ddPCR與qPCR在監(jiān)測(cè)CART細(xì)胞拷貝數(shù)靈敏度比較,CAR-T細(xì)胞免疫zhiliao發(fā)展迅速,CAR-T細(xì)胞zhiliao后的動(dòng)力學(xué)監(jiān)測(cè)對(duì)患者隨訪至關(guān)重要,對(duì)指導(dǎo)接受CAR - T細(xì)胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前,CAR - T細(xì)胞產(chǎn)品內(nèi)的轉(zhuǎn)基因副本信息,如載體副本數(shù)量,對(duì)保證患者的安全性非常重要。然而,目前還缺乏開放區(qū)域定量檢測(cè)CAR - T細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)方法。一些機(jī)構(gòu)已經(jīng)建立了內(nèi)部分析來監(jiān)測(cè)CAR - T細(xì)胞頻率。2022年2月11日,MARIA?LUISA SCHUBERT等團(tuán)隊(duì)在INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 上發(fā)表了題為:Com...
流式檢測(cè)CAR+T細(xì)胞數(shù)量,較,作者用FC流式評(píng)估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細(xì)胞的數(shù)量。在CAR-T細(xì)胞給藥后5個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)冷凍的PBMCs上對(duì)UPN#009(軸細(xì)胞)和UPN#020(組織細(xì)胞)進(jìn)行了回顧性FC試驗(yàn)。CAR-T細(xì)胞的數(shù)量測(cè)定每ul血液。從圖4中可以明顯看出,兩種方法都可以觀察到CAR-T細(xì)胞數(shù)量的高度收斂。值得注意的是,所有三種方法(fc、dPCR和qPCR)都檢測(cè)到了第35天UPN#009中CAR-T細(xì)胞數(shù)量的復(fù)蘇。這些數(shù)據(jù)與我們小組之前觀察到的基于PCR和基于fc的定量的高一致性相一致。新型CAR/TCR T細(xì)胞臨床產(chǎn)品中載...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制宿主的控制比較松,在宿主中的拷貝數(shù)比較多,一般有10~200個(gè)拷貝,有時(shí)可達(dá)到700個(gè)。按基因轉(zhuǎn)移性:分兩類:(1)傳遞性質(zhì)粒:常為大型、嚴(yán)緊型質(zhì)粒;(2)非傳遞性質(zhì)粒:多為小型、松弛型質(zhì)粒。按遺傳性狀、產(chǎn)物分類(1)kangshengs抗性:如氨芐西林、氯霉素抗性;(2)限制酶-修飾酶(R-M)系統(tǒng):如hsdR-菌株可使DNA甲基化,但...
在細(xì)菌細(xì)胞中,某種特定基因的數(shù)目。一般檢測(cè)方法有若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。Southern法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。另外,由于 Southern 法檢測(cè)不經(jīng)過靶片段的擴(kuò)增( PCR ),一般每個(gè)電泳通道需要 10-30 μ g 的 DNA ,在實(shí)際操作中就需要較大量的植物材料...
拷貝數(shù),是指某基因(可以是質(zhì)粒)在某一生物的基因組中的個(gè)數(shù)。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個(gè),多拷貝則指有多個(gè)。在細(xì)菌細(xì)胞中,根據(jù)復(fù)制特性,質(zhì)粒分嚴(yán)緊型和松弛型兩類,前者在細(xì)胞中只含1?2個(gè),而后者含10?15個(gè)以上。恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、宿主細(xì)胞遺傳背景及生長(zhǎng)條件有關(guān)??截悢?shù)變異(Copynumbervariation,CNV)是由基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致的,一般指長(zhǎng)度為1kb以上的基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少,主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失和重復(fù)。載體拷貝數(shù)檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果快,結(jié)果準(zhǔn)確率高!北京CAR-T載體拷貝數(shù)安評(píng)關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhili...
實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料(如:SYBRGREENI)或特異性的熒光探針(如:Taqman探針),實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光量的變化,獲得不同樣品達(dá)到一定的熒光信號(hào)(閾值)時(shí)所需的循環(huán)次數(shù):CT值(CycleThreshold);通過將已知濃度標(biāo)準(zhǔn)品的CT值與其濃度的對(duì)數(shù)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,就可以準(zhǔn)確定量樣品的濃度。熒光定量PCR技術(shù)具有簡(jiǎn)便、快捷的優(yōu)點(diǎn),能夠有效擴(kuò)增低拷貝的靶片段DNA,對(duì)每克樣品中20pg-10ng的轉(zhuǎn)基因成分進(jìn)行有效檢測(cè)。同時(shí),與Southern法相比,熒光定量PCR技術(shù)可對(duì)T-DNA的不同序列進(jìn)行擴(kuò)增,因此能實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)基因品系中的基因重組的...
載體拷貝數(shù)一般檢測(cè)方法有:若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。Southern法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。另外,由于Southern法檢測(cè)不經(jīng)過靶片段的擴(kuò)增(PCR),一般每個(gè)電泳通道需要10-30μg的DNA,在實(shí)際操作中就需要較大量的植物材料來提取DNA,而轉(zhuǎn)基因植物的愈傷組織在無菌...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測(cè)20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患者接受了ALLzhiliao。大多數(shù)患者為男性,zhiliao患者的中位年齡為56.5歲(范圍10-71歲),患者之前接受了2-7個(gè)zhiliao線。由于血液病或進(jìn)展性疾病(PD)的高負(fù)擔(dān),大多數(shù)患者接受了淋巴清理和CAR-T細(xì)胞之間的橋接zhiliao。其中4例患者完全緩解(CR,n=2)或部分緩解(PR,n=2),5例患者病情穩(wěn)定(S...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制宿主的控制比較松,在宿主中的拷貝數(shù)比較多,一般有10~200個(gè)拷貝,有時(shí)可達(dá)到700個(gè)。按基因轉(zhuǎn)移性:分兩類:(1)傳遞性質(zhì)粒:常為大型、嚴(yán)緊型質(zhì)粒;(2)非傳遞性質(zhì)粒:多為小型、松弛型質(zhì)粒。按遺傳性狀、產(chǎn)物分類(1)kangshengs抗性:如氨芐西林、氯霉素抗性;(2)限制酶-修飾酶(R-M)系統(tǒng):如hsdR-菌株可使DNA甲基化,但...
基因的拷貝數(shù)與幾倍體是沒什么關(guān)系的?在不考慮突變的前提下,基因的拷貝數(shù)和幾倍體是直接相關(guān)的,因?yàn)榛虻妮d體是染色體,幾倍體是指染色體的倍數(shù)。打個(gè)比方,人有46條染色體,2二倍體,在人的21號(hào)染色體上有一個(gè)等位基因A,純合子。那么正常人基因A的拷貝數(shù)是2,而21三體綜合癥(21號(hào)染色體有3條,即21號(hào)染色體是三倍體)的患者基因A的拷貝數(shù)是3。另外發(fā)生基因突變也可能會(huì)導(dǎo)致基因拷貝數(shù)的變化。以人類基因組為例,我們講A基因在人類基因組中存在兩個(gè)拷貝,那意思是說在一套人類基因組中有兩個(gè)這樣的基因,就是所說的等位基因,且位于一對(duì)染色體上,即每個(gè)染色體組中各有一個(gè),因?yàn)槿旧w是基因的載體,通俗的講說基因是在...
致瘤性的風(fēng)險(xiǎn):考慮產(chǎn)品特征,所使用整合性載體(如逆與產(chǎn)品的儲(chǔ)存、運(yùn)輸和分配有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如保存、冷凍和解凍過程)、冷鏈或其他類型受控溫度條件被突破的風(fēng)險(xiǎn)、與產(chǎn)品穩(wěn)定性有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn),這可能會(huì)影響CAR-T細(xì)胞的生物學(xué)活性進(jìn)而導(dǎo)致治療失敗。與產(chǎn)品活性相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)與產(chǎn)品活性有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)如T細(xì)胞jihuo引起的CRS、ICANS等。與患者基礎(chǔ)疾?。ɑ驖撛诩膊。┗蚺c合并使用其他藥物的相互作用相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)。發(fā)生有害的免疫原性反應(yīng)及其后果(包括過敏反應(yīng)、產(chǎn)生中和抗體等)。與患者自身情況相關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如移植物抗宿主病、惡性liu)。對(duì)患者或供者細(xì)胞進(jìn)行預(yù)期和非預(yù)期基因修飾有關(guān)的風(fēng)險(xiǎn)(如細(xì)胞凋亡、功能改變、惡性liu)。載...
在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中,1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過CAR-T細(xì)胞zhiliao。CAR-T細(xì)胞zhiliao后,16例患者發(fā)生CRS,其中3例為高級(jí)別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級(jí)高。CAR-T細(xì)胞拷貝的峰值水平在43到159,304拷貝/ugPBMCDNA之間。在CAR-T細(xì)胞擴(kuò)增高峰(UPN#001和#003)的患者中觀察到高ICANS。1例患者(UPN#017)在CAR-T細(xì)胞zhiliao后1周內(nèi)死亡,原因是噬血細(xì)胞性淋巴組織細(xì)胞增多/巨噬細(xì)胞活化綜合征。其余19例患者可評(píng)估臨床療效:14例(74%)患者zhiliao有效,8例(42%)...
使用核酸載體進(jìn)行基因轉(zhuǎn)導(dǎo)或修飾時(shí),應(yīng)持續(xù)關(guān)注細(xì)胞產(chǎn)品中載體系統(tǒng)的殘留情況,分析外源在基因組中的插入位置、拷貝數(shù)等,監(jiān)控基因編輯用酶的細(xì)胞內(nèi)持續(xù)表達(dá)時(shí)間等,并在受試者給藥后進(jìn)行長(zhǎng)期安全性監(jiān)測(cè)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時(shí),需要進(jìn)一步研究確定其在生殖細(xì)胞(例如卵母細(xì)胞、精子)的暴露水平。根據(jù)載體類型、復(fù)制能力、基因組整合特性、劑量水平、給藥途徑等因素,分析評(píng)估基因zhiliao產(chǎn)品生殖系整合風(fēng)險(xiǎn)?;騴hiliao產(chǎn)品將遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到宿主細(xì)胞內(nèi)或整合到宿主基因組中或?qū)λ拗骰蚪M進(jìn)行編輯,存在潛在的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。目前對(duì)于判斷細(xì)胞基因組插入/修飾是否會(huì)產(chǎn)生遺傳毒性、是否較終會(huì)發(fā)...
利用ddPCR檢測(cè)溶液中空載體的濃度和整合到T細(xì)胞群中的CAR和TCR載體的平均數(shù)量。ddPCR檢測(cè)到的平均每個(gè)細(xì)胞的載體拷貝數(shù)與流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)到的細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)比例呈線性關(guān)系。使用ddPCR與Real-time PCR的定量精度比較表明,ddPCR明顯更精確,測(cè)量的差異減少了7倍,文中通過一些數(shù)據(jù)的比較說明了ddPCR具有更高的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。使用ddPCR測(cè)定法通過不同的工作人員獲得了類似的載體拷貝數(shù)測(cè)量結(jié)果,突出了該測(cè)定法在技術(shù)人員之間的可重復(fù)性。對(duì)新鮮的和冷凍保存的CAR T和TCR工程改造的T細(xì)胞進(jìn)行的分析得出了相似的結(jié)果。說明ddPCR是一種準(zhǔn)確定量CAR和TCR工程T細(xì)胞中平均載體拷貝...
關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品,例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體,或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞,長(zhǎng)期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險(xiǎn),建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細(xì)胞或相關(guān)替代細(xì)胞的基因組中整合的影響如在優(yōu)勢(shì)克隆、克隆性生長(zhǎng)是否導(dǎo)致惡性。依據(jù)載體在靶細(xì)胞基因組中整合能力的不同,可分為非整合型、定點(diǎn)整合型、弱整合型、隨機(jī)整合型等不同類型。基因轉(zhuǎn)導(dǎo)與修飾的作用機(jī)制包括同源重組、非同源重組等。因此,需要根據(jù)多方面因素、針對(duì)不同類型產(chǎn)品的特性進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和控制。應(yīng)通過綜合風(fēng)險(xiǎn)分析來論...
qPCR及dPCR定量檢測(cè)比較分析,對(duì)于所有分析的患者樣本,qPCR和dPCR提供了高度相似、重疊的CAR拷貝數(shù)結(jié)果。每個(gè)患者使用qPCR和dPCR獲得的數(shù)據(jù),對(duì)于CAR-T細(xì)胞擴(kuò)增水平較低的患者樣本(即UPN#008,#012和#018;比較大CAR-T細(xì)胞水平<5000拷貝的PBMCgDNA),仍存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)相關(guān)性(R2>0.78;P<0.05),證實(shí)了即使在低CAR-T細(xì)胞水平下qPCR和dPCR的可比性。將dPCR與qPCR結(jié)果(qPCR設(shè)置為100%)進(jìn)行個(gè)體拷貝數(shù)比較時(shí),dPCR的平均定量結(jié)果為70+34%,即平均相對(duì)差為-30%。實(shí)際上,對(duì)于幾乎所有測(cè)量樣本,使用dPCR測(cè)定...
CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析:本次收集攻擊113例患者,采用qPCR和dPCR檢測(cè)20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中,9例患者接受了DLBCLzhiliao,1例患者接受了ALLzhiliao。大多數(shù)患者為男性,zhiliao患者的中位年齡為56.5歲(范圍10-71歲),患者之前接受了2-7個(gè)zhiliao線。由于血液病或進(jìn)展性疾病(PD)的高負(fù)擔(dān),大多數(shù)患者接受了淋巴清理和CAR-T細(xì)胞之間的橋接zhiliao。其中4例患者完全緩解(CR,n=2)或部分緩解(PR,n=2),5例患者病情穩(wěn)定(S...
質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移:是細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要方式。在質(zhì)粒轉(zhuǎn)移過程中,供體菌和受體菌通過結(jié)合作用緊密接觸,質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體轉(zhuǎn)移,同時(shí)進(jìn)行質(zhì)粒復(fù)制。按能否自主轉(zhuǎn)移,可以將天然存在的質(zhì)粒分為轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒和非轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒兩大類。這里要注意的是,獲得質(zhì)粒的細(xì)菌可隨之而獲得一些生物學(xué)特性,如耐藥性或產(chǎn)生細(xì)菌素的能力等。從環(huán)境友好出發(fā),實(shí)驗(yàn)室里的廢棄菌液,一定要滅過菌才能倒哦。穿梭質(zhì)粒:是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和篩選,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達(dá)載體的構(gòu)建,如用于枯草的pBE2、酵母的pP...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制宿主的控制比較松,在宿主中的拷貝數(shù)比較多,一般有10~200個(gè)拷貝,有時(shí)可達(dá)到700個(gè)。按基因轉(zhuǎn)移性:分兩類:(1)傳遞性質(zhì)粒:常為大型、嚴(yán)緊型質(zhì)粒;(2)非傳遞性質(zhì)粒:多為小型、松弛型質(zhì)粒。按遺傳性狀、產(chǎn)物分類(1)kangshengs抗性:如氨芐西林、氯霉素抗性;(2)限制酶-修飾酶(R-M)系統(tǒng):如hsdR-菌株可使DNA甲基化,但...
拷貝數(shù),對(duì)于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實(shí)際上,每個(gè)細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì),可以把質(zhì)粒分為兩類:嚴(yán)緊型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時(shí),質(zhì)粒也復(fù)制一次,每個(gè)細(xì)菌內(nèi)只含1~2個(gè)質(zhì)粒;松弛型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后仍然能繼續(xù)復(fù)制,每一個(gè)細(xì)菌內(nèi)一般含20個(gè)左右質(zhì)??截悺_@些質(zhì)粒的復(fù)制是在寄主的松弛控制之下的,每個(gè)細(xì)菌中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質(zhì)的合成還可使質(zhì)??截悢?shù)增至幾千份。當(dāng)然,恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、質(zhì)粒的大小及培養(yǎng)條件有關(guān)。載體拷貝數(shù)計(jì)算公式:copies/ml(拷貝數(shù))=(6.02 x 10(23)次...
ddPCR與qPCR在監(jiān)測(cè)CART細(xì)胞拷貝數(shù)靈敏度比較,CAR-T細(xì)胞免疫zhiliao發(fā)展迅速,CAR-T細(xì)胞zhiliao后的動(dòng)力學(xué)監(jiān)測(cè)對(duì)患者隨訪至關(guān)重要,對(duì)指導(dǎo)接受CAR - T細(xì)胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前,CAR - T細(xì)胞產(chǎn)品內(nèi)的轉(zhuǎn)基因副本信息,如載體副本數(shù)量,對(duì)保證患者的安全性非常重要。然而,目前還缺乏開放區(qū)域定量檢測(cè)CAR - T細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)方法。一些機(jī)構(gòu)已經(jīng)建立了內(nèi)部分析來監(jiān)測(cè)CAR - T細(xì)胞頻率。2022年2月11日,MARIA?LUISA SCHUBERT等團(tuán)隊(duì)在INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 上發(fā)表了題為:Com...
實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料(如:SYBRGREENI)或特異性的熒光探針(如:Taqman探針),實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光量的變化,獲得不同樣品達(dá)到一定的熒光信號(hào)(閾值)時(shí)所需的循環(huán)次數(shù):CT值(CycleThreshold);通過將已知濃度標(biāo)準(zhǔn)品的CT值與其濃度的對(duì)數(shù)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,就可以準(zhǔn)確定量樣品的濃度。熒光定量PCR技術(shù)具有簡(jiǎn)便、快捷的優(yōu)點(diǎn),能夠有效擴(kuò)增低拷貝的靶片段DNA,對(duì)每克樣品中20pg-10ng的轉(zhuǎn)基因成分進(jìn)行有效檢測(cè)。同時(shí),與Southern法相比,熒光定量PCR技術(shù)可對(duì)T-DNA的不同序列進(jìn)行擴(kuò)增,因此能實(shí)現(xiàn)對(duì)轉(zhuǎn)基因品系中的基因重組的...
為促進(jìn)及早發(fā)現(xiàn)此類風(fēng)險(xiǎn)并提供有效地風(fēng)險(xiǎn)控制措施,本指導(dǎo)原則在借鑒ICHE2E藥物警戒計(jì)劃、《藥物警戒質(zhì)量管理規(guī)范》和國(guó)內(nèi)外風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃相關(guān)指導(dǎo)原則的基礎(chǔ)上,列舉了CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品可能存在的安全性風(fēng)險(xiǎn),以及常規(guī)和本類產(chǎn)品特異的額外藥物警戒活動(dòng)和風(fēng)險(xiǎn)較小化措施。CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的風(fēng)險(xiǎn)識(shí)別應(yīng)盡早開始,并在整個(gè)研發(fā)過程中持續(xù)進(jìn)行,以在可能的情況下預(yù)防、較小化風(fēng)險(xiǎn)。隨著對(duì)風(fēng)險(xiǎn)認(rèn)知的變化,應(yīng)及時(shí)更新風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃。本指導(dǎo)原則包括CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申報(bào)上市臨床風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃的結(jié)構(gòu)和內(nèi)容,重點(diǎn)就撰寫CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品風(fēng)險(xiǎn)管理計(jì)劃時(shí)的特殊考慮進(jìn)行描述,CA...
穿梭質(zhì)粒:是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和篩選,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達(dá)載體的構(gòu)建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳動(dòng)物表達(dá)載體pMT2和用于植物細(xì)胞的Ti質(zhì)粒。這些穿梭質(zhì)粒不僅可以在大腸桿菌中復(fù)制擴(kuò)增,也可以在相應(yīng)的枯草、酵母、動(dòng)物或植物細(xì)胞中擴(kuò)增和表達(dá)。這樣利于對(duì)質(zhì)粒的分子生物學(xué)操作和大量制備。質(zhì)粒的不相容性:通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學(xué)來說,我們需要一個(gè)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)亩x?!袄猛粡?fù)制系統(tǒng)的兩個(gè)質(zhì)粒會(huì)在復(fù)制和隨后向自細(xì)胞的分配過程中彼此競(jìng)爭(zhēng),這樣的質(zhì)粒在細(xì)菌培養(yǎng)物中不能和平...
對(duì)于TCR修飾的T細(xì)胞,還應(yīng)關(guān)注引入TCR鏈和內(nèi)源性TCR之間的錯(cuò)配可能性,應(yīng)描述和說明旨在降低錯(cuò)配可能性的TCR設(shè)計(jì)策略。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn),在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此,應(yīng)在shouci臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理,能夠滿足評(píng)價(jià)要求,也可在持續(xù)時(shí)間足夠長(zhǎng)的毒性研究中評(píng)估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對(duì)照,以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。載體拷貝數(shù)的分析方法,歡迎咨詢上海唯...
載體拷貝數(shù)一般檢測(cè)方法有:若是測(cè)序結(jié)果,可選用censor軟件檢測(cè)相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。Southern法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。另外,由于Southern法檢測(cè)不經(jīng)過靶片段的擴(kuò)增(PCR),一般每個(gè)電泳通道需要10-30μg的DNA,在實(shí)際操作中就需要較大量的植物材料來提取DNA,而轉(zhuǎn)基因植物的愈傷組織在無菌...
Southern blot 是一種常用的 DNA 定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測(cè)的 DNA 樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相 DNA 的位置上顯示出雜交信號(hào),通過檢測(cè)信號(hào)的有無、強(qiáng)弱可以對(duì)樣品定性、定量,從而計(jì)算出轉(zhuǎn)入的拷貝數(shù)。 Southern 法準(zhǔn)確性高、特異性強(qiáng),但存在費(fèi)時(shí)費(fèi)力的缺點(diǎn)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR,其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料(如:SYBRGREENI)或特異性的熒光探針(如:Taqman探針)。細(xì)胞產(chǎn)品中的外源病毒載體基因拷貝數(shù)不高于5拷貝/細(xì)胞。深圳腺相關(guān)病毒載體拷貝數(shù)方法高拷貝質(zhì)...
質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移:是細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要方式。在質(zhì)粒轉(zhuǎn)移過程中,供體菌和受體菌通過結(jié)合作用緊密接觸,質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體轉(zhuǎn)移,同時(shí)進(jìn)行質(zhì)粒復(fù)制。按能否自主轉(zhuǎn)移,可以將天然存在的質(zhì)粒分為轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒和非轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒兩大類。這里要注意的是,獲得質(zhì)粒的細(xì)菌可隨之而獲得一些生物學(xué)特性,如耐藥性或產(chǎn)生細(xì)菌素的能力等。從環(huán)境友好出發(fā),實(shí)驗(yàn)室里的廢棄菌液,一定要滅過菌才能倒哦。穿梭質(zhì)粒:是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和篩選,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達(dá)載體的構(gòu)建,如用于枯草的pBE2、酵母的pP...
用低拷貝質(zhì)粒作表達(dá)載體有什么好處?因?yàn)楦呖截愘|(zhì)粒穩(wěn)定性低,而且給宿主細(xì)胞的壓力大。低拷貝數(shù)的質(zhì)粒DNA在宿主細(xì)胞分裂前只能復(fù)制1~2次,而多拷貝數(shù)質(zhì)粒可以在細(xì)胞分裂前復(fù)制成10~200拷貝。高拷貝數(shù)的質(zhì)粒稱為松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid),單獨(dú)于細(xì)菌細(xì)胞而自主復(fù)制;低拷貝數(shù)的質(zhì)粒一般是嚴(yán)緊型質(zhì)粒(stringentplasmid),它們的復(fù)制隨細(xì)菌染色體的復(fù)制同步進(jìn)行。一般來說,外源基因的表達(dá)量隨拷貝數(shù)的增加而提高,但是當(dāng)拷貝數(shù)很大時(shí),拷貝數(shù)與發(fā)酵目標(biāo)產(chǎn)物產(chǎn)率的這種關(guān)系卻不存在。VCN載體拷貝數(shù)檢測(cè)服務(wù),推薦上海唯可,專業(yè)人員足,檢測(cè)效率高。杭州CAR-T載體拷貝數(shù)服務(wù)由于CAR-...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制宿主的控制比較松,在宿主中的拷貝數(shù)比較多,一般有10~200個(gè)拷貝,有時(shí)可達(dá)到700個(gè)。按基因轉(zhuǎn)移性:分兩類:(1)傳遞性質(zhì)粒:常為大型、嚴(yán)緊型質(zhì)粒;(2)非傳遞性質(zhì)粒:多為小型、松弛型質(zhì)粒。按遺傳性狀、產(chǎn)物分類(1)kangshengs抗性:如氨芐西林、氯霉素抗性;(2)限制酶-修飾酶(R-M)系統(tǒng):如hsdR-菌株可使DNA甲基化,但...