養(yǎng)殖過程中產(chǎn)生的殘餌、糞便，有部分無法通過換水排出而吸附在池壁池底。洗池對于排出養(yǎng)殖池底的污物有一定效果。無死角的養(yǎng)殖池形狀結(jié)合向中央傾斜的池底和中央排污方式，可以有效的排出池底污物。當(dāng)同一個養(yǎng)魚池中魚的大小、強弱不一時，會嚴(yán)重影響魚的生長速度，因而，養(yǎng)殖過程中必須按時進(jìn)行大小分選。魚的大小分選不僅可以防止互殘（半滑舌鰨的互殘的情況很少發(fā)生），而且便于進(jìn)行管理，尤其是幼魚，幼魚生長比較快，分選和不分選，幼魚的生長、死亡率和餌料的利用率相差很大。但要盡可能減少分養(yǎng)次數(shù)，過多次數(shù)的分養(yǎng)會使魚體受傷，增加魚的應(yīng)激反應(yīng)。
在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準(zhǔn)入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經(jīng)過專家學(xué)者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國內(nèi)循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)既是一個復(fù)雜的系統(tǒng)工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，只要不出現(xiàn)明顯的設(shè)計漏洞，系統(tǒng)運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統(tǒng)管理技術(shù)和養(yǎng)殖技術(shù)來解決。
眾所周知水產(chǎn)養(yǎng)殖*重要的是養(yǎng)殖水的質(zhì)量，著水產(chǎn)養(yǎng)殖水平的提高，大量餌料、肥料、漁藥等物質(zhì)投入，帶來大量有機廢物沉積或溶解于養(yǎng)殖水體中，導(dǎo)致有毒有害物質(zhì)增加和溶解氧供求矛盾激化，造成養(yǎng)殖水質(zhì)量不斷惡化，這種現(xiàn)象我們稱之為“死水”。很多外塘養(yǎng)殖都會出現(xiàn)這樣的情況，導(dǎo)致水產(chǎn)品的養(yǎng)殖密度低下，達(dá)不到社會需要的價值較高的安全水產(chǎn)品。