在藻類(lèi)生長(zhǎng)所需的大量元素中，磷、氮通常是水體浮游植物增長(zhǎng)的限制性因子，總氮大于1.2毫克/升、總磷大于0.11毫克/升時(shí)水體開(kāi)始富營(yíng)養(yǎng)化，在淡水中當(dāng)總磷小于0.1毫克/升時(shí)藻類(lèi)生長(zhǎng)發(fā)展為磷限制。而過(guò)高的磷輸入如總磷為1.65毫克/升，并不能促進(jìn)藻類(lèi)生長(zhǎng)。要培養(yǎng)出養(yǎng)殖所需要的有益藻、抑制藍(lán)藻、裸藻等有害藻，我們需要重點(diǎn)關(guān)注一些化學(xué)指標(biāo)，總堿度、硬度、鹽度、氮、磷、碳以及微量元素鈣、鐵、錳、鋅等有可能成為限制性因子的指標(biāo)。池塘中的有機(jī)質(zhì)含量可通過(guò)檢測(cè)水中有機(jī)耗氧量得知，水中有機(jī)質(zhì)含量高，氮磷的含量也會(huì)高，在降氨氮同時(shí)可以降低水體有機(jī)質(zhì)含量。
但目前來(lái)看，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖技術(shù)和系統(tǒng)的推廣還存在以下問(wèn)題：是基礎(chǔ)建設(shè)成本高，投入大?，F(xiàn)在采用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的企業(yè)大多數(shù)為具有一定規(guī)模，技術(shù)力量和實(shí)力較為雄厚的養(yǎng)殖企業(yè)，而對(duì)大部分小本經(jīng)營(yíng)的養(yǎng)殖戶(hù)（單位）來(lái)說(shuō)是可望而不可即，這也使循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)和技術(shù)的大范圍推廣受到了制約。部分工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于設(shè)計(jì)存在問(wèn)題或其他一些人為原因，運(yùn)行不充分或運(yùn)行效率較低，影響了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的總體水平，節(jié)水節(jié)能技術(shù)路線有待進(jìn)一步探討、完善。
結(jié)合工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的特點(diǎn)，研究開(kāi)發(fā)出節(jié)能環(huán)保，占地面積少，土地使用效率高，能有效隔離病害和控制病源的侵入，降低魚(yú)苗的攜菌和發(fā)病率的封閉式工廠化養(yǎng)殖循環(huán)水處理系統(tǒng)：在臺(tái)風(fēng)自然災(zāi)害較多的南方，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖可有效抵御自然災(zāi)害對(duì)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)毀滅性的打擊。在循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中，重要的就是水質(zhì)的凈化處理，這關(guān)乎到水產(chǎn)養(yǎng)殖的成敗。目前，傳統(tǒng)的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于大量電力化設(shè)備的使用，能耗特別高，加之部分設(shè)備耐腐蝕性差，成為現(xiàn)在做循環(huán)水養(yǎng)殖頭疼的事情。