南通骨頭RT-PCR檢測技術原理及步驟

來源: 發(fā)布時間:2021-12-28

聚合酶鏈式反應的特點:靈敏度高:PCR產物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應用耐高溫的Taq DNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應,一般在2~4 小時完成擴增反應。擴增產物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA 粗制品及RNA均可作為擴增模板??芍苯佑门R床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成。南通骨頭RT-PCR檢測技術原理及步驟

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聚合酶鏈式反應準備:10×擴增緩沖液、4種dNTP混合物(終濃度)、引物(終濃度)、模板DNA、Taq DNA聚合酶、Mg2+(終濃度)、補加雙蒸水等。其中dNTP、引物、模板DNA、Taq DNA聚合酶以及Mg2+的加量(或濃度)可根據(jù)實驗調整,以上表格只提供大致參考值。PCR反應五要素:參加PCR反應的物質主要有五種即:引物(PCR引物為DN段,細胞內DNA復制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。南通骨頭RT-PCR檢測技術原理及步驟聚合酶鏈式反應中要確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。

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聚合酶鏈式反應:定量PCR允許實時定量和檢測特定的DNA序列,因為它在合成過程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標記的探針。只有在探針與其互補DNA雜交后,才能使用這些方法檢測DNA。一種有趣的技術組合是實時PCR和逆轉錄。這種復雜的技術被稱為RT-qPCR,允許定量少量RNA。通過這種組合技術,mRNA被轉化為cDNA,并用qPCR進一步定量。這種技術降低了聚合酶鏈反應終點出錯的可能性,增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關的基因的機會。實驗室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調控。

聚合酶鏈反應:熱啟動聚合酶鏈式反應:一種在PCR的初始建立階段減少非特異性擴增的技術。它可以通過將反應組分加熱到變性溫度(例如95 c)在加入聚合酶。[36]已經(jīng)開發(fā)了特殊的酶系統(tǒng),通過結合抗體來抑制聚合酶在環(huán)境溫度下的活性[37][37]或者通過共價鍵結合的抑制劑的存在,該抑制劑在高溫活化步驟后解離。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍,在伸長溫度下立即。序列間特異性聚合酶鏈反應(ISSR):一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法,它放大簡單重復序列之間的區(qū)域,以產生擴增片段長度的獨特指紋。電子聚合酶鏈反應(數(shù)字聚合酶鏈反應、虛擬聚合酶鏈反應、電子聚合酶鏈反應、電子聚合酶鏈反應)是指計算工具使用給定的一組引物 ( 探針)來擴增來自測序的基因組或轉錄組的DNA 序列,用于計算理論聚合酶鏈反應結果。電子PCR被提出作為分子生物學的教育工具。聚合酶鏈式反應的引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。

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現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內復制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行,以減少一次升降溫過程,提高了反應速度。檢測:PCR反應擴增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測就成了關鍵。熒光素(溴化乙錠,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測手段。電泳法檢測特異性是不太高的,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判。但因為其簡捷易行,成為了主流檢測方法。近年來以熒光探針為的檢測方法,有逐漸取代電泳法的趨勢。序列間特異性聚合酶鏈反應放大簡單重復序列之間的區(qū)域,以產生擴增片段長度的獨特指紋。深圳血液定量PCR技術服務

重疊延伸聚合酶鏈反應可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。南通骨頭RT-PCR檢測技術原理及步驟

聚合酶鏈式:PCR由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合;引物的延伸:DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈重復循環(huán)變性--退火--延伸三過程,就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2-4分鐘,2-3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數(shù)取決于樣品中模板的拷貝?!CR技術敏感性高,特異性強,操作簡便、快速,在生命科學研究、食品衛(wèi)生、醫(yī)療、法醫(yī)及環(huán)境監(jiān)測等諸多方面都具有重要的應用價值。南通骨頭RT-PCR檢測技術原理及步驟