真核生物的基因組 DNA 以染色質(zhì)(Chromatin)的形式存在。因此,研究蛋白質(zhì)與 DNA 在染色質(zhì)環(huán)境中的相互作用是闡明真核生物基因表達(dá)機(jī)制的基本途徑,而染色質(zhì)免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術(shù)是目前公認(rèn)的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達(dá)機(jī)制研究中不可或缺的技術(shù)之一。
它的基本原理是在活細(xì)胞狀態(tài)下,固定蛋白質(zhì)-DNA(染色質(zhì))復(fù)合物,并將其切斷為一定長(zhǎng)度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學(xué)方法(抗體親和)沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的 DNA,通過對(duì)目的片段的純化與后期檢測(cè),從而獲得蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的信息。
免疫沉淀技術(shù)RIP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。杭州Protein AG免疫沉淀磁珠價(jià)格
RIP實(shí)驗(yàn)步驟通常包括:
1. 細(xì)胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細(xì)胞至適當(dāng)密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進(jìn)行交聯(lián),以固定蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。
2. 細(xì)胞裂解:收集細(xì)胞并進(jìn)行裂解,釋放RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質(zhì)降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細(xì)胞,獲得更小的染色質(zhì)片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細(xì)胞碎片:通過離心去除細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞,收集含RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對(duì)特定RNA結(jié)合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時(shí)間,使抗體與目標(biāo)蛋白充分結(jié)合。
6. 捕獲免疫復(fù)合物:添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物與珠子結(jié)合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和RNA。
8. 洗脫與逆轉(zhuǎn)交聯(lián):使用適當(dāng)?shù)木彌_液洗脫免疫復(fù)合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉(zhuǎn)交聯(lián),釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進(jìn)行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標(biāo)蛋白相互作用的RNA種類。
廣州anti Flag免疫沉淀磁珠現(xiàn)貨免疫沉淀技術(shù)ChIP的應(yīng)用有哪些?
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)在生物醫(yī)學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用,以下是一些主要的應(yīng)用領(lǐng)域:
1. 蛋白質(zhì)相互作用研究:IP技術(shù)可以用來研究蛋白質(zhì)之間的相互作用,揭示蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成和蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
2. 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究:通過IP技術(shù),可以富集信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的關(guān)鍵蛋白質(zhì),研究信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的機(jī)制和調(diào)控[。
3. 蛋白質(zhì)修飾研究:IP技術(shù)可以用于富集經(jīng)過特定修飾的蛋白質(zhì),例如磷酸化、乙酰化等,進(jìn)而研究蛋白質(zhì)修飾的功能和調(diào)控。
4. 藥物靶點(diǎn)篩選:IP技術(shù)可以用于富集藥物靶點(diǎn)蛋白質(zhì),幫助篩選潛在的藥物靶點(diǎn)。
5. 疾病機(jī)制研究:通過分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,IP技術(shù)有助于揭示疾病的分子機(jī)制,為理解疾病的發(fā)展過程和尋找靶點(diǎn)提供重要信息。
6. 藥物相互作用分析:IP技術(shù)可以用于分析藥物與蛋白質(zhì)的相互作用,為藥物作用機(jī)制研究提供重要信息。
7. 生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):IP技術(shù)可以用于鑒定與疾病狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用,篩選出潛在的生物標(biāo)志物,用于疾病的診斷和預(yù)后評(píng)估。
免疫沉淀技術(shù)(Immunoprecipitation, IP)的實(shí)驗(yàn)方法通常包括以下步驟:
1. 樣本準(zhǔn)備
2. 蛋白質(zhì)濃度測(cè)定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法測(cè)定裂解液中蛋白質(zhì)的濃度。
3. 抗體預(yù)處理:如果使用預(yù)固定的抗體,需先將抗體固定在固相支持物上,如瓊脂糖珠或磁性微珠。
4. 免疫沉淀反應(yīng):將裂解液與特異性抗體(固定或未固定)混合,并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜,以允許抗體與目標(biāo)蛋白質(zhì)充分結(jié)合。
5. 固相支持物的回收:對(duì)于未固定的抗體,加入與抗體特異性結(jié)合的蛋白A或蛋白G結(jié)合的固相支持物。
6. 洗滌:去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和雜質(zhì),通常需要多次洗滌固相支持物。
7. 洗脫:使用適當(dāng)?shù)南疵摼彌_液(如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液)從固相支持物上洗脫免疫復(fù)合物。
8. 后續(xù)分析:對(duì)洗脫的蛋白質(zhì)進(jìn)行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質(zhì)譜分析等,以進(jìn)一步分析目標(biāo)蛋白質(zhì)。
免疫沉淀技術(shù)Co-IP的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。
免疫沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)中抗體的選擇非常關(guān)鍵,因?yàn)榭贵w的特異性和親和力直接影響到實(shí)驗(yàn)的成功與否。
1. 特異性:抗體應(yīng)當(dāng)對(duì)目標(biāo)蛋白具有高度的特異性,以避免與其他蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
2. 親和力:抗體對(duì)目標(biāo)蛋白的親和力要足夠高,以確保在免疫沉淀過程中能夠有效地捕獲目標(biāo)蛋白。
3. 抗體類型:?jiǎn)慰寺】贵w和多克隆抗體都可以用于IP實(shí)驗(yàn)。單克隆抗體提供更高的特異性和批間一致性,而多克隆抗體可能提供更強(qiáng)的結(jié)合能力和更廣的表位覆蓋。
4. 應(yīng)用驗(yàn)證:選擇已經(jīng)過免疫沉淀(Co-IP)或相關(guān)應(yīng)用(如Western blot, IHC)驗(yàn)證的抗體,這增加了實(shí)驗(yàn)成功的可能性。
5. 供應(yīng)商信息:選擇信譽(yù)良好的抗體供應(yīng)商,并查看供應(yīng)商提供的技術(shù)數(shù)據(jù)和客戶評(píng)價(jià),以幫助做出決策。
免疫沉淀技術(shù)IP的實(shí)驗(yàn)方法。IP免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理
免疫沉淀的原理是什么?杭州Protein AG免疫沉淀磁珠價(jià)格
免疫沉淀實(shí)驗(yàn)不同于WB實(shí)驗(yàn)的樣品制備,對(duì)實(shí)驗(yàn)樣品制備要求更高,除了要控制所有操作盡量在冰上完成外,關(guān)鍵的是裂解液的成分,裂解液成分直接決定了樣品質(zhì)量。
主要影響:
1. 蛋白的釋放:許多目的蛋白定位在細(xì)胞器,質(zhì)膜,細(xì)胞核,細(xì)胞骨架中,但通常這些亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)很難被裂解液有效溶解,所以很難將這些蛋白釋放出來。
2. 蛋白相互作用:不同去垢劑對(duì)不同性質(zhì)的蛋白質(zhì)間相互作用影響程度不同,一些互作較弱的蛋白對(duì)盡管在比較溫和的裂解液配方中仍然會(huì)被破壞。
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在CYTOCH的理念中,化學(xué)與生物的結(jié)合是提升產(chǎn)品性能的關(guān)鍵。化學(xué)技術(shù)的進(jìn)步為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域提供了更多的可能性,使得相關(guān)實(shí)驗(yàn)結(jié)果更為靈敏、準(zhǔn)確。為了在細(xì)胞研究領(lǐng)域取得技術(shù)性突破,CYTOCH研發(fā)團(tuán)隊(duì)不斷嘗試將新型的化學(xué)技術(shù)與生物技術(shù)相融合。CYTOCH在細(xì)胞領(lǐng)域所進(jìn)行的已有技術(shù)的持續(xù)突破、新技術(shù)的創(chuàng)新研發(fā)、化學(xué)與生物技術(shù)的不斷碰撞結(jié)合,使得CYTOCH產(chǎn)品在臨床診斷、藥物研發(fā)和科研教育等領(lǐng)域都具有廣泛的應(yīng)用前景。
在保證研發(fā)驅(qū)動(dòng)力的前提下,為確保產(chǎn)品質(zhì)量的穩(wěn)定與可靠以及產(chǎn)品的使用性,CYTOCH對(duì)原料供應(yīng)商進(jìn)行嚴(yán)格審計(jì)和把關(guān),選擇品質(zhì)優(yōu)良的原料進(jìn)行后續(xù)產(chǎn)品生產(chǎn)。 在生產(chǎn)過程中,CYTOCH對(duì)生產(chǎn)人員資質(zhì)、生產(chǎn)環(huán)境、生產(chǎn)過程、生產(chǎn)物料進(jìn)行嚴(yán)格把控。后續(xù)的產(chǎn)品質(zhì)檢、入庫(kù)出庫(kù)均嚴(yán)格按照企業(yè)內(nèi)控標(biāo)準(zhǔn)由質(zhì)量和倉(cāng)庫(kù)物流人員進(jìn)行層層把關(guān),確保每一批出廠產(chǎn)品質(zhì)量都處于行業(yè)前端水平。