南京Co IP免疫沉淀磁珠原理

來源: 發(fā)布時間:2024-06-16

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實驗方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準備
2. 蛋白質(zhì)濃度測定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
3. 抗體預處理:如果使用預固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應:將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
5. 固相支持物的回收:對于未固定的抗體,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
6. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫:使用適當?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復合物。
8. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質(zhì)進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等,以進一步分析目標蛋白質(zhì)。
免疫沉淀RIP抗體的選擇?南京Co IP免疫沉淀磁珠原理

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染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術(shù)是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術(shù)之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復合物,并將其切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
這項技術(shù)通過蛋白質(zhì)與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質(zhì)的靶基因,被廣泛應用于體內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結(jié)合方面的研究。該技術(shù)常與DNA芯片和分子克隆技術(shù)相結(jié)合。
深圳RIP免疫沉淀實驗原理免疫沉淀技術(shù)RIP的實驗設(shè)計。

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免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)是一種用于研究蛋白質(zhì)相互作用和純化特定蛋白質(zhì)的實驗方法。
優(yōu)點:
1. 特異性強:利用特異性抗體捕獲目標蛋白,可以有效地從復雜的生物樣本中分離出感興趣的蛋白質(zhì)。
2. 靈敏度高:可以檢測到低豐度的蛋白質(zhì),包括瞬態(tài)或弱相互作用的蛋白質(zhì)復合物。
3. 應用范圍廣:適用于多種生物樣本,如細胞裂解物、組織提取物和生物流體。
4. 生物學洞察深入:能夠揭示蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò),有助于理解細胞內(nèi)的信號傳遞和調(diào)控機制。
5. 可與其他技術(shù)聯(lián)用:如與質(zhì)譜(IP-MS)聯(lián)用,可以準確鑒定蛋白質(zhì)及其相互作用伙伴。
缺點:
1. 對抗體依賴性高:需要高親和力和高特異性的抗體,抗體的質(zhì)量直接影響實驗結(jié)果。
2. 可能存在非特異性結(jié)合:樣本中的其他蛋白質(zhì)可能與抗體或固相支持物發(fā)生非特異性結(jié)合,導致背景噪音。
3. 可能影響蛋白質(zhì)的天然狀態(tài):裂解和沉淀過程可能會改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象和功能。
4. 實驗重復性:需要多次實驗來確保結(jié)果的可重復性和可靠性。
5. 樣品處理:需要避免樣品降解和非特異性結(jié)合,這可能需要使用蛋白酶抑制劑和適當?shù)木彌_液條件。

免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應用,以下是一些主要的應用領(lǐng)域:
1. 蛋白質(zhì)相互作用研究:IP技術(shù)可以用來研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復合物的組成和蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
2. 信號轉(zhuǎn)導研究:通過IP技術(shù),可以富集信號轉(zhuǎn)導通路中的關(guān)鍵蛋白質(zhì),研究信號轉(zhuǎn)導的機制和調(diào)控[。
3. 蛋白質(zhì)修飾研究:IP技術(shù)可以用于富集經(jīng)過特定修飾的蛋白質(zhì),例如磷酸化、乙酰化等,進而研究蛋白質(zhì)修飾的功能和調(diào)控。
4. 藥物靶點篩選:IP技術(shù)可以用于富集藥物靶點蛋白質(zhì),幫助篩選潛在的藥物靶點。
5. 疾病機制研究:通過分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,IP技術(shù)有助于揭示疾病的分子機制,為理解疾病的發(fā)展過程和尋找靶點提供重要信息。
6. 藥物相互作用分析:IP技術(shù)可以用于分析藥物與蛋白質(zhì)的相互作用,為藥物作用機制研究提供重要信息。
7. 生物標志物發(fā)現(xiàn):IP技術(shù)可以用于鑒定與疾病狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用,篩選出潛在的生物標志物,用于疾病的診斷和預后評估。
免疫沉淀抗體的選擇?

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免疫沉淀RIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu),這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸,具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力,但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
免疫沉淀技術(shù)RIP的應用有哪些?深圳RIP免疫沉淀實驗原理

免疫沉淀ChIP技術(shù)選瓊脂糖珠還是磁珠?南京Co IP免疫沉淀磁珠原理

Co-IP(免疫共沉淀)技術(shù)主要用于研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,其實驗設(shè)計如下:
1. 樣品準備:Co-IP實驗通常有兩種,一種是內(nèi)源性蛋白相互作用驗證,一種是非內(nèi)源性蛋白相互作用驗證。內(nèi)源性相互作用通過質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染的方式將兩種蛋白轉(zhuǎn)染至同一細胞內(nèi)表達;非內(nèi)源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進行預處理及細胞裂解獲得細胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白:利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體,抗體會與誘餌蛋白結(jié)合,利用磁鐵將磁珠拉下,同時誘餌蛋白會一起被沉淀出來。
3. SDS-PAGE及WB檢測:得到沉淀后,需要驗證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復合物分離,隨后利用WB檢測是否存在靶蛋白。
4. 實驗對照設(shè)置:為了避免“假陽性”,需要設(shè)置正確的對照,包括陰性對照和陽性對照(Input組)。Input組為直接利用抗體對細胞裂解液進行WB檢測,驗證細胞裂解液中存在蛋白。
5. 結(jié)果真實性:確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
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