深圳RIP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-16

ChIP(染色質(zhì)免疫沉淀)實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)概述:
1. 目標(biāo)蛋白的選擇:確定您想要研究的目標(biāo)蛋白,例如特定的轉(zhuǎn)錄因子或組蛋白修飾。
2. 樣本的準(zhǔn)備:根據(jù)研究的需要選擇合適的細(xì)胞或組織樣本。
3. 抗體的選擇:選擇具有高特異性和親和力的抗體,這對(duì)于實(shí)驗(yàn)的成功至關(guān)重要。
4. 交聯(lián):使用甲醛等交聯(lián)劑將蛋白質(zhì)與DNA在體內(nèi)共價(jià)結(jié)合,形成穩(wěn)定的蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物。
5. 細(xì)胞裂解:裂解細(xì)胞以釋放染色質(zhì),同時(shí)保持蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物的完整性。
6. 染色質(zhì)的剪切:通過超聲或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段,通常在200-1000 bp之間。
7. 免疫沉淀:使用特定抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合,然后利用蛋白A/G磁珠沉淀復(fù)合物。
8. 洗滌和洗脫:洗滌沉淀物以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和DNA,然后洗脫目標(biāo)蛋白-DNA復(fù)合物。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放DNA。
10. DNA的純化和分析:純化DNA并使用qPCR、芯片或測(cè)序技術(shù)(如ChIP-seq)進(jìn)行分析。
免疫沉淀和免疫共沉淀的區(qū)別?深圳RIP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

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免疫沉淀IP實(shí)驗(yàn)中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實(shí)驗(yàn)情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡(jiǎn)而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強(qiáng),而磁珠在得率,可重復(fù)性以及自動(dòng)化方面有明顯的優(yōu)勢(shì)。
杭州蛋白免疫沉淀磁珠價(jià)格免疫沉淀技術(shù)ChIP實(shí)驗(yàn)步驟。

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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)在生物醫(yī)學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用,以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域:
1. 蛋白質(zhì)相互作用研究:IP技術(shù)可以用來研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成和蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
2. 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究:通過IP技術(shù),可以富集信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的關(guān)鍵蛋白質(zhì),研究信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的機(jī)制和調(diào)控[。
3. 蛋白質(zhì)修飾研究:IP技術(shù)可以用于富集經(jīng)過特定修飾的蛋白質(zhì),例如磷酸化、乙?;龋M(jìn)而研究蛋白質(zhì)修飾的功能和調(diào)控。
4. 藥物靶點(diǎn)篩選:IP技術(shù)可以用于富集藥物靶點(diǎn)蛋白質(zhì),幫助篩選潛在的藥物靶點(diǎn)。
5. 疾病機(jī)制研究:通過分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,IP技術(shù)有助于揭示疾病的分子機(jī)制,為理解疾病的發(fā)展過程和尋找靶點(diǎn)提供重要信息。
6. 藥物相互作用分析:IP技術(shù)可以用于分析藥物與蛋白質(zhì)的相互作用,為藥物作用機(jī)制研究提供重要信息。
7. 生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):IP技術(shù)可以用于鑒定與疾病狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用,篩選出潛在的生物標(biāo)志物,用于疾病的診斷和預(yù)后評(píng)估。

RIP 技術(shù)的原理(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀)主要是運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來,經(jīng)過分離純化就可以對(duì)結(jié)合在復(fù)合物上的RNA 進(jìn)行q-PCR驗(yàn)證或者測(cè)序分析。

RIP 是研究細(xì)胞內(nèi)RNA 與蛋白結(jié)合情況的技術(shù),是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)過程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色質(zhì)免疫沉淀ChIP技術(shù)的類似應(yīng)用,但由于研究對(duì)象是RNA-蛋白復(fù)合物而不是DNA-蛋白復(fù)合物,RIP實(shí)驗(yàn)的優(yōu)化條件與ChIP實(shí)驗(yàn)不太相同,如:RIP反應(yīng)體系中的試劑和抗體不能含有RNA酶,抗體需經(jīng)RIP實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等等。
免疫沉淀ChIP抗體的選擇?

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免疫沉淀純化所得抗原純度低一般有多種原因:
1. 非特異性蛋白污染
如果洗脫所得抗原純度較低,則有幾種方法可以進(jìn)行優(yōu)化。在結(jié)合或洗滌緩沖液中加入去污劑或其他可以降低非特異性結(jié)合的組分。使用普通微珠預(yù)純化樣本還可以降低非目標(biāo)分子的共純化。此外,還可以使用無關(guān)蛋白 (如BSA) 封閉微珠 。
2. 抗體污染
使用蛋白A、G或A/G的經(jīng)典免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中會(huì)出現(xiàn)抗體與抗原共洗脫的情況。如果共洗脫會(huì)影響下游分析,則需要使用抗體通過共價(jià)連接固定至微珠的方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn),如Pierce 直接 IP 或交聯(lián) IP 的形式。
免疫沉淀技術(shù)的實(shí)驗(yàn)方法。北京蛋白免疫沉淀磁珠多少錢

免疫沉淀技術(shù)Co-IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。深圳RIP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)復(fù)合物組成以及特定蛋白質(zhì)的表達(dá)和純化的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。
基本原理
免疫沉淀技術(shù)基于抗體與特定蛋白質(zhì)(抗原)之間的特異性相互作用。通過使用針對(duì)目標(biāo)蛋白質(zhì)的特異性抗體,可以從含有多種蛋白質(zhì)的復(fù)雜樣本中捕獲并富集目標(biāo)蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)有多種類型,包括:
1. 個(gè)別免疫沉淀法(Individual IP)
2. 免疫共沉淀法(Co-IP)
3. 染色質(zhì)免疫沉淀法(ChIP)
4. RNA免疫沉淀法(RIP)
近年來,免疫沉淀技術(shù)在固相支持物的選擇上有了很大進(jìn)步。磁性微珠因其操作簡(jiǎn)便、快速和自動(dòng)化程度高而逐漸取代了傳統(tǒng)的瓊脂糖樹脂。
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標(biāo)簽: 支原體 免疫沉淀