瘤菌的一些特點(diǎn)和應(yīng)用：1.**遺傳多樣性**：研究表明，格木根瘤菌具有很大的遺傳多樣性，通過限制性酶切片段長度多態(tài)性（RFLP）分析16S-23SIGS序列，將166株根瘤菌分為22個型。2.**分類地位**：格木根瘤菌被分為4個種群，主要是Bradyrhizobiumelkanii和Bradyrhizobiumpachyrhizi這兩個優(yōu)勢種群，以及Bradyrhizobiumyuanmingense和一個潛在的新種群Bradyrhizobiumsp.I作為次要種群。3.**進(jìn)化分析**：進(jìn)化動力分析結(jié)果表明基因突變和縱向遺傳是格木慢生根瘤菌進(jìn)化的主要推動力。4.**共生基因**：結(jié)瘤基因nodC和固氮基因nifH序列的系統(tǒng)發(fā)育分析將格木根瘤菌分為5-6個分支，分類結(jié)果與持家基因結(jié)果較一致，表明共生基因與持家基因呈共進(jìn)化關(guān)系。5.**土壤理化因子相關(guān)性**：根瘤菌的種群分布特征與土壤理化因子相關(guān)性分析結(jié)果表明，B.elkanii的菌株偏好酸性土壤，且土壤pH與B.elkanii的分布呈正相關(guān)。在培養(yǎng)條件方面，小鼠小短桿菌的培養(yǎng)溫度為28℃，資源保藏類型為培養(yǎng)物。保存方法包括液氮低溫凍結(jié)法等。

溫泉水桿狀菌（Aquifexpyrophilus）是一種嗜熱的細(xì)菌，通常在溫泉這類高溫環(huán)境中被發(fā)現(xiàn)。以下是它們在生物修復(fù)中的一些具體應(yīng)用：1.**有機(jī)污染物的降解**：溫泉水桿狀菌能夠降解有機(jī)污染物，如在騰沖溫泉中分離出的Anoxybacillussp.YIM342，能產(chǎn)生一種新穎的α-淀粉酶，這種酶在生物燃料、洗滌劑及食品工業(yè)中具有潛在的應(yīng)用價值。2.**砷的生物轉(zhuǎn)化**：從騰沖熱海地?zé)釁^(qū)SRBZ溫泉水樣中分離出的AnoxybacillusflavithermusTCC9-4，能產(chǎn)生AsIII氧化酶，在化學(xué)自養(yǎng)條件下，能氧化90%以上的100mg/LAsIII，這表明溫泉中的微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成，為硫砷酸鹽在陸地地?zé)岘h(huán)境中分布提供了一種可能的解釋。3.**硫循環(huán)的參與**：在騰沖地?zé)岬貐^(qū)的大滾鍋2號溫泉中分離得到的脫硫腸狀菌屬菌株Desulfotomaculumsp.TC-1，其基因組成功擴(kuò)增出編碼厭氧亞砷酸氧化酶的arxA基因，表明嗜熱微生物可能參與了硫砷酸鹽的形成。4.**微生物介導(dǎo)的砷氧化反應(yīng)**：AnoxybacillusflavithermusTCC9-4的研究拓展了目前對于微生物介導(dǎo)的砷氧化反應(yīng)的理解，這對于砷污染的環(huán)境修復(fù)具有重要意義。

雙氮慢生根瘤菌的固氮活性可能會隨著溫度的變化而變化。在適宜的溫度范圍內(nèi)，固氮作用更為有效。絳紅鏈霉菌菌株

慢生新鞘氨醇菌（Novosphingobiumsp.）是鞘氨醇單胞菌屬（Sphingomonas）中的一種，具有以下特點(diǎn)：1.**革蘭氏陰性菌**：慢生新鞘氨醇菌是一種革蘭氏陰性菌，無孢子，以單側(cè)生極性鞭毛運(yùn)動，多呈黃色。2.**專性需氧**：這種細(xì)菌是專性需氧的，能產(chǎn)生過氧化氫酶，并且能夠?qū)⑽焯恰⒓禾羌岸寝D(zhuǎn)變成酸。3.**環(huán)境污染物降解**：慢生新鞘氨醇菌在環(huán)境污染物的降解中具有重要作用，尤其是對多環(huán)芳烴（PAHs）等大分子的降解。4.**抗逆性**：它們可以在高度貧氧和惡劣條件下生長，表明它們具有較強(qiáng)的抗逆性。5.**次級代謝產(chǎn)物**：慢生新鞘氨醇菌能產(chǎn)生威蘭膠等次級代謝產(chǎn)物，這些產(chǎn)物在食品、醫(yī)藥、石油開采等領(lǐng)域有廣泛應(yīng)用。6.**基因組和蛋白質(zhì)組研究**：通過整合基因組和蛋白質(zhì)組方法分析，慢生新鞘氨醇菌對環(huán)境污染物如17β-雌二醇（E2）的適應(yīng)性反應(yīng)和代謝策略得到了研究。7.**生物修復(fù)中的應(yīng)用**：慢生新鞘氨醇菌在生物修復(fù)領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價值，包括在降解環(huán)境污染物、抗氧化衰老、與植物互作等領(lǐng)域。8.**群體感應(yīng)調(diào)控系統(tǒng)**：研究了慢生新鞘氨醇菌US6-1在降解多環(huán)芳烴過程中的群體感應(yīng)（QuorumSensing,QS）系統(tǒng)，以及其在細(xì)胞間的信息交流系統(tǒng)中的功能。絳紅鏈霉菌菌株