南京細胞鑒定數(shù)據(jù)庫比對

短串聯(lián)重復(fù)(Short tandem repeats, STR)，又稱微衛(wèi)星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復(fù)序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR)，是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯配引起的復(fù)制滑動被認為是導(dǎo)致STR產(chǎn)生的較為常見原因，并且依據(jù)不同復(fù)制單元大小的不同以及不同物種之間，復(fù)制滑動發(fā)生的概率也不相同。STR已被廣泛應(yīng)用于親子鑒定、個體識別、司法鑒定、交通事故鑒定、（造血干細胞）移植醫(yī)治后嵌合情況監(jiān)測等領(lǐng)域。上海翼和生物業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋多重PCR靶向捕獲二代測序、STR遺傳背景鑒定和SNP基因分型三大板塊。南京細胞鑒定數(shù)據(jù)庫比對

為什么要做支原體污染檢測？在細胞研究領(lǐng)域，支原體是臭名昭著的污染源，許多實驗室都深受其害。支原體傳染能在不知不覺中干擾研究結(jié)果，浪費大量的資金投入。研究表明，95%以上污染細胞的支原體屬于以下四種類型：口腔支原體（M.orale）、精氨酸支原體（M.arginini）、豬鼻支原體（M.hyorhinis）和萊氏無膽甾原體（A.laidlawii，此種支原體為牛源性）。這是四種比較常見的污染細胞的支原體菌群，但實際中能夠污染細胞的支原體的種類是很多的。國外的調(diào)查證明，有二十多種支原體可以污染細胞，并且有的細胞可以同時被兩種以上的支原體污染。廣州細胞鑒定周期細胞STR鑒定助力論文發(fā)表Cancer Research。

上海翼和公司利用熒光PCR擴增小鼠基因組中9個STR基因位點，PCR產(chǎn)物在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測進行基因分型。根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細胞STR數(shù)據(jù)庫（EXPASY）比對，從而鑒定樣品所屬的小鼠細胞系。2017年4月，翼和客戶山東泰山醫(yī)學(xué)院免疫所發(fā)表了EBioMedicine上的一篇論文，該文中編輯要求對突變小鼠的遺傳背景進行鑒定，翼和公司應(yīng)用基于多重PCR與二代測序的近交系小鼠檢測方案2.0版本方案，成功的對基因編輯小鼠進行了測試，并對小鼠遺傳背景進行了STR鑒定，雜志編輯成功接受。

在過去的的幾十年間，在細胞生物學(xué)領(lǐng)域，文章一直在發(fā)表，科研成果一直在公布，但是當(dāng)中哺乳動物細胞被錯誤鑒定，存在交叉污染的情況也同時存在著。2010年有雜志（IJC）統(tǒng)計出一列表，在346篇文章中，有 103篇存在細胞被Hela細胞污染的情況。當(dāng)然還有，在2001年，科學(xué)家在一篇論文里報道了一株新建立的大鼠（rat）視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)的細胞系（留個印象是大鼠來源的），命名為RGC-5。在隨后的十幾年時間里，至少230篇論文的研究與假設(shè)是建立在這株細胞系上。結(jié)果在2009年，序列測定結(jié)果表明，RGC-5是一株小鼠（mouse）細胞。隨著越來也多細胞被污染的問題出現(xiàn)，大家也開始意識到細胞污染的嚴重性，2007年，NIH強烈建議在使用細胞時進行鑒定。目前STR基因分型方法被認為是檢測細胞交叉污染和性質(zhì)鑒定極為有效以及準確的方法，多個細胞庫分別提供了各種細胞株的STR基因分析數(shù)據(jù)以供參考比對。常見的細胞系除了發(fā)現(xiàn)種屬內(nèi)的交叉污染／錯誤鑒定，還有部分細胞系被發(fā)現(xiàn)連種屬都被錯誤鑒定了！

有名的Hela細胞，源自一名美國黑人婦女的子宮頸細胞。這位理應(yīng)在生物學(xué)史上占據(jù)一定地位的女性，名叫Henrietta Lacks，死于子宮頸*。自1951年至今，Hela細胞已被培養(yǎng)了60多年，分裂了近2萬次，仍然無停止跡象，是為不死的傳說，參見一本書《永生的海拉》。Hela為什么可以永生，據(jù)說其基因組插入了人類HPV18，成了HPV細胞，這些可惡的HPV細胞不僅在我們?nèi)梭w里不停的分裂繁殖，直到我們逝去，在分離細胞系里仍可以不斷的分裂，一般細胞分裂后端粒會老化變短，直至細胞系終結(jié)。Hella細胞似乎在每次分裂時，端粒酶活性很高，可以復(fù)制出新的端粒，以維持端粒長度，避開所謂的“海佛烈克極限”(Hayflick limit)（正常的細胞系，分裂極限在52次左右）。本文使用的Hela**細胞，由上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司鑒定。成都STR鑒定數(shù)據(jù)庫

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什么是細胞系鑒定？所謂細胞系鑒定即通過STR（短串聯(lián)重復(fù)）圖譜所建立細胞系的遺傳特征。一株細胞系的遺傳特征確立后，細胞系可以通過定期的檢測，以防止出現(xiàn)細胞系被誤認或交叉污染的情況。為什么要進行細胞系鑒定？由于細胞系發(fā)生交叉污染或身份誤認，將導(dǎo)致實驗數(shù)據(jù)的無效或數(shù)據(jù)誤導(dǎo)。NIH已發(fā)出公告，討論細胞系鑒定的必要性與重要性，并且越來越多的的期刊要求文章發(fā)表前、需提供細胞鑒定數(shù)據(jù)。細胞系用錯的概率有多大？據(jù)ATCC估計，1977年錯誤使用細胞的概率是16%，1999年是18%。根據(jù)我們的經(jīng)驗，國內(nèi)細胞系用錯的概率不低于20%。即如果一個研究所有二十個課題組，按概率估計，有4個課題組用的細胞是錯的。南京細胞鑒定數(shù)據(jù)庫比對

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司專注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主，是一個有活力有能力有創(chuàng)新精神的團隊。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括：細胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨，深受客戶好評。公司深耕細胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測，生物技術(shù)服務(wù)，正積蓄著更大的能量，向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。