實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光量的變化，獲得不同樣品達(dá)到一定的熒光信號(hào)（閾值）時(shí)所需的循環(huán)次數(shù)：CT值（CycleThreshold）；通過將已知濃度標(biāo)準(zhǔn)品的CT值與其濃度的對(duì)數(shù)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線，就可以準(zhǔn)確定量樣品的濃度。熒光定量PCR技術(shù)具有簡便、快捷的優(yōu)點(diǎn)，能夠有效擴(kuò)增低拷貝的靶片段DNA，對(duì)每克樣品中20pg-10ng的轉(zhuǎn)基因成分進(jìn)行有效檢測(cè)。同時(shí)，與Southern法相比，熒光定量PCR技術(shù)可對(duì)T-DNA的不同序列進(jìn)行擴(kuò)增，因此能實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)基因品系中的基因重組的檢測(cè)（Giovanna2002）。高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往不穩(wěn)定,進(jìn)行大片段克隆或者帶有毒性DNA克隆時(shí)會(huì)用低拷貝;。浙江CAR-T載體拷貝數(shù)分析用低拷貝質(zhì)...

4嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）-T細(xì)胞5（CAR-T）是指通過基因修飾技術(shù)，使用病毒等載體將帶有特異6性抗原識(shí)別結(jié)構(gòu)域、鉸鏈區(qū)、跨膜區(qū)、共刺激信號(hào)jihuo區(qū)等遺傳7物質(zhì)轉(zhuǎn)入自體或異體T細(xì)胞形成的。CAR-T回輸?shù)交颊唧w內(nèi)后，8可與腫瘤細(xì)胞表面特異性抗原相結(jié)合而jihuo，通過釋放穿孔素、9顆粒酶等直接殺傷腫瘤細(xì)胞達(dá)到zhiliaoliu的目的。CAR-T對(duì)多10種血液liu顯示了較好的臨床效果，對(duì)實(shí)體瘤zhiliao也表現(xiàn)出了較大的zhiliao潛力。質(zhì)粒的擴(kuò)增會(huì)占用大量資源,當(dāng)載體用于表達(dá)或者其他用途時(shí),也會(huì)使用上低拷貝質(zhì)粒。深圳上市后載體拷貝數(shù)報(bào)...

4嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）-T細(xì)胞5（CAR-T）是指通過基因修飾技術(shù)，使用病毒等載體將帶有特異6性抗原識(shí)別結(jié)構(gòu)域、鉸鏈區(qū)、跨膜區(qū)、共刺激信號(hào)jihuo區(qū)等遺傳7物質(zhì)轉(zhuǎn)入自體或異體T細(xì)胞形成的。CAR-T回輸?shù)交颊唧w內(nèi)后，8可與腫瘤細(xì)胞表面特異性抗原相結(jié)合而jihuo，通過釋放穿孔素、9顆粒酶等直接殺傷腫瘤細(xì)胞達(dá)到zhiliaoliu的目的。CAR-T對(duì)多10種血液liu顯示了較好的臨床效果，對(duì)實(shí)體瘤zhiliao也表現(xiàn)出了較大的zhiliao潛力。如何查到某個(gè)載體的拷貝數(shù)?南通細(xì)胞療法載體拷貝數(shù)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移：是細(xì)菌...

主要有兩方面的原因：一方面，高拷貝數(shù)時(shí)外源基因的表達(dá)量不再由質(zhì)粒的拷貝數(shù)決定，可能是由轉(zhuǎn)錄和翻譯水平?jīng)Q定的；另一方面，高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往很不穩(wěn)定。由于質(zhì)粒拷貝數(shù)的變化直接與基因目標(biāo)產(chǎn)物的產(chǎn)率有關(guān)，因此對(duì)于重組蛋白的生產(chǎn)來說，質(zhì)粒的拷貝數(shù)是一個(gè)非常重要的參數(shù)。同一個(gè)細(xì)胞里一般不會(huì)同時(shí)有兩種不同的質(zhì)粒，這是質(zhì)粒不相容性(plasmidincompatibility)。在細(xì)菌細(xì)胞增殖過程中，其中必有一種會(huì)被逐漸排斥。所以要用純化過的低拷貝質(zhì)粒。低拷貝在鳥法測(cè)序中很常用的。隨機(jī)測(cè)序戰(zhàn)略又稱鳥戰(zhàn)略(shotgunstrategy),此策略是將人類基因組DNA用機(jī)械方法隨機(jī)切割成2Kb左右的小片段,把這些...

利用ddPCR檢測(cè)溶液中空載體的濃度和整合到T細(xì)胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測(cè)到的平均每個(gè)細(xì)胞的載體拷貝數(shù)與流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)到的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明，ddPCR明顯更精確，測(cè)量的差異減少了7倍，文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測(cè)定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測(cè)量結(jié)果，突出了該測(cè)定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對(duì)新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細(xì)胞進(jìn)行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準(zhǔn)確定量CAR和TCR工程T細(xì)胞中平均載體拷貝...

利用ddPCR檢測(cè)溶液中空載體的濃度和整合到T細(xì)胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測(cè)到的平均每個(gè)細(xì)胞的載體拷貝數(shù)與流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)到的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明，ddPCR明顯更精確，測(cè)量的差異減少了7倍，文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測(cè)定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測(cè)量結(jié)果，突出了該測(cè)定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對(duì)新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細(xì)胞進(jìn)行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準(zhǔn)確定量CAR和TCR工程T細(xì)胞中平均載體拷貝...

對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞，應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來評(píng)估。首先，應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復(fù)合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外，還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能，應(yīng)確定靶抗原肽的較小識(shí)別基序（motif），并采用計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)分析評(píng)估交叉反應(yīng)性。如果計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)可識(shí)別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽，應(yīng)在體外測(cè)定TCR修飾免疫細(xì)胞對(duì)表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原...

Southern blot 是一種常用的 DNA 定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的 DNA 樣品固定在固相載體（硝酸纖維膜或尼龍膜）上，與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交，在與探針有同源序列的固相 DNA 的位置上顯示出雜交信號(hào)，通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量，從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。 Southern 法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng)，但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR，其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料（如：SYBRGREENI）或特異性的熒光探針（如：Taqman探針）。質(zhì)粒的擴(kuò)增會(huì)占用大量資源,當(dāng)載體用于表達(dá)或者其他用途時(shí),也會(huì)使用上低拷貝質(zhì)粒。寧波VCN載...

對(duì)于CAR修飾的免疫細(xì)胞，應(yīng)采用多種體外方法評(píng)估其胞外抗原識(shí)別區(qū)的脫靶風(fēng)險(xiǎn)。TCR修飾免疫細(xì)胞的脫靶毒性可通過評(píng)估TCR與人體自身抗原肽的交叉識(shí)別能力來評(píng)估。首先，應(yīng)采用體外試驗(yàn)測(cè)定TCR修飾的免疫細(xì)胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復(fù)合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據(jù)及選擇范圍。此外，還應(yīng)研究其他相關(guān)或不相關(guān)的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應(yīng)可能，應(yīng)確定靶抗原肽的較小識(shí)別基序（motif），并采用計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)分析評(píng)估交叉反應(yīng)性。如果計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)可識(shí)別出具有潛在交叉反應(yīng)性的抗原肽，應(yīng)在體外測(cè)定TCR修飾免疫細(xì)胞對(duì)表達(dá)相應(yīng)蛋白或遞呈相應(yīng)抗原...

流式檢測(cè)CAR+T細(xì)胞數(shù)量，較，作者用FC流式評(píng)估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細(xì)胞的數(shù)量。在CAR-T細(xì)胞給藥后5個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)冷凍的PBMCs上對(duì)UPN#009(軸細(xì)胞)和UPN#020(組織細(xì)胞)進(jìn)行了回顧性FC試驗(yàn)。CAR-T細(xì)胞的數(shù)量測(cè)定每ul血液。從圖4中可以明顯看出，兩種方法都可以觀察到CAR-T細(xì)胞數(shù)量的高度收斂。值得注意的是，所有三種方法(fc、dPCR和qPCR)都檢測(cè)到了第35天UPN#009中CAR-T細(xì)胞數(shù)量的復(fù)蘇。這些數(shù)據(jù)與我們小組之前觀察到的基于PCR和基于fc的定量的高一致性相一致。對(duì)于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之...

主要有兩方面的原因：一方面，高拷貝數(shù)時(shí)外源基因的表達(dá)量不再由質(zhì)粒的拷貝數(shù)決定，可能是由轉(zhuǎn)錄和翻譯水平?jīng)Q定的；另一方面，高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往很不穩(wěn)定。由于質(zhì)?？截悢?shù)的變化直接與基因目標(biāo)產(chǎn)物的產(chǎn)率有關(guān)，因此對(duì)于重組蛋白的生產(chǎn)來說，質(zhì)粒的拷貝數(shù)是一個(gè)非常重要的參數(shù)。同一個(gè)細(xì)胞里一般不會(huì)同時(shí)有兩種不同的質(zhì)粒，這是質(zhì)粒不相容性(plasmidincompatibility)。在細(xì)菌細(xì)胞增殖過程中，其中必有一種會(huì)被逐漸排斥。所以要用純化過的低拷貝質(zhì)粒。低拷貝在鳥法測(cè)序中很常用的。隨機(jī)測(cè)序戰(zhàn)略又稱鳥戰(zhàn)略(shotgunstrategy),此策略是將人類基因組DNA用機(jī)械方法隨機(jī)切割成2Kb左右的小片段,把這些...

ddPCR與qPCR在監(jiān)測(cè)CART細(xì)胞拷貝數(shù)靈敏度比較，CAR-T細(xì)胞免疫zhiliao發(fā)展迅速，CAR-T細(xì)胞zhiliao后的動(dòng)力學(xué)監(jiān)測(cè)對(duì)患者隨訪至關(guān)重要，對(duì)指導(dǎo)接受CAR - T細(xì)胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前，CAR - T細(xì)胞產(chǎn)品內(nèi)的轉(zhuǎn)基因副本信息，如載體副本數(shù)量，對(duì)保證患者的安全性非常重要。然而，目前還缺乏開放區(qū)域定量檢測(cè)CAR - T細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)方法。一些機(jī)構(gòu)已經(jīng)建立了內(nèi)部分析來監(jiān)測(cè)CAR - T細(xì)胞頻率。2022年2月11日，MARIA?LUISA SCHUBERT等團(tuán)隊(duì)在INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 上發(fā)表了題為：Com...

對(duì)特定類型基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品的特殊考慮鑒于基因修飾細(xì)胞的產(chǎn)品種類繁多、各有特點(diǎn)，除上述一般技術(shù)要求外，還應(yīng)基于產(chǎn)品的特性進(jìn)行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細(xì)胞對(duì)于嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）或T細(xì)胞受體（Tcellreceptor，TCR）修飾的免疫細(xì)胞，應(yīng)盡可能采用多種方法評(píng)估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于靶點(diǎn)相關(guān)毒性，應(yīng)采用體外方法深入分析靶點(diǎn)在人體qiguan、組織和細(xì)胞中的表達(dá)分布情況，基因表達(dá)分析庫和文獻(xiàn)調(diào)研也可能會(huì)有助于闡明靶點(diǎn)在不同病理生理狀態(tài)下的表達(dá)是否存在差異。應(yīng)采用表達(dá)和不表達(dá)靶抗...

新型CAR/TCR T細(xì)胞臨床產(chǎn)品中載體拷貝數(shù)的定量—數(shù)字PCR法?；蚬こ蘐細(xì)胞已經(jīng)成為zhiliaoB細(xì)胞惡性的重要方法。CAR-T細(xì)胞的常見應(yīng)用是zhiliao過表達(dá)細(xì)胞外標(biāo)記物的B細(xì)胞惡性?；蚬こ蘐細(xì)胞已經(jīng)成為zhiliaoB細(xì)胞惡性的重要方法。CAR-T細(xì)胞的常見應(yīng)用是zhiliao過表達(dá)細(xì)胞外標(biāo)記物的B細(xì)胞惡性。嵌合抗原受體(CAR)T細(xì)胞是一種新型細(xì)胞療法，其中自患者體內(nèi)收獲自體T細(xì)胞并進(jìn)行基因修飾以表達(dá)嵌合抗原受體。測(cè)量載體整合到T細(xì)胞基因組的效率對(duì)于評(píng)估這些ai免疫療法的效力和安全性是很重要的。 ..載體拷貝數(shù)就是某種質(zhì)粒在單個(gè)細(xì)菌中的數(shù)量。寧波基因療法載體拷貝數(shù)方法主要有...

在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中，1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過CAR-T細(xì)胞zhiliao。CAR-T細(xì)胞zhiliao后，16例患者發(fā)生CRS，其中3例為高級(jí)別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級(jí)高。CAR-T細(xì)胞拷貝的峰值水平在43到159,304拷貝/ugPBMCDNA之間。在CAR-T細(xì)胞擴(kuò)增高峰(UPN#001和#003)的患者中觀察到高ICANS。1例患者(UPN#017)在CAR-T細(xì)胞zhiliao后1周內(nèi)死亡，原因是噬血細(xì)胞性淋巴組織細(xì)胞增多/巨噬細(xì)胞活化綜合征。其余19例患者可評(píng)估臨床療效:14例(74%)患者zhiliao有效，8例(42%)...