細胞定量PCR

來源: 發(fā)布時間:2023-03-05

Real-time PCR原理:所謂實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法,應用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測PCR過程中積累的擴增產(chǎn)物。檢測所有雙鏈DNA擴增產(chǎn)物,包括非特異反應產(chǎn)物,如引物二聚體??蓪θ魏坞p鏈DNA進行定量;不需要探針,因此減少了實驗設計及運轉(zhuǎn)成本;適合于大量基因的分析;簡單易用。實時熒光定量PCR:實時熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴增過程中,通過熒光信號,對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA(或cDNA)拷貝數(shù)較敏感、較準確的方法。細胞定量PCR

細胞定量PCR,Real-timePCR技術(shù)服務

所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,之后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標記探針的運用使在一密閉的反應管中能實時地監(jiān)測反應全過程。這兩個發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應的儀器和試劑的商品化發(fā)展導致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運用。寧波微量熒光定量PCR技術(shù)服務Real-time PCR反是一項利用DNA雙鏈復制的原理。

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內(nèi)標在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復實驗,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標,則PCR反應變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標。也正是這個原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標,但仍然只是一種半定量的方法。

PCR的反應條件:dNTP濃度過高會加快反應速度,但同時還可以增加堿基的錯誤摻入率。引物濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯配和非特異性產(chǎn)物擴增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯誤率達2*E-4個核苷酸,一個30個循環(huán)的擴增反應0.1%-0.25%總錯誤率。在90~95度下可使整個基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。所謂實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應體系中加入熒光基團。

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Real-time PCR原理:Real-time PCR主要指在PCR反應體系中加入熒光物質(zhì),然后通過熒光化學物質(zhì)監(jiān)測每次PCR反應循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,之后通過內(nèi)參法或外參法對待測樣品中的特定DNA序列(目的基因)進行定量分析的方法。實驗過程中,這些熒光物質(zhì)可以在激發(fā)光的作用下釋放出一定波長的發(fā)射光,定量用PCR儀通過對這些發(fā)射光進行實時監(jiān)測,較終可以描繪出整個PCR的反應過程,這就是Real-time PCR的原理。Real-time PCR鏈式反應:DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,加入設計引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活。聚合酶鏈式反應的引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。溫州組織Real-time PCR網(wǎng)站

PCR反應的關(guān)鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。細胞定量PCR

Real-time PCR鏈式反應的特點:靈敏度高:PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位);在細菌學中很小檢出率為3個細菌。簡便、快速:PCR反應用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應液加好后,即在DNA擴增液和水浴鍋上進行變性-退火-延伸反應,一般在2~4小時完成擴增反應。擴增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板。可直接用臨床標本如血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等DNA擴增檢測。武漢微量Real-time PCR供應商聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。細胞定量PCR

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