溫州血液RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2022-01-24

聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:無擴增條帶:酶失活或在反應(yīng)體系中未加入酶。Taq DNA聚合酶因保存或運輸不當而失活,往往通過更換新酶或用另一來源的酶以獲得滿意的結(jié)果。模板含有雜質(zhì)。特別是對甲醛固定及石蠟包埋的組織常含甲酸,造成DNA脫嘌呤而影響PCR的結(jié)果。變性溫度是否準確:PCR儀指示溫度與實際溫度是否相符,過高酶在前幾個循環(huán)就迅速失活;過低則模板變性不徹底。反應(yīng)系統(tǒng)中污染了蛋白酶及核酸酶,應(yīng)在未加Taq酶以前,將反應(yīng)體系95℃加熱5-10 min。引物變質(zhì)失效。人工合成的引物是否正確。是否純化,或因儲存條件不當而失活。引物錯誤。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計引物。 DNA凝膠電泳時加入陽性對照,確保不是DNA凝膠和PCR程序的問題。熱啟動聚合酶鏈式反應(yīng)可以通過將反應(yīng)組分加熱到變性溫度在加入聚合酶之前。溫州血液RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟

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聚合酶鏈反應(yīng)的常見問題分析與解決方法:PCR產(chǎn)物量過少:退火溫度不合適。以2度為梯度設(shè)計梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。DNA模板量太少。增加DNA模板量。PCR循環(huán)數(shù)不足。增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)。引物量不足。增加體系中引物含量。延伸時間太短。以1 kb/min的原則設(shè)置延伸時間。變性時間過長。變性時間過長會導(dǎo)致DNA聚合酶失活。DNA模板中存在抑制劑。確保DNA模板干凈。擴增產(chǎn)物在凝膠中涂布或成片狀條帶彌散:酶量過高。減少酶量;酶的質(zhì)量差,調(diào)換另一來源的酶。dNTP濃度過高。減少dNTP的濃度。南通微量熒光PCR研究方案PCR由變性-退火-延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。

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逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)的原理是:提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,采用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA。再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。完整RNA 的提取和純化,是進行RNA 方面的研究工作,如Nothern雜交、mRNA 分離、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及體外翻譯等的前提。所有RNA的提取過程中都有五個關(guān)鍵點,即樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使白復(fù)合體變性;對內(nèi)源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對于多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質(zhì)的有效除去。但其中很關(guān)鍵的是抑制RNA酶活性。RNA 的提取目前階段主要可采用兩種途徑,提取總核酸,再用氯化鋰將RNA 沉淀出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質(zhì)進入有機相而RNA 留在水相。種提取方法將導(dǎo)致小分子量RNA 的丟失,目前該方法的使用頻率已很低。

聚合酶鏈式反應(yīng)準備:PCR引物設(shè)計:PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。引物設(shè)計的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C 過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈反應(yīng)可以選擇這些突變來理解蛋白質(zhì)是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質(zhì)功能。

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聚合酶鏈式反應(yīng)的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。流聚合酶鏈反應(yīng)將溶液置于熱梯度下,而不是反復(fù)加熱和冷卻聚合酶鏈反應(yīng)混合物。杭州骨頭PCR檢測技術(shù)應(yīng)用

聚合酶鏈式反應(yīng)PCR技術(shù)的基本原理類似于DNA的天然復(fù)制過程。溫州血液RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟

聚合酶鏈式反應(yīng)是一種在體外快速擴增特定基因或DNA序列的方法,故又稱為基因的體外擴增法。PCR技術(shù)類似于DNA的天然復(fù)制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR能快速特異擴增任何已知目的基因或DN段,并能輕易在皮克(pg)水平起始DNA混合物中的目的基因擴增達到納克、微克、毫克級的特異性DN段。因此,PCR技術(shù)一經(jīng)問世就被迅速而較廣地用于分子生物學(xué)的各個領(lǐng)域?!‘惓=Y(jié)果: 各種疾病所致的異常,例如梅毒。一期梅毒。即硬下疳 ,潛伏期2-4周,外生殖器部位發(fā)生暗紅色硬腫塊 、淺潰瘍 ,有軟骨樣硬度,周圍淋巴結(jié)腫大。二期梅毒。在一期梅毒 1-2 個月之后,全身皮膚、粘膜發(fā)生對稱泛發(fā)皮疹、斑疹、、疹等。粘膜可發(fā)生粘膜斑、扁平濕疣,傳染性強。三期梅毒。發(fā)生在染上后2-3年乃至10年,皮膚為樹膠樣腫,還可涉及骨、關(guān)節(jié)、心、血管,表現(xiàn)為主動脈炎、主動脈瓣閉鎖不全和主動脈瘤等,侵及神經(jīng)為脊髓癆 ,全身麻痹 ( 麻痹性癡呆 )等等。 需要檢查的人群:疑似某種特定的疾病病人,進行分子特異性檢查。溫州血液RT-PCR檢測技術(shù)原理及步驟